XPO1 - XPO1

XPO1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1W9C, 2L1L, 3GB8, 4BSM, 4БСН, 5DIS
Идентификаторы
Псевдонимы	XPO1, CRM1, emb, exp1, экспорт в 1, CRM-1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602559 MGI: 2144013 ГомолоГен: 2554 Генные карты: XPO1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п15 Начинать 61,477,849 бп[1] Конец 61,538,626 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A3.2 Начинать 23,256,041 бп[2] Конец 23,298,249 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • специфическое связывание белкового домена • транспортная деятельность • Ran связывание GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры • активность рецептора ядерного экспортного сигнала Сотовый компонент • цитоплазма • Тело Кахала • не мембрана • мембрана • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • ядерная оболочка • нуклеоплазма • кольцевидные ламели • ядро клетки • кинетохора • ядрышко • цитозоль • клетка-хозяин • макромолекулярный комплекс • рибонуклеопротеин • внутриклеточный Биологический процесс • экспорт малой субъединицы рибосомы из ядра • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • регуляция удвоения центросом • транспорт мРНК • регуляция стабильности мРНК • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • экспорт белка из ядра • регуляция белкового катаболического процесса • локализация белка в ядре • транспорт белка • экспорт большой субъединицы рибосомы из ядра • внутриклеточный транспорт белка • GO: 0022415 вирусный процесс • ответ на наркотик • сцепление сестринских хроматид • экспорт рибосомальной субъединицы из ядра • регулирование экспорта белка из ядра • биогенез рибосом • транспорт • ядерно-цитоплазматический транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7514	103573
Ансамбль	ENSG00000082898	ENSMUSG00000020290
UniProt	O14980	Q6P5F9
RefSeq (мРНК)	NM_003400	NM_001035226 NM_134014
RefSeq (белок)	NP_003391	NP_001030303 NP_598775
Расположение (UCSC)	Chr 2: 61,48 - 61,54 Мб	Chr 11: 23.26 - 23.3 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Экспорт 1 (XPO1), также известный как поддержание хромосомной области 1 (CRM1), представляет собой эукариотический белок, который обеспечивает ядерный экспорт различных белков и РНК.

История

XPO1 (CRM1) первоначально был идентифицирован в делящихся дрожжах. Schizosaccharomyces pombe в генетическом скрининге, и исследователи определили, что он участвует в контроле структуры хромосом.^[5] Позже было показано, что это ядерный транспорт рецептор для грузов с богатыми лейцином сигналами ядерного экспорта (РЭШ ).^[6][7][8][9] Структурные детали взаимодействия XPO1 с его грузами были выявлены через два десятилетия после идентификации гена.^{[10][11][12][13]}

Функция

XPO1 опосредует NES-зависимый транспорт белка. Он экспортирует несколько сотен различных белков из ядра.^[14][15] XPO1 участвует в ядерном экспорте рибосомных субъединиц.^[16][17][18] XPO1 играет роль в экспорте различных РНК, включая U-мяРНК, рРНК (как часть рибосомных субъединиц) и некоторые мРНК.^[19][20][21]

Медицинское значение

XPO1 участвует в различных вирусных инфекциях. Например, это требуется для ядерного экспорта ВИЧ-1 РНК в комплексе с вирусным белком Rev, событие, которое является важной частью цикла заражения.^[22] XPO1 затронут в некоторых рак типы ^[23] и поэтому рассматривается как цель для разработки противораковых препаратов.^[24] Селинексор, препарат, специально нацеленный на XPO1, был одобрен FDA для лечения множественной миеломы.^[25]

Взаимодействия

XPO1 был показан взаимодействовать с:

• APC,^[26]
• CDKN1B,^[27][28]
• CIITA,^[29][30]
• NMD3,^[31]
• Нуклеопорин 62,^[32][33]
• РАНБП1,^[34][35]
• РАНБП3,^[32][36]
• Ран,^[26][34][37]
• SMARCB1,^[38] и
• p53.^[39][40]

