РАНБП1 - RANBP1

РАНБП1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1К5Д, 1К5Г
Идентификаторы
Псевдонимы	РАНБП1, HTF9A, RAN-связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601180 MGI: 96269 ГомолоГен: 21600 Генные карты: РАНБП1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q11.21 Начните 20,115,938 бп[1] Конец 20,127,355 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • Ran связывание GTPase • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • Активность ингибитора GDP-диссоциации • GO: 0001948 связывание с белками • связывание кадгерина Сотовый компонент • цитоплазма • ядерная оболочка • ядро клетки • центросома • цитозоль • ядерная пора Биологический процесс • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • внутриклеточный транспорт • GO: 0022415 вирусный процесс • преобразование сигнала • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • GO: 0048552 регуляция каталитической активности • импорт белка в ядро • GO: 0043146 организация шпинделя • положительная регуляция разделения митотических центросом • Экспорт РНК из ядра • G1 / S переход митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5902	19385
Ансамбль	ENSG00000099901	ENSMUSG00000005732
UniProt	P43487	P34022
RefSeq (мРНК)	NM_001278639 NM_001278640 NM_001278641 NM_002882	NM_011239
RefSeq (белок)	NP_001265568 NP_001265569 NP_001265570 NP_002873	NP_035369
Расположение (UCSC)	Chr 22: 20.12 - 20.13 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ран-специфический связывающий белок 1 является фермент что у людей кодируется РАНБП1 ген.^[4][5][6]

Ран / TC4-связывающий белок, RanBP1, специфически взаимодействует с GTP -заряженный РАН. RANBP1 кодирует белок массой 23 кДа, который связывается с RAN в комплексе с GTP, но не ВВП. RANBP1 не активируется GTPase активность RAN, но заметно увеличивает гидролиз GTP белком, активирующим RanGTPase (RANGAP1 ). РАНБП1 кДНК кодирует белок из 201 аминокислоты, который на 92% похож на его гомолог мыши. Как в клетках млекопитающих, так и в дрожжах RANBP1 действует как негативный регулятор RCC1 путем ингибирования RCC1-стимулированного высвобождения гуаниновых нуклеотидов из RAN.^[6]

Взаимодействия

RANBP1 был показан взаимодействовать с участием XPO1,^[7][8] КПНБ1^[8][9] и Ран.^[8][10][11]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000099901 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Хаяси Н., Йокояма Н., Секи Т., Адзума Ю., Охба Т., Нишимото Т. (август 1995 г.). «RanBP1, Ras-подобный ядерный белок G, связывающийся с Ran / TC4, ингибирует RCC1 через Ran / TC4». Мол Джен Генет. 247 (6): 661–9. Дои:10.1007 / BF00290397. PMID  7616957.
5. Келенбах Р.Х., Дикманнс А., Келенбах А., Гуан Т., Джерас Л. (июль 1999 г.). «Роль RanBP1 в высвобождении CRM1 из ядерного порового комплекса на заключительном этапе ядерного экспорта». J Cell Biol. 145 (4): 645–57. Дои:10.1083 / jcb.145.4.645. ЧВК  2133185. PMID  10330396.
6. «Ген Entrez: RANBP1 RAN-связывающий белок 1».
7. Сингх, Б. Б.; Patel H H; Roepman R; Schick D; Феррейра П.А. (декабрь 1999 г.). «Кластерный домен цинкового пальца RanBP2 является специфическим местом стыковки ядерного фактора экспорта, экспортина-1». J. Biol. Chem. 274 (52): 37370–8. Дои:10.1074 / jbc.274.52.37370. ISSN  0021-9258. PMID  10601307.
8. Плафкер, К; Macara I G (май 2000 г.). «Облегчение нуклеоцитоплазматического челночного переноса Ran-связывающего белка RanBP1». Мол. Cell. Биол. 20 (10): 3510–21. Дои:10.1128 / MCB.20.10.3510-3521.2000. ISSN  0270-7306. ЧВК  85643. PMID  10779340.
9. Yaseen, NR; Блобель Г (сентябрь 1999 г.). «Гидролиз GTP связывает инициацию и прекращение ядерного импорта на нуклеопорине nup358». J. Biol. Chem. 274 (37): 26493–502. Дои:10.1074 / jbc.274.37.26493. ISSN  0021-9258. PMID  10473610.
10. Рен, М; Villamarin A; Ши А; Coutavas E; Мур М. С; LoCurcio M; Кларк V; Оппенгейм Дж. Д; D'Eustachio P; Rush M G (апрель 1995 г.). «Отдельные домены Ran GTPase взаимодействуют с различными факторами, регулируя импорт ядерного белка и процессинг РНК». Мол. Cell. Биол. 15 (4): 2117–24. Дои:10.1128 / MCB.15.4.2117. ISSN  0270-7306. ЧВК  230439. PMID  7891706.
11. Steggerda, S M; Пасхальный Б. М. (июль 2000 г.). «Белок Mog1 млекопитающих является фактором высвобождения гуаниновых нуклеотидов для Ran». J. Biol. Chem. 275 (30): 23175–80. Дои:10.1074 / jbc.C000252200. ISSN  0021-9258. PMID  10811801.

