КПНБ1 - KPNB1 - Wikipedia

«IPOB» перенаправляется сюда. О сепаратистской группе Биафры см. Коренные жители Биафры.

КПНБ1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1F59, 1IBR, 1М5Н, 1O6O, 1O6P, 1QGK, 1QGR, 2P8Q, 2Q5D, 2QNA, 3LWW, 3W5K
Идентификаторы
Псевдонимы	КПНБ1, IMB1, IPO1, IPOB, Impnb, NTF97, субъединица кариоферина бета 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602738 MGI: 107532 ГомолоГен: 1707 Генные карты: КПНБ1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.32 Начинать 47,649,476 бп[1] Конец 47,685,505 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 Д Начинать 97,159,714 бп[2] Конец 97,187,881 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание с белком Hsp90 • специфическое связывание белкового домена • связывание ионов цинка • Ran связывание GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • связывание с последовательностью ядерной локализации • связывание ферментов • Связывание РНК • связывание с белками семейства импортин-альфа Сотовый компонент • не мембрана • мембрана • ядерная периферия • ядерная пора • сеть канальцев эндоплазматического ретикулума • нуклеоплазма • внеклеточная экзосома • ядро клетки • ядерная оболочка • внеклеточная область • цитоплазма • цитозоль • специфический просвет гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 • клетка-хозяин • Гранула стресса • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • апоптотическая фрагментация ДНК • Трансдукция сигнала от белка • установление локализации белка • сборка митотического веретена • транспорт белка • конгресс митотической метафазной пластинки • внутриклеточный транспорт белка • организация астральных микротрубочек • движение митотической хромосомы к полюсу веретена • установление локализации митотического веретена • Импорт NLS-несущего белка в ядро • модуляция вирусом хост-процесса • импорт белка в ядро • импорт рибосомального белка в ядро • GO: 0022415 вирусный процесс • дегрануляция нейтрофилов • регуляция процесса биосинтеза холестерина • транспорт Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3837	16211
Ансамбль	ENSG00000108424	ENSMUSG00000001440
UniProt	Q14974	P70168
RefSeq (мРНК)	NM_002265 NM_001276453	NM_008379
RefSeq (белок)	NP_001263382 NP_002256	NP_032405
Расположение (UCSC)	Chr 17: 47.65 - 47.69 Мб	Chr 11: 97.16 - 97.19 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Импортин субъединица бета-1 это белок что у людей кодируется КПНБ1 ген.^[5][6]

Функция

Нуклеоцитоплазматический транспорт, процесс, зависящий от сигнала и энергии, происходит через комплексы ядерных пор, встроенных в ядерную оболочку. Импорт белков, содержащих классический сигнал ядерной локализации (NLS) требует рецептора импорта NLS, гетеродимера альфа- и бета-субъединиц импортина. Каждый из этих субъединиц является частью кариоферин семейство белков. Импортин альфа связывает NLS-содержащий груз в цитоплазма и importin beta стыкуется с комплексом на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор. В присутствии нуклеозидтрифосфатов и небольшого GTP-связывающего белка Ran комплекс перемещается в комплекс ядерных пор и субъединицы импортина диссоциируют. Импортин альфа входит в нуклеоплазма с его белком-пассажиром и бета-импортином остается в поре. Взаимодействия между importin beta и FG-повторами нуклеопоринов важны для транслокации через поровый комплекс. Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства importin beta.^[7]

Взаимодействия

KPNB1 был показан взаимодействовать с:

