Ku70 - Ku70

XRCC6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1JEQ, 1ДЖЕЙ, 1JJR, 3RZX, %% s1JEQ, 1ДЖЕЙ
Идентификаторы
Псевдонимы	XRCC6, Репарация с помощью рентгеновских лучей, дополняющая дефектную репарацию в клетках китайского хомячка 6, CTC75, CTCBF, G22P1, KU70, ML8, TLAA, перекрестное восстановление с помощью рентгена 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 152690 MGI: 95606 ГомолоГен: 37483 Генные карты: XRCC6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q13.2 Начинать 41,621,119 бп[1] Конец 41,664,048 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 E1 | 15 38,33 см Начинать 81,987,835 бп[2] Конец 82,040,085 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • связывание двухцепочечной теломерной ДНК • связывание теломерной ДНК • GO: 0008026 геликазная активность • 5'-дезоксирибозо-5-фосфатлиазная активность • GO: 0004003 ДНК-геликазная активность • связывание с С-концом белка • каталитическая активность • GO: 0001948 связывание с белками • лиазная активность • гидролазная активность • Связывание АТФ • Связывание ДНК • связывание двухцепочечной ДНК • повреждение связывания ДНК • Связывание РНК • связывание циклина • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • цитозоль • комплекс ядерных теломер • мембрана • комплекс регуляторов транскрипции • хромосома • нуклеоплазма • комплекс негомологичного соединения концов • ядро клетки • ядерная хромосома, теломерная область • Ку70: Комплекс Ку80 • цитоплазма • внеклеточная область • просвет секреторной гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 • белок-ДНК комплекс • ядрышко • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • восстановление двухниточного разрыва путем классического негомологичного соединения концов • гетеротетрамеризация белков • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регулирование пролиферации гладкомышечных клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Лигирование ДНК • установление интегрированной провирусной задержки • метаболизм • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • восстановление двухцепочечного разрыва за счет негомологичного соединения концов • поддержание теломер • положительное регулирование выработки интерферона I типа • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Раскрутка дуплекса ДНК • Ремонт ДНК • клеточная гиперосмотическая реакция солености • развитие мозга • Рекомбинация ДНК • дегрануляция нейтрофилов • клеточный ответ на гамма-излучение • клеточный ответ на рентген • положительная регуляция активности протеинкиназы • активация врожденного иммунного ответа • иммунная система • врожденная иммунная система Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2547	14375
Ансамбль	ENSG00000196419	ENSMUSG00000022471
UniProt	P12956	P23475
RefSeq (мРНК)	NM_001469 NM_001288976 NM_001288977 NM_001288978	NM_010247
RefSeq (белок)	NP_001275905 NP_001275906 NP_001275907 NP_001460 NP_001275905.1 NP_001460.1	NP_034377
Расположение (UCSC)	Chr 22: 41.62 - 41.66 Мб	Chr 15: 81.99 - 82.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ku70 это белок что у людей кодируется XRCC6 ген.^[5][6]

Функция

Вместе Ku70 и Ku80 составить Ку гетеродимер, который привязан к ДНК двухниточный разрыв заканчивается и требуется для негомологичное соединение концов (NHEJ) путь Ремонт ДНК. Это также необходимо для V (D) J рекомбинация, который использует путь NHEJ для обеспечения разнообразия антигенов у млекопитающих. иммунная система.

Помимо своей роли в NHEJ, Ku также необходим для поддержания длины теломер и подавления субтеломерного гена.^[7]

Ку был первоначально идентифицирован, когда пациенты с системная красная волчанка было обнаружено, что у них высокий уровень аутоантител к белку.^[5]

Старение

Эмбриональные стволовые клетки мыши с гомозиготными мутациями Ku70, то есть Ku70^−/− клетки, имеют заметно повышенную чувствительность к ионизирующему излучению по сравнению с гетерозиготным Ku70^+/− или Ku70 дикого типа^+/+ эмбриональные стволовые клетки.^[8] Мутантные мыши с дефицитом Ku70 демонстрируют раннее старение.^[9] Используя несколько конкретных критериев старения, у мутантных мышей были обнаружены те же признаки старения, что и у контрольных мышей, но в значительно более раннем хронологическом возрасте. Эти результаты предполагают, что снижение способности восстанавливать двухцепочечные разрывы ДНК вызывает преждевременное старение и что ген Ku70 дикого типа играет важную роль в обеспечении долголетия.^[10] (Также см Теория повреждений ДНК старения.)

Клинический

Мутация в этом гене была описана в группе из 24 семей с аутизм.^[11] Хотя это наводит на мысль, что этот ген может играть роль в развитии аутизма, необходимы дальнейшие исследования.

Номенклатура

Ku70 упоминается под несколькими именами, включая:

• Аутоантигенный белок р70 волчанки Ku
• АТФ-зависимая ДНК-геликаза 2 субъединица 1
• Восстановление с помощью рентгеновских лучей в дополнение к восстановлению дефектов в клетках китайского хомячка 6
• Рентгеноремонтный кросс-комплемент 6 (XRCC6)

Взаимодействия

Ku70 был показан взаимодействовать с:

• CBX5,^[12]
• ЧЕК1,^[13]
• CREBBP,^[14]
• GCN5L2,^[14]
• HOXC4,^[15]
• Ku80,^{[14][16][17][18][19]}
• MRE11A,^[20]
• NCOA6,^[21][22]
• NCF4,^[23]
• PCNA,^[24][25]
• PTTG1,^[26]
• RPA2,^[27]
• TERF2,^[19]
• TERT^[28]
• VAV1,^[29] и
• WRN.^[30][31]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196419 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022471 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: восстановление XRCC6 с помощью рентгеновских лучей, дополняющее дефектное восстановление в клетках китайского хомячка 6 (аутоантиген Ku, 70 кДа)».
6. Pace P, Mosedale G, Hodskinson MR, Rosado IV, Sivasubramaniam M, Патель К.Дж. (Июль 2010 г.). «Ku70 нарушает репарацию ДНК в отсутствие пути анемии Фанкони». Наука. 329 (5988): 219–23. Дои:10.1126 / science.1192277. PMID  20538911.
7. Boulton SJ, Jackson SP (март 1998 г.). «Компоненты Ku-зависимого негомологичного пути соединения концов участвуют в поддержании длины теломера и сайленсинге теломеров». Журнал EMBO. 17 (6): 1819–28. Дои:10.1093 / emboj / 17.6.1819. ЧВК  1170529. PMID  9501103.
8. Гу И, Джин С., Гао И, Уивер Д. Т., Альт FW (июль 1997 г.). «Ku70-дефицитные эмбриональные стволовые клетки обладают повышенной ионизирующей радиочувствительностью, дефектной активностью связывания концов ДНК и неспособностью поддерживать рекомбинацию V (D) J». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (15): 8076–81. Дои:10.1073 / пнас.94.15.8076. ЧВК  21559. PMID  9223317.
9. Ли Х, Фогель Х, Холкомб В. Б., Гу И, Хэсти П. (декабрь 2007 г.). «Удаление Ku70, Ku80 или обоих вызывает раннее старение без существенного увеличения рака». Молекулярная и клеточная биология. 27 (23): 8205–14. Дои:10.1128 / MCB.00785-07. ЧВК  2169178. PMID  17875923.
10. Бернштейн Х, Пейн CM, Бернштейн С, Гарвал Х, Дворак К. (2008). Рак и старение как последствия неремонтированного повреждения ДНК. В: Новое исследование повреждений ДНК (редакторы: Хонока Кимура и Аой Судзуки) Nova Science Publishers, Inc., Нью-Йорк, Глава 1, стр. 1–47. открытый доступ, но только чтение https://www.novapublishers.com/catalog/product_info.php?products_id=43247 В архиве 2014-10-25 на Wayback Machine ISBN  978-1604565812
11. Sjaarda CP, Wood S, McNaughton AJ, Taylor S, Hudson ML, Liu X, Guerin A, Ayub M (декабрь 2019 г.). «Секвенирование экзома идентифицирует вариант сплайсинга de novo в XRCC6 в спорадических случаях аутизма». Журнал генетики человека. Дои:10.1038 / с10038-019-0707-0. PMID  31827253.