Смотрите также

• Кариоферин
• Импортин
• Ядерный транспорт
• Сигнал ядерного экспорта

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000082898 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020290 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Adachi, Y .; Янагида, М. (1989-04-01). «На структуру хромосом высшего порядка влияют чувствительные к холоду мутации в гене crm1 + Schizosaccharomyces pombe, который кодирует белок 115 кДа, преимущественно локализованный в ядре и на его периферии». Журнал клеточной биологии. 108 (4): 1195–1207. Дои:10.1083 / jcb.108.4.1195. ISSN  0021-9525.
6. Fornerod, M .; Оно, М .; Yoshida, M .; Маттай, И. В. (19 сентября 1997 г.). «CRM1 является рецептором экспорта для сигналов ядерного экспорта, богатых лейцином». Клетка. 90 (6): 1051–1060. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80371-2. ISSN  0092-8674. PMID  9323133.
7. Fukuda, M .; Asano, S .; Накамура, Т .; Adachi, M .; Yoshida, M .; Янагида, М .; Нисида, Э. (1997-11-20). «CRM1 отвечает за внутриклеточный транспорт, опосредованный сигналом ядерного экспорта». Природа. 390 (6657): 308–311. Дои:10.1038/36894. ISSN  0028-0836. PMID  9384386.
8. Стаде, К .; Ford, C. S .; Guthrie, C .; Вейс, К. (19 сентября 1997 г.). «Экспортин 1 (Crm1p) является важным фактором ядерного экспорта». Клетка. 90 (6): 1041–1050. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80370-0. ISSN  0092-8674. PMID  9323132.
9. Оссаре-Назари, Б .; Bachelerie, F .; Дарджемонт, К. (1997-10-03). «Доказательства роли CRM1 в сигнальном экспорте ядерного белка». Наука. 278 (5335): 141–144. Дои:10.1126 / science.278.5335.141. ISSN  0036-8075. PMID  9311922.
10. Монеке, Томас; Гюттлер, Томас; Нойман, Петр; Дикманнс, Ахим; Герлих, Дирк; Фичнер, Ральф (22 мая 2009 г.). «Кристаллическая структура ядерного экспортного рецептора CRM1 в комплексе с Snurportin1 и RanGTP». Наука. 324 (5930): 1087–1091. Дои:10.1126 / science.1173388. ISSN  1095-9203. PMID  19389996.
11. Дун, Сюхуа; Бисвас, Аниндита; Süel, Katherine E .; Джексон, Лори К .; Мартинес, Рита; Гу, Хунмэй; Чук, Ю Мин (30 апреля 2009). «Структурная основа распознавания богатого лейцином ядерного экспортного сигнала с помощью CRM1». Природа. 458 (7242): 1136–1141. Дои:10.1038 / природа07975. ISSN  1476-4687. ЧВК  3437623. PMID  19339969.
12. Дун, Сюхуа; Бисвас, Аниндита; Чук, Ю Мин (май 2009 г.). «Структурные основы сборки и разборки экспортного ядерного комплекса CRM1». Структурная и молекулярная биология природы. 16 (5): 558–560. Дои:10.1038 / nsmb.1586. ISSN  1545-9985. ЧВК  3437629. PMID  19339972.
13. Гюттлер, Томас; Мадл, Тобиас; Нойман, Петр; Дейксель, Данило; Корсини, Лоренцо; Монеке, Томас; Фичнер, Ральф; Саттлер, Майкл; Герлих, Дирк (ноябрь 2010 г.). «Консенсус NES переопределяется структурами сигналов ядерного экспорта типа PKI и Rev, связанных с CRM1». Структурная и молекулярная биология природы. 17 (11): 1367–1376. Дои:10.1038 / нсмб.1931. ISSN  1545-9985. PMID  20972448.
14. Такар, Кетан; Карача, Самир; Порт, Сара А .; Урлауб, Хеннинг; Келенбах, Ральф Х. (март 2013 г.). «Идентификация CRM1-зависимых экспортных ядерных грузов с помощью количественной масс-спектрометрии». Молекулярная и клеточная протеомика. 12 (3): 664–678. Дои:10.1074 / mcp.M112.024877. ISSN  1535-9484. ЧВК  3591659. PMID  23242554.
