LRIG1 - LRIG1 - Wikipedia

LRIG1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыLRIG1, LIG-1, LIG1, богатые лейцином повторы и иммуноглобулин-подобные домены 1, богатые лейцином повторы и иммуноглобулин-подобные домены 1
Внешние идентификаторыOMIM: 608868 MGI: 107935 ГомолоГен: 7380 Генные карты: LRIG1
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение LRIG1
Геномное расположение LRIG1
Группа3п14.1Начинать66,378,797 бп[1]
Конец66,501,263 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE LRIG1 211596 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_015541

NM_008377
NM_001355269

RefSeq (белок)

NP_032403
NP_001342198

Расположение (UCSC)Chr 3: 66,38 - 66,5 МбChr 6: 94,6 - 94,7 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Богатые лейцином повторы и иммуноглобулин-подобные домены белок 1 это белок что у людей кодируется LRIG1 ген.[5][6][7]Он кодирует трансмембранный белок который, как было показано, взаимодействует с рецепторными тирозинкиназами Семья EGFR[8]и с ВСТРЕТИЛИСЬ[9] и RET.[10]


Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции LRIG1. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Lrig1tm1a (EUCOMM) Wtsi[20][21] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[22][23][24]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[18][25] Было проведено двадцать пять тестов на гомозиготных мутант мышей и наблюдались десять значительных аномалий, включая снижение массы тела и общего жира в организме, чешуйчатую кожу, аномальное выпадение волос, умеренную степень нарушение слуха, позвоночный спондилодез, аномальный химический состав плазмы и повышенная восприимчивость к бактериальная инфекция (с обоими Сальмонелла и Citrobacter).[18]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000144749 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030029 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Нильссон Дж., Валлбо К., Го Д., Головлева И., Халлберг Б., Хенрикссон Р., Хедман Х (июнь 2001 г.). «Клонирование, характеристика и экспрессия человеческого LIG1». Biochem Biophys Res Commun. 284 (5): 1155–61. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5092. PMID  11414704.
  6. ^ Хедман Х., Нильссон Дж., Го Д., Хенрикссон Р. (сентябрь 2002 г.). «Является ли LRIG1 геном-супрессором опухоли на хромосоме 3p14.3?». Acta Oncol. 41 (4): 352–4. Дои:10.1080/028418602760169398. PMID  12234026. S2CID  34357648.
  7. ^ «Ген Entrez: богатые лейцином повторы LRIG1 и иммуноглобулин-подобные домены 1».
  8. ^ Гур Г., Рубин С., Кац М. и др. (2005). «LRIG1 ограничивает передачу сигналов фактора роста за счет усиления убиквитилирования и деградации рецепторов». EMBO J. 23 (16): 3270–81. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600342. ЧВК  514515. PMID  15282549.
  9. ^ Шаттак Д.Л., Миллер Дж. К., Ледерих М. и др. (2007). «LRIG1 является новым отрицательным регулятором рецептора Met и противостоит синергии Met и Her2». Мол. Клетка. Биол. 27 (5): 1934–46. Дои:10.1128 / MCB.00757-06. ЧВК  1820466. PMID  17178829.
  10. ^ Ледда Ф, Биераугель О, Фард СС, Вилар М, Паратча Дж. (2008). «Lrig1 является эндогенным ингибитором активации тирозинкиназы рецептора Ret, передачи сигналов ниже по течению и биологических ответов на GDNF». J. Neurosci. 28 (2): 39–49. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.2196-07.2008. ЧВК  6671136. PMID  18171921.
  11. ^ «Данные о массе тела для Lrig1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  12. ^ «Данные дисморфологии для Lrig1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  13. ^ «Данные DEXA для Lrig1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  14. ^ «Данные рентгенографии для Lrig1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  15. ^ «Данные клинической химии для Lrig1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  16. ^ "Сальмонелла данные о заражении Lrig1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  17. ^ "Citrobacter данные о заражении Lrig1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  18. ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  19. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  20. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».[постоянная мертвая ссылка ]
  21. ^ "Информатика генома мыши".
  22. ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  23. ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  24. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  25. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение