MAPKAP1 - MAPKAP1

MAPKAP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3VOQ
Идентификаторы
Псевдонимы	MAPKAP1, JC310, MIP1, SIN1, SIN1b, SIN1g, митоген-активированный протеин-киназный протеин 1, MAPK-ассоциированный протеин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 610558 MGI: 2444554 ГомолоГен: 11473 Генные карты: MAPKAP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q33.3 Начните 125,437,393 бп[1] Конец 125,707,234 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 млрд Начните 34,406,771 бп[2] Конец 34,624,950 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание Ras GTPase • связывание фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфата • связывание фосфатидилинозитол-3,4-бисфосфата • связывание фосфатидной кислоты • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата • связывание протеинкиназы • связывание фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфата Сотовый компонент • аппарат Гольджи • мембрана • клеточная мембрана • нуклеоплазма • цитоплазматический пузырек • ядро клетки • цитозоль • Комплекс TORC2 • цитоплазма Биологический процесс • развитие черной субстанции • отрицательная регуляция передачи сигнала белка Ras • установление или поддержание полярности актинового цитоскелета • сигнальный каскад стресс-активируемой протеинкиназы • Сигнализация TORC2 • активация активности протеинкиназы B • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • регулирование клеточного ответа на окислительный стресс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	79109	227743
Ансамбль	ENSG00000119487	ENSMUSG00000038696
UniProt	Q9BPZ7	Q8BKH7
RefSeq (мРНК)	NM_001006617 NM_001006618 NM_001006619 NM_001006620 NM_001006621 NM_024117	NM_001290625 NM_001290626 NM_177345 NM_001362919 NM_001362920 NM_001362921
RefSeq (белок)	NP_001006618 NP_001006619 NP_001006620 NP_001006621 NP_001006622 NP_077022	NP_001277554 NP_001277555 NP_796319 NP_001349848 NP_001349849 NP_001349850
Расположение (UCSC)	Chr 9: 125,44 - 125,71 Мб	Chr 2: 34,41 - 34,62 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Мишень комплекса рапамицина 2 субъединица MAPKAP1 это белок что у людей кодируется MAPKAP1 ген.^[5][6] Как видно из названия, это подразделение mTOR комплекс 2.

Этот ген кодирует белок, очень похожий на дрожжи Белок SIN1, белок, активируемый стрессом киназа. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы были описаны. Альтернативный полиаденилирование сайты, а также альтернативные 3 'UTR были идентифицированы для транскриптов этого гена.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000119487 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038696 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шредер В., Клунан Н., Бушелл Г., Скалли Т. (сентябрь 2004 г.). «Альтернативное полиаденилирование и сплайсинг мРНК, транскрибируемых из гена Sin1 человека». Ген. 339: 17–23. Дои:10.1016 / j.gene.2004.07.001. PMID  15363842.
6. "Ген Entrez: MAPKAP1 митоген-активированная протеинкиназа, ассоциированный протеин 1".

дальнейшее чтение

• Количелли Дж., Николетт С., Бирчмайер С. и др. (1991). «Экспрессия трех кДНК млекопитающих, которые мешают функции RAS в Saccharomyces cerevisiae». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 88 (7): 2913–7. Дои:10.1073 / pnas.88.7.2913. ЧВК  51350. PMID  1849280.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660. S2CID  2371325.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Шредер В., Бушелл Г., Скалли Т. (2005). «Человеческий стресс-активируемый ген 1, взаимодействующий с протеинкиназой, кодирует JNK-связывающие белки». Cell. Сигнал. 17 (6): 761–7. Дои:10.1016 / j.cellsig.2004.10.015. PMID  15722200.
• Бензингер А., Мустер Н., Кох HB и др. (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, который обычно подавляется при раке». Мол. Cell. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID  15778465.
• Ченг Дж., Чжан Д., Ким К. и др. (2005). "Mip1, белок, взаимодействующий с MEKK2, контролирует димеризацию и активацию MEKK2". Мол. Cell. Биол. 25 (14): 5955–64. Дои:10.1128 / MCB.25.14.5955-5964.2005. ЧВК  1168836. PMID  15988011.
• Венейбл Дж. П., Буржуа К. Ф., Дэлглиш С. и др. (2005). «Повышающая регуляция повсеместного альтернативного фактора сплайсинга Tra2beta вызывает включение экзона, специфичного для половых клеток». Гм. Мол. Genet. 14 (16): 2289–303. Дои:10.1093 / hmg / ddi233. PMID  16000324.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Frias MA, Thoreen CC, Jaffe JD и др. (2006). «mSin1 необходим для фосфорилирования Akt / PKB, и его изоформы определяют три различных mTORC2». Curr. Биол. 16 (18): 1865–70. Дои:10.1016 / j.cub.2006.08.001. PMID  16919458. S2CID  8239162.
• Хасинто Э., Факкинетти В., Лю Д. и др. (2006). «SIN1 / MIP1 поддерживает целостность комплекса rictor-mTOR и регулирует фосфорилирование Akt и специфичность субстрата». Клетка. 127 (1): 125–37. Дои:10.1016 / j.cell.2006.08.033. PMID  16962653. S2CID  230319.
• Ян Кью, Иноки К., Икеноуэ Т., Гуань К.Л. (2006). «Идентификация Sin1 как важного компонента TORC2, необходимого для образования комплекса и киназной активности». Genes Dev. 20 (20): 2820–32. Дои:10.1101 / gad.1461206. ЧВК  1619946. PMID  17043309.
• Макино С., Сано И., Синагава Т. и др. (2007). «Sin1 связывается как с ATF-2, так и с p38 и усиливает ATF-2-зависимую транскрипцию в сигнальном пути SAPK». Гены Клетки. 11 (11): 1239–51. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2006.01016.x. PMID  17054722. S2CID  10605647.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Шредер В.А., Бак М., Клунан Н. и др. (2007). «Человеческий Sin1 содержит Ras-связывающие домены и домены гомологии плекстрина и подавляет передачу сигналов Ras». Cell. Сигнал. 19 (6): 1279–89. Дои:10.1016 / j.cellsig.2007.01.013. PMID  17303383.