15. Кырлы, Корай; Караджа, Самир; Дене, Хайнц Юрген; Самвер, Матиас; Пан, Куан Тинг; Ленц, Кристоф; Урлауб, Хеннинг; Герлих, Дирк (17 декабря 2015 г.). «Глубокая протеомическая перспектива на CRM1-опосредованный ядерный экспорт и нуклеоцитоплазматическое разделение». eLife. 4. Дои:10.7554 / eLife.11466. ISSN  2050-084X. ЧВК  4764573. PMID  26673895.
16. Moy, T. I .; Сильвер, П. А. (1999-08-15). «Ядерный экспорт малой субъединицы рибосомы требует цикла ран-ГТФазы и определенных нуклеопоринов». Гены и развитие. 13 (16): 2118–2133. Дои:10.1101 / gad.13.16.2118. ISSN  0890-9369. ЧВК  316945. PMID  10465789.
17. Ho, J. H .; Kallstrom, G .; Джонсон, А. В. (2000-11-27). «Nmd3p представляет собой Crm1p-зависимый адаптерный белок для ядерного экспорта большой рибосомной субъединицы». Журнал клеточной биологии. 151 (5): 1057–1066. Дои:10.1083 / jcb.151.5.1057. ISSN  0021-9525. ЧВК  2174350. PMID  11086007.
18. Земп, Иво; Уайлд, Томас; О'Донохью, Мари-Франсуаза; Уандри, Франциска; Видманн, Барбара; Глез, Пьер-Эммануэль; Кутай, Ульрике (29.06.2009). «Четкие этапы созревания цитоплазмы предшественников 40S рибосомных субъединиц требуют hRio2». Журнал клеточной биологии. 185 (7): 1167–1180. Дои:10.1083 / jcb.200904048. ISSN  1540-8140. ЧВК  2712965. PMID  19564402.
19. Каллен Б. Р. (июнь 2000 г.). «Пути экспорта ядерной РНК». Молекулярная и клеточная биология. 20 (12): 4181–4187. Дои:10.1128 / mcb.20.12.4181-4187.2000. ISSN  0270-7306. ЧВК  85787. PMID  10825183.
20. Кёлер, Алвин; Больно, Эд (октябрь 2007 г.). «Экспорт РНК из ядра в цитоплазму». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 8 (10): 761–773. Дои:10.1038 / nrm2255. ISSN  1471-0080.
21. «Нуклеоцитоплазматический транспорт РНК и РНК-белковых комплексов». Журнал молекулярной биологии. 428 (10): 2040–2059. 2016-05-22. Дои:10.1016 / j.jmb.2015.09.023. ISSN  0022-2836.
22. Бут, Дэвид С; Чэн, Ифань; Франкель, Алан Д. (2014-12-08). Сандквист, Уэсли I (ред.). «Рецептор экспорта Crm1 образует димер, способствующий ядерному экспорту РНК ВИЧ». eLife. 3: e04121. Дои:10.7554 / eLife.04121. ISSN  2050-084X.
23. Тейлор, Джастин; Сендино, Мария; Горелик, Александр Н .; Пасторе, Алессандро; Чанг, Мэтью Т .; Пенсон, Александр В .; Гаврила, Елена И .; Стюарт, Коннор; Мельник, Элла М .; Эррехон Чавес, Флорисела; Битнер, Лилиан (октябрь 2019 г.). «Признание измененного ядерного экспортного сигнала как фактор онкогенеза». Открытие рака. 9 (10): 1452–1467. Дои:10.1158 / 2159-8290.CD-19-0298. ISSN  2159-8290. ЧВК  6774834. PMID  31285298.
24. Фунг, Хо Йи Джойс; Чук, Ю Мин (август 2014). «Атомарная основа распознавания, выпуска и запрета CRM1-груза». Семинары по биологии рака. 27: 52–61. Дои:10.1016 / j.semcancer.2014.03.002. ISSN  1096-3650. ЧВК  4108548. PMID  24631835.
25. Исследования, Центр оценки лекарственных средств и (2019-12-20). «FDA ускоряет одобрение селинексора для лечения множественной миеломы». FDA.
26. Тикенброк Л., Крамер Дж., Веттер И. Р., Мюллер О. (август 2002 г.). «Область спиральной спирали (аминокислоты 129-250) белка-супрессора опухолей аденоматозного полипоза кишечной палочки (APC). Его структура и его взаимодействие с областью поддержания хромосомы 1 (Crm-1)». J. Biol. Chem. 277 (35): 32332–8. Дои:10.1074 / jbc.M203990200. PMID  12070164.
27. Исида Н., Хара Т., Камура Т., Йошида М., Накаяма К., Накаяма К.И. (апрель 2002 г.). «Фосфорилирование p27Kip1 по серину 10 необходимо для его связывания с CRM1 и ядерного экспорта». J. Biol. Chem. 277 (17): 14355–8. Дои:10.1074 / jbc.C100762200. PMID  11889117.