дальнейшее чтение

• Бишофф Ф.Р., Креббер Х., Смирнова Э. и др. (1995). «Совместная активация RanGTPase и ингибирование диссоциации GTP с помощью Ran-GTP-связывающего белка RanBP1». EMBO J. 14 (4): 705–15. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07049.x. ЧВК  398135. PMID  7882974.
• Рен М., Вилламарин А., Ши А. и др. (1995). «Отдельные домены Ran GTPase взаимодействуют с различными факторами, регулируя импорт ядерного белка и процессинг РНК». Мол. Cell. Биол. 15 (4): 2117–24. Дои:10.1128 / MCB.15.4.2117. ЧВК  230439. PMID  7891706.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Кутавас Э., Рен М., Оппенгейм Д. Д. и др. (1994). «Характеристика белков, которые взаимодействуют с регуляторным белком клеточного цикла Ran / TC4». Природа. 366 (6455): 585–7. Bibcode:1993Натура.366..585C. Дои:10.1038 / 366585a0. PMID  8255297.
• Золотухин А.С., Фельбер Б.К. (1997). «Мутации в сигнале ядерного экспорта человеческого ран-связывающего белка RanBP1 блокируют опосредованную Rev посттранскрипционную регуляцию вируса иммунодефицита человека типа 1». J. Biol. Chem. 272 (17): 11356–60. Дои:10.1074 / jbc.272.17.11356. PMID  9111043.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Плафкер К., Макара И.Г. (2000). «Облегчение нуклеоцитоплазматического челночного переноса Ran-связывающего белка RanBP1». Мол. Cell. Биол. 20 (10): 3510–21. Дои:10.1128 / MCB.20.10.3510-3521.2000. ЧВК  85643. PMID  10779340.
• Стеггерда С.М., Паскаль Б.М. (2000). «Белок Mog1 млекопитающих является фактором высвобождения гуаниновых нуклеотидов для Ran». J. Biol. Chem. 275 (30): 23175–80. Дои:10.1074 / jbc.C000252200. PMID  10811801.
• Maynard TM, Haskell GT, Bhasin N и др. (2002). «RanBP1, ген-кандидат велокардиофациального синдрома / синдрома Ди Джорджи, экспрессируется на участках мезенхимальной / эпителиальной индукции». Мех. Dev. 111 (1–2): 177–80. Дои:10.1016 / S0925-4773 (01) 00616-5. PMID  11804793.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ди Фьоре Б., Чичарелло М., Мангиакасале Р. и др. (2004). «RanBP1 млекопитающих регулирует сцепление центросом во время митоза». J. Cell Sci. 116 (Pt 16): 3399–411. Дои:10.1242 / jcs.00624. PMID  12840069.
• Зеевальд М.Дж., Кремер А., Фаркасовский М. и др. (2003). «Биохимическая характеристика системы Ran-RanBP1-RanGAP: необходимы ли белки RanBP и кислотный хвост RanGAP для реакции Ran-RanGAP GTPase?». Мол. Cell. Биол. 23 (22): 8124–36. Дои:10.1128 / MCB.23.22.8124-8136.2003. ЧВК  262373. PMID  14585972.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Болсон СС, Чжан М., Ортиз С.Е., Теннер А.Дж. (2005). «CD93 взаимодействует с адаптерным белком, содержащим PDZ-домен, GIPC: влияние на модуляцию фагоцитоза». J. Leukoc. Биол. 77 (1): 80–9. Дои:10.1189 / jlb.0504305. PMID  15459234.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А. и др. (2005). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геном Биол. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК  545604. PMID  15461802.
• Брунель А., Лабас В., Майлу А. и др. (2006). «Протеомика эндотелиальных клеток пупочной вены человека применительно к апоптозу, вызванному этопозидом». Протеомика. 5 (15): 3876–84. Дои:10.1002 / pmic.200401239. PMID  16130169.
• Такеда Э, Хиеда М, Катахира Дж, Йонеда Й (2006). «Фосфорилирование RanGAP1 стабилизирует его взаимодействие с Ran и RanBP1». Сотовая структура. Funct. 30 (2): 69–80. Дои:10.1247 / csf.30.69. PMID  16428860.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.