• KPNA3,^[8][9]
• Кариоферин альфа 1,^[8][10]
• Кариоферин альфа 2,^[8][11][12]
• Матери против декапентаплегического гомолога 3,^[13]
• NUP153^[14][15][16]
• NUP50,^[17]
• NUP98,^[18][19]
• Нуклеопорин 62,^[10][14]
• P53,^[20]
• Белок, связанный с паратироидным гормоном,^[21][22]
• РАНБП1,^[23][24]
• РАНБП2,^[14][23][25]
• Ран (биология),^[10][24][26] и
• SMN1.^[27]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108424 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001440 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чи NC, Адам EJ, Адам С.А. (август 1995 г.). «Последовательность и характеристика фактора импорта цитоплазматического ядерного белка p97». J. Cell Biol. 130 (2): 265–74. Дои:10.1083 / jcb.130.2.265. ЧВК  2199936. PMID  7615630.
6. Гёрлих Д., Костка С., Крафт Р., Дингуолл С., Ласки Р.А., Хартманн Э., Прен С. (сентябрь 1995 г.). «Две разные субъединицы importin сотрудничают, чтобы распознавать сигналы ядерной локализации и связывать их с ядерной оболочкой». Curr. Биол. 5 (4): 383–92. Дои:10.1016 / S0960-9822 (95) 00079-0. HDL:11858 / 00-001M-0000-002D-1CBD-2. PMID  7627554. S2CID  6055941.
7. «Ген Entrez: KPNB1 кариоферин (импортин) бета 1».
8. Köhler M, Speck C, Christiansen M, Bischoff FR, Prehn S, Haller H, Görlich D, Hartmann E (ноябрь 1999 г.). «Доказательства различных субстратных специфичностей членов семейства импортина альфа в импорте ядерного белка». Мол. Клетка. Биол. 19 (11): 7782–91. Дои:10.1128 / mcb.19.11.7782. ЧВК  84838. PMID  10523667.
9. Начуры М.В., Райдер Ю.В., Ламонд А.И., Вайс К. (январь 1998 г.). «Клонирование и характеристика hSRP1 гамма, тканеспецифического фактора ядерного транспорта». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (2): 582–7. Дои:10.1073 / пнас.95.2.582. ЧВК  18463. PMID  9435235.
10. Percipalle P, Кларксон WD, Кент HM, Rhodes D, Stewart M (март 1997). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол. 266 (4): 722–32. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0801. PMID  9102465.
11. Нагоши Э., Йонеда Й. (апрель 2001 г.). «Димеризация белка 2, связывающего регуляторный элемент стерола, через домен спираль-петля-спираль-лейциновая застежка-молния является предпосылкой для его ядерной локализации, опосредованной импортином бета». Мол. Клетка. Биол. 21 (8): 2779–89. Дои:10.1128 / MCB.21.8.2779-2789.2001. ЧВК  86908. PMID  11283257.
12. Ульман К.С., Пауэрс М.А., Forbes DJ (сентябрь 1997 г.). «Ядерные рецепторы экспорта: от импортина к экспортину». Клетка. 90 (6): 967–70. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80361-x. PMID  9323123. S2CID  577884.
13. Сяо З, Лю Х, Лодиш Х.Ф. (август 2000 г.). «Импортин бета опосредует ядерную транслокацию Smad 3». J. Biol. Chem. 275 (31): 23425–8. Дои:10.1074 / jbc.C000345200. PMID  10846168.
14. Бен-Эфраим I, Джерас Л. (январь 2001 г.). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта». J. Cell Biol. 152 (2): 411–7. Дои:10.1083 / jcb.152.2.411. ЧВК  2199621. PMID  11266456.
15. Накельный С., Шейх С., Берк Б., Дрейфус Г. (апрель 1999 г.). «Nup153 представляет собой M9-содержащий мобильный нуклеопорин с новым Ran-связывающим доменом». EMBO J. 18 (7): 1982–95. Дои:10.1093 / emboj / 18.7.1982. ЧВК  1171283. PMID  10202161.
