NDUFAB1 - NDUFAB1 - Wikipedia

NDUFAB1
Доступные конструкции
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNDUFAB1, ACP, FASN2A, SDAP, NADH: субъединица AB1 убихинон оксидоредуктазы, ACP1
Внешние идентификаторыOMIM: 603836 MGI: 4936891 ГомолоГен: 80336 Генные карты: NDUFAB1
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение NDUFAB1
Геномное расположение NDUFAB1
Группа16п12.2Начинать23,581,014 бп[1]
Конец23,596,316 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_005003

н / д

RefSeq (белок)

NP_004994

н / д

Расположение (UCSC)Chr 16: 23.58 - 23.6 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 бета подкомплекс, 5, 16 кДа это белок что у человека кодируется NDUFAB1 ген.[4] Белок NDUFAB1 является субъединицей НАДН-дегидрогеназа (убихинон), который находится в митохондриальная внутренняя мембрана и является крупнейшим из пяти комплексов электронная транспортная цепь.[5]

Структура

Ген NDUFAB1 расположен на p-плече хромосома 16 в положении 12.2 и охватывает 15 327 пар оснований.[4] Ген NDUFAB1 продуцирует белок 17,4 кДа, состоящий из 156 аминокислоты.[6][7] NDUFAB1 - субъединица фермента НАДН-дегидрогеназа (убихинон), самый крупный из респираторных комплексов. Конструкция Г-образная с длинным, гидрофобный трансмембранный домен и гидрофильный домен для периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания NADH.[5] NDUFAB1 является одной из примерно 31 гидрофобной субъединицы, которые образуют трансмембранную область Комплекса I. Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен может быть свернут в альфа-спираль охватывающий внутренний митохондриальная мембрана с C-терминал гидрофильный домен, взаимодействующий с глобулярными субъединицами Комплекса I. консервированный двухдоменная структура предполагает, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и что гидрофобный домен действует как якорь для НАДН-дегидрогеназа (убихинон) комплекс на внутренней митохондриальной мембране.[4]

Функция

Ген NDUFAB1 человека кодирует субъединицу Комплекс I из дыхательная цепь, который переносит электроны из НАДН к убихинон.[4] Однако NDUFAB1 является дополнительной субъединицей комплекса, которая, как полагают, не участвует в катализе.[8] Первоначально, НАДН связывается с комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо из флавинмононуклеотид (ФМН) протез руки с образованием ФМНГ2. Электроны передаются через серию железо-серные (Fe-S) кластеры в протезе руки и, наконец, до коэнзима Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинол (CoQH2). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и pK сдвиг ионизируемой боковой цепи, который выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса.[5]

Клиническое значение

В исследование ассоциации всего генома (GWAS) метаанализ среди европейского и афроамериканского населения, NDUFAB1 ген и два других гена (MFAP3L и PALB2 ) были идентифицированы как генетические локусы, значительно связанные с тревожные расстройства (Объявления). Поскольку коморбидность AD возникает из их общей генетической основы, эти кандидаты генетические локусы могут стать терапевтическими мишенями для лечения БА.[9] Более того, исследование по выявлению низкомолекулярный препарат цели для Тетралогия Фалло (TOF), а врожденный порок развития сердца, обнаружил NDUFAB1 ген быть основным геном-концентратором дифференциально экспрессируемых генов в TOF.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000004779 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ а б c d «Ген Entrez: NDUFAB1 NADH дегидрогеназа (убихинон) 1, альфа / бета субкомплекс, 1, 8 кДа».
  5. ^ а б c Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). «Глава 18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. С. 581–620. ISBN  978-0-470-54784-7.
  6. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йейтс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
  7. ^ "NDUFAB1 - NADH дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа / бета субъединица 1 субкомплекса". Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
  8. ^ "NDUFAB1 - NADH дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа / бета субъединица 1 субкомплекса". UniProt: центр информации о белках. Консорциум UniProt. Получено 24 марта 2015.
  9. ^ Отова Т., Махер Б.С., Агген С.Х., МакКлей Д.Л., ван ден Оорд Э.Дж., Хеттема Дж.М. (12 ноября 2014 г.). «Полногеномные и основанные на генах ассоциативные исследования тревожных расстройств в европейских и афроамериканских выборках». PLOS ONE. 9 (11): e112559. Bibcode:2014PLoSO ... 9k2559O. Дои:10.1371 / journal.pone.0112559. ЧВК  4229211. PMID  25390645.
  10. ^ Гу Q, Чен XT, Сяо Ю.Б., Чен Л., Ван XF, Фанг Дж., Чэнь BC, Хао Дж. (Июнь 2014 г.). «Идентификация по-разному экспрессируемых генов и низкомолекулярных лекарств для тетралогии Фалло с помощью биоинформатической стратегии». Детская кардиология. 35 (5): 863–9. Дои:10.1007 / s00246-014-0868-8. PMID  24463614. S2CID  24162298.