MDFI - MDFI

MDFI
Идентификаторы
Псевдонимы	MDFI, Ингибитор семейства MyoD, I-MF, I-mfa
Внешние идентификаторы	OMIM: 604971 MGI: 107687 ГомолоГен: 21150 Генные карты: MDFI
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p21.1 Начинать 41,636,882 бп[1] Конец 41,654,246 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 C | 17 23,99 см Начинать 47,815,328 бп[2] Конец 47,834,691 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • связывание фактора транскрипции Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки Биологический процесс • цитоплазматическая секвестрация фактора транскрипции • морфогенез эмбриональной скелетной системы • развитие многоклеточного организма • дифференцировка гигантских клеток трофобласта • дифференциация клеток • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • спецификация дорсальной / вентральной оси • отрицательная регуляция сигнального пути Wnt • отрицательная регуляция связывания ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4188	17240
Ансамбль	ENSG00000112559	ENSMUSG00000032717
UniProt	Q99750	P70331
RefSeq (мРНК)	NM_001300804 NM_001300805 NM_001300806 NM_005586	NM_001109973 NM_001276390 NM_001276391 NM_010783
RefSeq (белок)	NP_001287733 NP_001287734 NP_001287735 NP_005577	NP_001103443 NP_001263319 NP_001263320 NP_034913
Расположение (UCSC)	Chr 6: 41,64 - 41,65 Мб	Chr 17: 47,82 - 47,83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ингибитор семейства MyoD это белок что у людей кодируется MDFI ген.^[5][6][7]

Функция

Этот белок является фактором транскрипции, который негативно регулирует другие белки миогенного семейства. Исследования гомолога мыши, I-mf, показывают, что он вмешивается в функцию миогенного фактора, маскируя сигналы ядерной локализации и предотвращая связывание ДНК. Исследования на мышах с нокаутом показывают дефекты в формировании позвонков и ребер, которые также связаны с образованием хрящей в этих структурах.^[7]

Взаимодействия

MDFI было показано взаимодействовать с:

• C9orf86,^[8]
• GNAI2,^[8]
• MyoD,^[9]
• Миогенин,^[9] и
• ШЕСТЬ1.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112559 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032717 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Kraut N (сентябрь 1997 г.). «Ген, кодирующий I-mf (Mdfi), отображается на хромосоме 6p21 человека и хромосоме 17 мыши». Геном мамм. 8 (8): 618–9. Дои:10.1007 / s003359900517. PMID  9250874. S2CID  25160364.
6. Ван Кью, Young TM, Мэтьюз МБ, Pe'ery T. (март 2007 г.). «Регуляторы развития, содержащие домен I-mfa, взаимодействуют с Т-циклинами и Tat и модулируют транскрипцию». Дж Мол Биол. 367 (3): 630–46. Дои:10.1016 / j.jmb.2007.01.020. ЧВК  1868487. PMID  17289077.
7. «Ген Entrez: ингибитор семейства MDFI MyoD».
8. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
9. Chen CM, Kraut N, Groudine M, Weintraub H (сентябрь 1996 г.). «I-mf, новый миогенный репрессор, взаимодействует с членами семьи MyoD». Клетка. 86 (5): 731–41. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80148-8. PMID  8797820. S2CID  16252710.

дальнейшее чтение

• Чен CM, Краут Н., Гроудин М, Вайнтрауб Х (1996). «I-mf, новый миогенный репрессор, взаимодействует с членами семьи MyoD». Клетка. 86 (5): 731–41. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80148-8. PMID  8797820. S2CID  16252710.
• Краут Н., Снайдер Л., Чен С.М., Тапскотт С.Дж., Гроудин М. (1999). «Необходимость гена I-mfa мыши для развития плаценты и формирования скелетного паттерна». EMBO J. 17 (21): 6276–88. Дои:10.1093 / emboj / 17.21.6276. ЧВК  1170953. PMID  9799236.
• Снайдер Л., Тирлвелл Х., Миллер-младший, Мун RT, Гроудин М., Тапскотт С.Дж. (2001). «Ингибирование связывания Tcf3 белками домена I-mfa». Мол. Клетка. Биол. 21 (5): 1866–73. Дои:10.1128 / MCB.21.5.1866-1873.2001. ЧВК  86756. PMID  11238923.
• Ма Р., Рандл Д., Джекс Дж., Кох М., Даунс Т., Циокас Л. (2004). «Ингибитор миогенного семейства, новый супрессор токов, управляемых магазином, посредством взаимодействия с TRPC1». J. Biol. Chem. 278 (52): 52763–72. Дои:10.1074 / jbc.M309610200. PMID  14530267.
• Мидзугиши К., Хатаяма М., Тохмонда Т., Огава М., Иноуэ Т., Микошиба К., Аруга Дж. (2004). «Миогенный репрессор I-mfa нарушает функцию белков семейства Zic». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 320 (1): 233–40. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.05.158. PMID  15207726.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.