12. Song K, Jung Y, Jung D, Lee I (март 2001 г.). «Ku70 человека взаимодействует с гетерохроматиновым белком 1альфа». Журнал биологической химии. 276 (11): 8321–7. Дои:10.1074 / jbc.M008779200. PMID  11112778.
13. Goudelock DM, Jiang K, Pereira E, Russell B, Sanchez Y (август 2003 г.). «Регуляторные взаимодействия между киназой контрольной точки Chk1 и белками ДНК-зависимого протеинкиназного комплекса». Журнал биологической химии. 278 (32): 29940–7. Дои:10.1074 / jbc.M301765200. PMID  12756247.
14. Барлев Н.А., Полторацкий В., Оуэн-Хьюз Т., Ин Си, Лю Л., Уоркман Дж. Л., Бергер С.Л. (март 1998 г.). «Подавление активности гистонацетилтрансферазы GCN5 через связывание бромодомена и фосфорилирование Ku-ДНК-зависимым протеинкиназным комплексом». Молекулярная и клеточная биология. 18 (3): 1349–58. Дои:10.1128 / mcb.18.3.1349. ЧВК  108848. PMID  9488450.
15. Шильд-Поултер С., Поуп Л., Гиффин В., Кочан Дж. К., Нгзее Дж. К., Трайкова-Андонова М., Хаче Р. Дж. (Май 2001 г.). «Связывание Ku-антигена с гомеодоменными белками способствует их фосфорилированию ДНК-зависимой протеинкиназой». Журнал биологической химии. 276 (20): 16848–56. Дои:10.1074 / jbc.M100768200. PMID  11279128.
16. Гелл Д., Джексон С.П. (сентябрь 1999 г.). «Картирование белок-белковых взаимодействий внутри ДНК-зависимого протеинкиназного комплекса». Исследования нуклеиновых кислот. 27 (17): 3494–502. Дои:10.1093 / nar / 27.17.3494. ЧВК  148593. PMID  10446239.
17. Ян Ч.Р., Йе С., Лесков К., Одегаард Э., Сюй Х.Л., Чанг С., Кинселла Т.Дж., Чен Д.Д., Бутман Д.А. (май 1999 г.). «Выделение Ku70-связывающих белков (KUBs)». Исследования нуклеиновых кислот. 27 (10): 2165–74. Дои:10.1093 / nar / 27.10.2165. ЧВК  148436. PMID  10219089.
18. Синглтон Б.К., Торрес-Арзаюс М.И., Rottinghaus ST, Taccioli GE, Jeggo PA (май 1999 г.). «С-конец Ku80 активирует каталитическую субъединицу ДНК-зависимой протеинкиназы» (PDF). Молекулярная и клеточная биология. 19 (5): 3267–77. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3267. ЧВК  84121. PMID  10207052.
19. Song K, Jung D, Jung Y, Lee SG, Lee I (сентябрь 2000 г.). «Взаимодействие Ku70 человека с TRF2». Письма FEBS. 481 (1): 81–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01958-X. PMID  10984620.
20. Годеке В., Эйпе М., Оффенберг Х. Х., ван Алдерен М., Гейтинг К. (октябрь 1999 г.). «Mre11 и Ku70 взаимодействуют в соматических клетках, но по-разному экспрессируются в раннем мейозе». Природа Генетика. 23 (2): 194–8. Дои:10.1038/13821. PMID  10508516.
21. Ко Л., Кардона Г. Р., Чин В. В. (май 2000 г.). «Белок, связывающий рецептор тироидного гормона, белок, содержащий мотив LXXLL, функционирует как общий коактиватор». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (11): 6212–7. Дои:10.1073 / пнас.97.11.6212. ЧВК  18584. PMID  10823961.
22. Ко Л, Чин WW (март 2003 г.). «Коактиватор ядерного рецептора, рецептор-связывающий белок тироидного гормона (TRBP), взаимодействует с ассоциированной с ним ДНК-зависимой протеинкиназой и стимулирует его». Журнал биологической химии. 278 (13): 11471–9. Дои:10.1074 / jbc.M209723200. PMID  12519782.
