NACA (ген) - NACA (gene)

NACA
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3LKX, 3MCB, 3MCE
Идентификаторы
Псевдонимы	NACA, NACA1, skNAC, HSD48, NAC-альфа, альфа-субъединица комплекса, ассоциированного с растущим полипептидом, субъединица альфа-комплекса, связанного с возникающим полипептидом
Внешние идентификаторы	OMIM: 601234 MGI: 106095 ГомолоГен: 136025 Генные карты: NACA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.3 Начните 56,712,427 бп[1] Конец 56,731,628 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 D3 Начните 128,035,575 бп[2] Конец 128,048,637 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • возникающий полипептид-ассоциированный комплекс • внеклеточная экзосома Биологический процесс • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транспорт белка • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в развитии сердца • регуляция развития волокон скелетных мышц • развитие сердечного желудочка • морфогенез трабекулы сердца • положительная регуляция пролиферации клеток, участвующих в морфогенезе сердца • GO: 0022415 вирусный процесс • регенерация ткани скелетных мышц • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в развитии сердца • биосинтез белка • положительная регуляция роста ткани скелетных мышц • отрицательная регуляция процесса апоптоза поперечно-полосатых мышечных клеток • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4666	17938
Ансамбль	ENSG00000196531	ENSMUSG00000061315
UniProt	Q13765	P70670 Q60817
RefSeq (мРНК)	NM_001113201 NM_001113202 NM_001113203 NM_005594 NM_001320193 NM_001320194 NM_001365896	NM_001113199 NM_001282976 NM_013608
RefSeq (белок)	NP_001106672 NP_001106673 NP_001106674 NP_001307122 NP_001307123 NP_005585 NP_001106672 NP_001106673 NP_001106674 NP_001307122 NP_001307123 NP_005585	NP_001106670 NP_001269905 NP_038636 NP_001269905.1 NP_038636.2
Расположение (UCSC)	Chr 12: 56.71 - 56.73 Мб	Chr 10: 128.04 - 128.05 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Альфа-полипептид, связанный с растущим полипептидом, также известен как NACA, это белок который у человека кодируется NACA ген.^[5][6][7]

Функция

NACA предотвращает короткие недавно синтезированные (т.е. зарождающиеся) рибосома -ассоциированные полипептиды из-за несоответствующего взаимодействия с цитозольный белки. NACA связывает домены растущего полипептида, возникающие из рибосом, если он не содержит сигнальный пептид который полностью открыт. Истощение NACA из рибосом, несущих возникающие полипептиды, позволяет частица распознавания сигнала (SRP) для сшивки с полипептидами независимо от того, содержат они сигнальные пептиды или нет. В отсутствие NACA белки, лишенные сигнальных пептидов, могут быть ошибочно приняты.перемещенный в эндоплазматический ретикулум.^[6][8]

Белок NACA экспрессируется в кости во время развитие и действует как транскрипционный коактиватор в сочетании с кислотными активаторами.^[7]

Взаимодействия

NACA было показано взаимодействовать с участием BTF3, FADD,^[9] C-июн,^[10] и 3 члена таксилин семья.^[11]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196531 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061315 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: комплексный альфа-полипептид, ассоциированный с растущим полипептидом NACA».
6. Видманн Б., Сакаи Н., Дэвис Т.А., Видманн М. (август 1994 г.). «Белковый комплекс, необходимый для сортировки и транслокации, специфичных для сигнальной последовательности». Природа. 370 (6489): 434–40. Bibcode:1994 Натур. 370..434 Вт. Дои:10.1038 / 370434a0. PMID  8047162. S2CID  4353902.
7. Йотов В.В., Сен-Арно Р. (февраль 1996 г.). «Картирование человеческого гена коактиватора транскрипции альфа-NAC / 1.9.2 (NACA / 1.9.2) на хромосоме 12q23-24.1». Мамм. Геном. 7 (2): 163–4. Дои:10.1007 / BF03035343. PMID  8835540. S2CID  33088429. Архивировано из оригинал на 2000-09-16.
8. Rospert S, Dubaquié Y, Gautschi M (октябрь 2002 г.). «Возникающий полипептид-ассоциированный комплекс». Cell. Мол. Life Sci. 59 (10): 1632–9. Дои:10.1007 / PL00012490. PMID  12475173. S2CID  8874233.^{[постоянная мертвая ссылка ]}
9. Стило Р., Лигуоро Д., ди Йезо Б., Леонарди А., Вито П. (апрель 2003 г.). «Альфа-цепь растущего полипептид-ассоциированного комплекса связывает и регулирует функцию FADD». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 303 (4): 1034–41. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00487-X. PMID  12684039.
10. Моро А., Йотов В. В., Глорье Ф. Х., Сен-Арно Р. (март 1998 г.). «Костно-специфическая экспрессия альфа-цепи растущего полипептид-ассоциированного комплекса, коактиватора, усиливающего транскрипцию, опосредованную c-Jun». Мол. Cell. Биол. 18 (3): 1312–21. Дои:10.1128 / MCB.18.3.1312. ЧВК  108844. PMID  9488446.
11. Йошида К., Ногами С., Сато С., Танака-Накадате С., Хираиши Х., Терано А., Ширатаки Х. (май 2005 г.). «Взаимодействие семейства таксилинов с возникающим полипептид-ассоциированным комплексом, который участвует в процессах транскрипции и трансляции». Гены Клетки. 10 (5): 465–76. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2005.00848.x. PMID  15836775. S2CID  19426810.