28. Коннор М.К., Котчетков Р., Кариу С., Реш А., Лупетти Р., Бенистон Р.Г., Мельхиор Ф., Хенгст Л., Слингерланд Дж. М. (январь 2003 г.). «CRM1 / Ran-опосредованный ядерный экспорт p27 (Kip1) включает сигнал ядерного экспорта и связывает экспорт и протеолиз p27». Мол. Биол. Клетка. 14 (1): 201–13. Дои:10.1091 / mbc.E02-06-0319. ЧВК  140238. PMID  12529437.
29. Раваль А., Вайсман Дж. Д., Хоукрофт Т. К., Певец Д. С. (январь 2003 г.). «GTP-связывающий домен трансактиватора класса II регулирует его ядерный экспорт». J. Immunol. 170 (2): 922–30. Дои:10.4049 / jimmunol.170.2.922. PMID  12517958.
30. Вонг Л.Н., Слейтер А.Р., Кратовац С., Крессман Д.Е. (апрель 2008 г.). «Митоген-активированная протеинкиназа ERK1 / 2 регулирует трансактиватор класса II». J. Biol. Chem. 283 (14): 9031–9. Дои:10.1074 / jbc.M706487200. ЧВК  2431044. PMID  18245089.
31. Томас Ф, Кутай У (июнь 2003 г.). «Биогенез и ядерный экспорт рибосомных субъединиц у высших эукариот зависят от пути экспорта CRM1». J. Cell Sci. 116 (Pt 12): 2409–19. Дои:10.1242 / jcs.00464. PMID  12724356.
32. Линдси М.Э., Холаска Дж. М., Велч К., Паскаль Б. М., Макара И. Г. (июнь 2001 г.). «Ran-связывающий белок 3 является кофактором для Crm1-опосредованного экспорта ядерного белка». J. Cell Biol. 153 (7): 1391–402. Дои:10.1083 / jcb.153.7.1391. ЧВК  2150735. PMID  11425870.
33. Келенбах Р., Дикманнс А., Келенбах А., Гуан Т., Джерас Л. (май 1999 г.). «Роль RanBP1 в высвобождении CRM1 из комплекса ядерных пор на заключительном этапе ядерного экспорта». J. Cell Biol. 145 (4): 645–57. Дои:10.1083 / jcb.145.4.645. ЧВК  2133185. PMID  10330396.
34. Плафкер К., Макара И.Г. (май 2000 г.). «Облегчение ядерно-цитоплазматического перемещения Ran-связывающего белка RanBP1». Мол. Клетка. Биол. 20 (10): 3510–21. Дои:10.1128 / mcb.20.10.3510-3521.2000. ЧВК  85643. PMID  10779340.
35. Сингх ББ, Пател Х.Х., Роепман Р., Шик Д., Феррейра, Пенсильвания (декабрь 1999 г.). «Кластерный домен цинкового пальца RanBP2 является специфическим местом стыковки ядерного фактора экспорта, экспортина-1». J. Biol. Chem. 274 (52): 37370–8. Дои:10.1074 / jbc.274.52.37370. PMID  10601307.
36. Линдси М.Э., Плафкер К., Смит А.Е., Клерман Б.Е., Макара И.Г. (август 2002 г.). «Npap60 / Nup50 - это тристабильный переключатель, который стимулирует импорт ядерного белка, опосредованный импортин-альфа: бета». Клетка. 110 (3): 349–60. Дои:10.1016 / с0092-8674 (02) 00836-х. PMID  12176322. S2CID  15515037.
37. Форнерод М., Оно М., Йошида М., Маттай И.В. (сентябрь 1997 г.). «CRM1 - это рецептор экспорта для сигналов ядерного экспорта, богатых лейцином». Клетка. 90 (6): 1051–60. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80371-2. PMID  9323133. S2CID  15119502.
38. Крейг Э., Чжан З.К., Дэвис К.П., Калпана Г.В. (январь 2002 г.). «Замаскированный NES в INI1 / hSNF5 опосредует hCRM1-зависимый ядерный экспорт: последствия для туморогенеза». EMBO J. 21 (1–2): 31–42. Дои:10.1093 / emboj / 21.1.31. ЧВК  125819. PMID  11782423.
39. Канаи М., Ханаширо К., Ким С.Х., Ханай С., Буларес А.Х., Мива М., Фукасава К. (сентябрь 2007 г.). «Ингибирование взаимодействия Crm1-p53 и ядерного экспорта p53 с помощью поли (АДФ-рибозилирования)». Nat. Cell Biol. 9 (10): 1175–83. Дои:10.1038 / ncb1638. PMID  17891139. S2CID  13433567.
40. Шао Ц., Лу Ц., Чен Л., Коты П. П., Кобос Э., Гао В. (август 2010 г.). «p53-зависимые противоопухолевые эффекты лептомицина B на аденокарциному легкого». Рак-химиотерапия. Pharmacol. 67 (6): 1369–80. Дои:10.1007 / s00280-010-1434-6. PMID  20803015. S2CID  27127578.

