Магний-протопорфирин IX монометиловый эфир (окислительная) циклаза - Magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase - Wikipedia

Магний-протопорфирин IX монометиловый эфир (окислительная) циклаза
Идентификаторы
Номер ЕС	1.14.13.81
Количество CAS	92353-62-3
Базы данных
IntEnz	Просмотр IntEnz
БРЕНДА	BRENDA запись
ExPASy	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	Запись в KEGG
MetaCyc	метаболический путь
ПРИАМ	профиль
PDB структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Поиск ЧВК статьи PubMed статьи NCBI белки

Магний-протопорфирин IX монометиловый эфир (окислительная) циклаза (ЕС 1.14.13.81 ), является фермент с систематическое название 13-монометиловый эфир магния-протопорфирин-IX, ферредоксин: оксидоредуктаза кислорода (гидроксилирование).^[1] В растениях этот фермент катализирует следующие общие химическая реакция

В хлорин кольцевая система образуется по мере того, как этерифицированная пропионатная боковая цепь циклизируется на порфириновом кольце протопорфирин IX с образованием дивинилпротохлорофиллида

магний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + 3 НАДФН + 3 H⁺ + 3 O₂ ${\displaystyle \rightleftharpoons }$ дивинилпротохлорофиллид + 3 НАДФ⁺ + 5 часов₂O (общая реакция)

Недавние доказательства^[2] показывает, что необходимые электроны, которые переводят фермент из окисленной в восстановленную форму, происходят из ферредоксин. В зеленой ткани ферредоксин может получать эти электроны непосредственно от фотосистема I так что НАДФН не нужно участвовать. Однако в темноте ферредоксин также может быть снижен за счет Ферредоксин — НАДФ (+) редуктаза, позволяя реакции продолжаться в этом случае. Поэтому более точным будет показать отдельные шаги следующим образом:

(1a) 13-монометиловый эфир магния-протопорфирин IX + 2 восстановленный ферредоксин + O₂ ${\displaystyle \rightleftharpoons }$ 13¹-гидроксимагний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + H₂О

(1b) 13¹-гидроксимагний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + 2 восстановленный ферредоксин + O₂ ${\displaystyle \rightleftharpoons }$ 13¹-оксо-магний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + 2 H₂О

(1c) 13¹-оксо-магний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + 2 восстановленный ферредоксин + O₂ ${\displaystyle \rightleftharpoons }$ дивинилпротохлорофиллид + 2 H₂О

Этот фермент требует для активности Fe (II). В ячмень белок циклазы называется XanL и кодируется Ксанта-1 ген. Связанный белок Ycf54, по-видимому, необходим для правильного созревания фермента XanL,^[2] который является частью биосинтетический путь к хлорофиллы.^[3][4][5]В анаэробные организмы Такие как Rhodobacter sphaeroides происходит такое же общее преобразование, но кислород, включенный в 13-монометиловый эфир протопорфирина IX, происходит из воды в реакции ЕС 1.21.98.3.^[6]

Смотрите также

• Биосинтез хлорофиллов

Рекомендации

1. Болливар Д.В., Бил С.И. (сентябрь 1996 г.). "Биосинтетический фермент хлорофилла Mg-протопорфирин IX монометиловый эфир (окислительная) циклаза (характеристика и частичная очистка от Chlamydomonas reinhardtii и Synechocystis sp. PCC 6803)". Физиология растений. 112 (1): 105–114. Дои:10.1104 / стр.112.1.105. ЧВК  157929. PMID  12226378.
2. Стюарт Д., Сандстрём М., Юсеф Х.М., Захрабекова С., Йенсен П.Е., Болливар Д.В., Ханссон М. (08.09.2020). "Аэробная циклаза монометилового эфира Mg-протопорфирина IX ячменя питается от ферредоксина электронами". Растения. 9 (9): 1157. Дои:10.3390 / растения9091157.
3. Willows RD (июнь 2003 г.). «Биосинтез хлорофиллов из протопорфирина IX». Отчеты о натуральных продуктах. 20 (3): 327–41. Дои:10.1039 / B110549N. PMID  12828371.
4. Болливар DW (ноябрь 2006 г.). «Последние достижения в биосинтезе хлорофилла». Фотосинтез Исследования. 90 (2): 173–94. Дои:10.1007 / s11120-006-9076-6. PMID  17370354. S2CID  23808539.
5. Танака, Рёичи; Танака, Аюми (2007). «Биосинтез тетрапирролов у высших растений». Ежегодный обзор биологии растений. 58: 321–346. Дои:10.1146 / annurev.arplant.57.032905.105448. PMID  17227226.
6. Порра, Роберт Дж .; Шафер, Вольфрам; Гад'Он, Наср; Катедер, Ингрид; Дрюс, Герхарт; Шеер, Хьюго (1996). «Происхождение двух карбонильных атомов кислорода бактериохлорофилла а. Демонстрация двух различных путей образования кольца е в Rhodobacter sphaeroides и Roseobacter denitrificans, а также общий механизм гидратазы для образования 3-ацетильной группы». Европейский журнал биохимии. 239 (1): 85–92. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0085u.x. PMID  8706723.