23. Гранво Н., Гризо С., Винье П.В., Дагер М.С. (февраль 1999 г.). «Аутоантиген Ku70 взаимодействует с p40phox в B-лимфоцитах». Журнал клеточной науки. 112 (4): 503–13. PMID  9914162.
24. Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового связывающего PCNA белка». Журнал биологической химии. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID  12171929.
25. Balajee AS, Geard CR (март 2001 г.). «Образование связанного с хроматином комплекса PCNA, вызванное повреждением ДНК, происходит независимо от продукта гена ATM в клетках человека». Исследования нуклеиновых кислот. 29 (6): 1341–51. Дои:10.1093 / nar / 29.6.1341. ЧВК  29758. PMID  11239001.
26. Ромеро Ф., Мултон М.С., Рамос-Моралес Ф., Домингес А., Берналь Дж. А., Пинтор-Торо Х.А., Тортолеро М. (март 2001 г.). «Секурин человека, hPTTG, связан с гетеродимером Ku, регуляторной субъединицей ДНК-зависимой протеинкиназы». Исследования нуклеиновых кислот. 29 (6): 1300–7. Дои:10.1093 / nar / 29.6.1300. ЧВК  29753. PMID  11238996.
27. Шао Р.Г., Цао С.Х., Чжан Х., Кон К.В., Уолд М.С., Помье Й. (март 1999 г.). «Опосредованное репликацией повреждение ДНК камптотецином вызывает фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA: ДНК-PK». Журнал EMBO. 18 (5): 1397–406. Дои:10.1093 / emboj / 18.5.1397. ЧВК  1171229. PMID  10064605.
28. Чай В., Форд Л. П., Ленерц Л., Райт В. Е., Шей Дж. В. (декабрь 2002 г.). «Человеческий Ku70 / 80 физически связывается с теломеразой через взаимодействие с hTERT». Журнал биологической химии. 277 (49): 47242–7. Дои:10.1074 / jbc.M208542200. PMID  12377759.
29. Ромеро Ф., Даргемонт С., Позо Ф., Ривз У.Х., Камонис Дж., Гиссельбрехт С., Фишер С. (январь 1996 г.). «p95vav ассоциирует с ядерным белком Ku-70». Молекулярная и клеточная биология. 16 (1): 37–44. Дои:10.1128 / mcb.16.1.37. ЧВК  230976. PMID  8524317.
30. Кармакар П., Сноуден С.М., Рамсден Д.А., Бор В.А. (август 2002 г.). «Гетеродимер Ku связывается с обоими концами белка Вернера, и функциональное взаимодействие происходит на N-конце Вернера». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (16): 3583–91. Дои:10.1093 / nar / gkf482. ЧВК  134248. PMID  12177300.
31. Ли Б., Комай Л. (сентябрь 2000 г.). «Функциональное взаимодействие между Ku и белком синдрома Вернера в процессинге концов ДНК». Журнал биологической химии. 275 (37): 28349–52. Дои:10.1074 / jbc.C000289200. PMID  10880505.

дальнейшее чтение

• Smider V, Chu G (июнь 1997 г.). «Реакция присоединения концов в рекомбинации V (D) J». Семинары по иммунологии. 9 (3): 189–97. Дои:10.1006 / smim.1997.0070. PMID  9200330.
• Фезерстоун С., Джексон С.П. (май 1999 г.). «Ku, белок репарации ДНК с множеством клеточных функций?». Мутационные исследования. 434 (1): 3–15. Дои:10.1016 / s0921-8777 (99) 00006-3. PMID  10377944.
• Koike M (сентябрь 2002 г.). «Димеризация, транслокация и локализация белков Ku70 и Ku80». Журнал радиационных исследований. 43 (3): 223–36. Дои:10.1269 / jrr.43.223. PMID  12518983.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для перекрестно комплементарного белка восстановления рентгеновскими лучами человека 6