дальнейшее чтение

• Герлих Д., Кутай Ю. (1999). «Транспорт между ядром клетки и цитоплазмой». Анну. Rev. Cell Dev. Биол. 15 (1): 607–60. Дои:10.1146 / annurev.cellbio.15.1.607. PMID  10611974.
• Будху А.С., Ван XW (2007). «Загрузка и разгрузка: управление дупликацией центросомы и сборка веретена с помощью Ran / Crm1». Клеточный цикл. 4 (11): 1510–4. Дои:10.4161 / cc.4.11.2187. ЧВК  1402358. PMID  16294017.
• Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействиях хозяин-патоген». Cell Res. 15 (11–12): 923–34. Дои:10.1038 / sj.cr.7290370. PMID  16354571.
• Штаубер Р.Х., Манн В., Кнауэр СК (2007). «Ядерный и цитоплазматический сурвивин: молекулярный механизм, прогноз и терапевтический потенциал». Рак Res. 67 (13): 5999–6002. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-0494. PMID  17616652.
• Мэтью С., Гильдьял Р. (2017). «Ингибиторы CRM1 для противовирусной терапии». Границы микробиологии. 8: 1171. Дои:10.3389 / fmicb.2017.01171. ЧВК  5487384. PMID  28702009.

внешняя ссылка

• Структуры CRM1 для трехмерной электронной микроскопии из EM Data Bank (EMDB)