дальнейшее чтение

• Видманн Б., Сакаи Н., Дэвис Т.А., Видманн М. (1994). «Белковый комплекс, необходимый для сортировки и транслокации, специфичных для сигнальной последовательности». Природа. 370 (6489): 434–40. Bibcode:1994 Натур. 370..434 Вт. Дои:10.1038 / 370434a0. PMID  8047162. S2CID  4353902.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Йотов В.В., Сен-Арно Р. (1996). «Картирование человеческого гена коактиватора транскрипции альфа-NAC / 1.9.2 (NACA / 1.9.2) на хромосоме 12q23-24.1». Мамм. Геном. 7 (2): 163–4. Дои:10.1007 / BF03035343. PMID  8835540. S2CID  33088429.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Йотов В.В., Моро А., Сен-Арно Р. (1998). «Альфа-цепь растущего комплекса, ассоциированного с полипептидом, действует как транскрипционный коактиватор». Мол. Cell. Биол. 18 (3): 1303–11. Дои:10.1128 / MCB.18.3.1303. ЧВК  108843. PMID  9488445.
• Моро А., Йотов В. В., Глорье Ф. Х., Сен-Арно Р. (1998). «Костно-специфическая экспрессия альфа-цепи растущего полипептид-ассоциированного комплекса, коактиватора, усиливающего транскрипцию, опосредованную c-Jun». Мол. Cell. Биол. 18 (3): 1312–21. Дои:10.1128 / MCB.18.3.1312. ЧВК  108844. PMID  9488446.
• Munz B, Wiedmann M, Lochmüller H, Werner S (1999). «Клонирование новых генов, регулируемых травмой. Значение важной роли мышечно-специфического белка skNAC в восстановлении мышц». J. Biol. Chem. 274 (19): 13305–10. Дои:10.1074 / jbc.274.19.13305. PMID  10224091.
• Беатрикс Б, Сакаи Х, Видманн М (2001). «Альфа и бета субъединицы возникающего полипептид-ассоциированного комплекса имеют разные функции». J. Biol. Chem. 275 (48): 37838–45. Дои:10.1074 / jbc.M006368200. PMID  10982809.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Симс Р.Дж., Вэйхэ Е.К., Чжу Л. и др. (2002). «m-Bop, белок-репрессор, необходимый для кардиогенеза, взаимодействует с skNAC, фактором транскрипции, специфичным для сердца и мышц». J. Biol. Chem. 277 (29): 26524–9. Дои:10.1074 / jbc.M204121200. PMID  12011100.
• Ким Ш., Шим К.С., Любец Г. (2002). «У пациентов с болезнью Альцгеймера и синдромом Дауна снижается уровень альфа-субъединицы возникающего полипептид-ассоциированного комплекса человеческого мозга». J. Investig. Med. 50 (4): 293–301. Дои:10.2310/6650.2002.33287. PMID  12109594.
• Берендс У, Джандл Т., Голбек А. и др. (2002). «Новые продукты генов HUD, HUC, NNP-1 и альфа-интернексина, идентифицированные путем скрининга аутологичных антител в детской библиотеке нейробластомы». Int. J. Рак. 100 (6): 669–77. Дои:10.1002 / ijc.10550. PMID  12209604. S2CID  35369661.
• Моссабеб Р., Зайберлер С., Миттерманн И. и др. (2002). «Характеристика новой изоформы альфа-растущего полипептид-ассоциированного комплекса как IgE-определяемого аутоантигена». J. Invest. Дерматол. 119 (4): 820–9. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2002.00518.x. PMID  12406326.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Стило Р., Лигуоро Д., ди Йезо Б. и др. (2003). «Альфа-цепь растущего комплекса, ассоциированного с полипептидом, связывается с функцией FADD и регулирует ее». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 303 (4): 1034–41. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00487-X. PMID  12684039.
• Папахристоу Д. Д., Батистату А., Сикиотис Г. П. и др. (2003). «Активация пути передачи сигнала JNK-AP-1 связана с патогенезом и прогрессированием остеосарком человека». Кость. 32 (4): 364–71. Дои:10.1016 / S8756-3282 (03) 00026-7. PMID  12689679.
• Хэммерле К., Шаян П., Нимейер С.М., Флото С. (2003). «Анализ экспрессии альфа-NAC и ANX2 при ювенильном миеломоноцитарном лейкозе с использованием полимеразной цепной реакции SMART и« виртуальной северной »гибридизации». Рак Генет. Цитогенет. 142 (2): 149–52. Дои:10.1016 / S0165-4608 (02) 00841-5. PMID  12699894.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Аль-Шанти Н., Стюард К.Г., Гарланд Р.Дж., Роуботтом А.В. (2004). «Исследование функций комплекса, ассоциированного с альфа-растущим полипептидом, на модели размножения CD8 (+) Т-клеток человека ex vivo с использованием антисмысловых олигонуклеотидов». Иммунология. 112 (3): 397–403. Дои:10.1111 / j.1365-2567.2004.01893.x. ЧВК  1782496. PMID  15196207.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Cell. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.