16. Келенбах Р.Х., Джерас Л. (июнь 2000 г.). «Фосфорилирование ядерного транспортного механизма снижает импорт ядерного белка in vitro». J. Biol. Chem. 275 (23): 17848–56. Дои:10.1074 / jbc.M001455200. PMID  10749866.
17. Линдси М.Э., Плафкер К., Смит А.Е., Клерман Б.Е., Макара И.Г. (август 2002 г.). «Npap60 / Nup50 - это тристабильный переключатель, который стимулирует импорт ядерного белка, опосредованный импортин-альфа: бета». Клетка. 110 (3): 349–60. Дои:10.1016 / с0092-8674 (02) 00836-х. PMID  12176322. S2CID  15515037.
18. Морояну Дж., Блобель Дж., Раду А. (сентябрь 1997 г.). «RanGTP-опосредованный ядерный экспорт кариоферина альфа включает его взаимодействие с нуклеопорином Nup153». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (18): 9699–704. Дои:10.1073 / пнас.94.18.9699. ЧВК  23253. PMID  9275187.
19. Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (май 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (10): 5055–60. Дои:10.1073 / пнас.94.10.5055. ЧВК  24630. PMID  9144189.
20. Акакура С., Йошида М., Йонеда Ю., Хориноути С. (май 2001 г.). «Роль Hsc70 в регуляции ядерно-цитоплазматического транспорта чувствительного к температуре p53 (p53Val-135)». J. Biol. Chem. 276 (18): 14649–57. Дои:10.1074 / jbc.M100200200. PMID  11297531.
21. Cingolani G, Bednenko J, Gillespie MT, Gerace L (декабрь 2002 г.). «Молекулярная основа для распознавания неклассического сигнала ядерной локализации импортином бета». Мол. Клетка. 10 (6): 1345–53. Дои:10.1016 / с1097-2765 (02) 00727-х. PMID  12504010.
22. Лам М.Х., Ху В., Сяо С.Ю., Гиллеспи М.Т., Янс Д.А. (март 2001 г.). «Молекулярное рассечение узнаваемого импортином бета1 сигнала ядерного нацеливания белка, связанного с паратироидным гормоном». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 282 (2): 629–34. Дои:10.1006 / bbrc.2001.4607. PMID  11401507.
23. Ясин Н.Р., Блобель Г. (сентябрь 1999 г.). «Гидролиз GTP связывает инициацию и прекращение ядерного импорта на нуклеопорине nup358». J. Biol. Chem. 274 (37): 26493–502. Дои:10.1074 / jbc.274.37.26493. PMID  10473610.
24. Плафкер К., Макара И.Г. (май 2000 г.). «Облегчение ядерно-цитоплазматического перемещения Ran-связывающего белка RanBP1». Мол. Клетка. Биол. 20 (10): 3510–21. Дои:10.1128 / mcb.20.10.3510-3521.2000. ЧВК  85643. PMID  10779340.
25. Дельфин С., Гуан Т., Мельхиор Ф, Джерас Л. (декабрь 1997 г.). «RanGTP нацелен на p97 на RanBP2, нитчатый белок, локализованный на цитоплазматической периферии комплекса ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 8 (12): 2379–90. Дои:10.1091 / mbc.8.12.2379. ЧВК  25714. PMID  9398662.
26. Кутай У., Изаурральде Э., Бишофф Ф. Р., Маттай И. В., Гёрлих Д. (март 1997 г.). «Доминантно-отрицательные мутанты импортина-бета блокируют множественные пути импорта и экспорта через комплекс ядерных пор». EMBO J. 16 (6): 1153–63. Дои:10.1093 / emboj / 16.6.1153. ЧВК  1169714. PMID  9135132.
27. Нараянан У., Оспина Дж.К., Фрей М.Р., Хеберт М.Д., Матера АГ (июль 2002 г.). «SMN, белок спинальной мышечной атрофии, образует предимпортный комплекс snRNP со снурпортином1 и импортином бета». Гм. Мол. Genet. 11 (15): 1785–95. Дои:10.1093 / hmg / 11.15.1785. ЧВК  1630493. PMID  12095920.

дальнейшее чтение

• Букринский М.И., Хаффар О.К. (1997). «Ядерный импорт ВИЧ-1: в поисках лидера». Передний. Biosci. 2 (4): d578–87. Дои:10.2741 / A213. PMID  9366553.
• Букринский М.И., Хаффар О.К. (1998). «Ядерный импорт ВИЧ-1: матричный белок снова в центре внимания, на этот раз вместе с Vpr». Мол. Med. 4 (3): 138–43. Дои:10.1007 / BF03401911. ЧВК  2230352. PMID  9562972.
• Кристоф Д., Кристоф-Хобертус С., Пишон Б. (2000). «Ядерное нацеливание белков: сколько разных сигналов?». Клетка. Сигнал. 12 (5): 337–41. Дои:10.1016 / S0898-6568 (00) 00077-2. PMID  10822175.
• Чук Ю.М., Блобель Г. (2001). «Кариоферины и ядерный импорт». Curr. Мнение. Struct. Биол. 11 (6): 703–15. Дои:10.1016 / S0959-440X (01) 00264-0. PMID  11751052.
• Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействиях хозяин-патоген». Cell Res. 15 (11–12): 923–34. Дои:10.1038 / sj.cr.7290370. PMID  16354571.
• Букринский М.И., Шарова Н., Демпси М.П., ​​Стэнвик Т.Л., Букринская А.Г., Хаггерти С., Стивенсон М. (1992). «Активный ядерный импорт преинтеграционных комплексов вируса иммунодефицита человека 1 типа». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (14): 6580–4. Дои:10.1073 / пнас.89.14.6580. ЧВК  49545. PMID  1631159.
• Букринский М.И., Хаггерти С., Демпси М.П., ​​Шарова Н., Аджубель А., Шпиц Л., Льюис П., Гольдфарб Д., Эмерман М., Стивенсон М. (1993). «Сигнал ядерной локализации в матричном белке ВИЧ-1, который управляет инфекцией неделящихся клеток». Природа. 365 (6447): 666–9. Дои:10.1038 / 365666a0. PMID  8105392. S2CID  25678.
• Лаунсбери К.М., Ричардс С.А., Перлунгер Р.Р., Макара И.Г. (1996). «Связывающие домены Ran способствуют взаимодействию Ran с p97 / бета-кариоферином, связывая этапы стыковки и транслокации ядерного импорта». J. Biol. Chem. 271 (5): 2357–60. Дои:10.1074 / jbc.271.5.2357. PMID  8576188.
• Гёрлих Д., Хенкляйн П., Ласки Р.А., Хартманн Э. (1996). «Мотив из 41 аминокислоты в импортине-альфа обеспечивает связывание с импортином-бета и, следовательно, транзит в ядро». EMBO J. 15 (8): 1810–7. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00530.x. ЧВК  450097. PMID  8617226.
• Вайс К., Райдер У., Ламонд А.И. (1996). «Консервативный аминоконцевой домен hSRP1 альфа необходим для импорта ядерного белка». EMBO J. 15 (8): 1818–25. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00531.x. ЧВК  450098. PMID  8617227.
• Морояну Дж., Блобель Дж., Раду А. (1996). «Импорт ядерного белка: Ran-GTP диссоциирует гетеродимер кариоферина алфавита, смещая альфа из перекрывающегося сайта связывания на бета». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (14): 7059–62. Дои:10.1073 / пнас.93.14.7059. ЧВК  38935. PMID  8692944.
• Герлих Д., Панте Н., Кутай Ю., Эби Ю., Бишофф Ф. Р. (1996). «Идентификация различных ролей RanGDP и RanGTP в импорте ядерного белка». EMBO J. 15 (20): 5584–94. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00943.x. ЧВК  452303. PMID  8896452.
• Чи NC, Адам EJ, Адам С.А. (1997). «Различные связывающие домены для Ran-GTP и Ran-GDP / RanBP1 на ядерном импортном факторе p97». J. Biol. Chem. 272 (10): 6818–22. Дои:10.1074 / jbc.272.10.6818. PMID  9045717.
• Percipalle P, Кларксон WD, Кент HM, Rhodes D, Stewart M (1997). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол. 266 (4): 722–32. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0801. PMID  9102465.
• Кутай У., Изаурральде Э., Бишофф Ф.Р., Маттай И.В., Гёрлих Д. (1997). «Доминантно-отрицательные мутанты импортина-бета блокируют множественные пути импорта и экспорта через комплекс ядерных пор». EMBO J. 16 (6): 1153–63. Дои:10.1093 / emboj / 16.6.1153. ЧВК  1169714. PMID  9135132.
• Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (1997). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (10): 5055–60. Дои:10.1073 / пнас.94.10.5055. ЧВК  24630. PMID  9144189.
• Герлих Д., Домбровски М., Бишофф Ф.Р., Кутай Ю., Борк П., Хартманн Э., Прен С., Изаурральде Э. (1997). «Новый класс белков, связывающих RanGTP». J. Cell Biol. 138 (1): 65–80. Дои:10.1083 / jcb.138.1.65. ЧВК  2139951. PMID  9214382.
• Тиганис Т, Флинт А.Дж., Адам С.А., Тонкс Н.К. (1997). «Ассоциация Т-клеточного протеина тирозинфосфатазы с ядерным импортным фактором p97». J. Biol. Chem. 272 (34): 21548–57. Дои:10.1074 / jbc.272.34.21548. PMID  9261175.