NKRF (ген) - NKRF (gene)

НКРФ
Идентификаторы
Псевдонимы	НКРФ, ITBA4, NRF, фактор репрессии NFKB
Внешние идентификаторы	OMIM: 300440 MGI: 1924536 ГомолоГен: 84816 Генные карты: НКРФ
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq24 Начинать 119,588,337 бп[1] Конец 119,606,443 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X A3.3 Начинать 36,887,540 бп[2] Конец 36,903,513 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • ядрышко • нуклеоплазма Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55922	77286
Ансамбль	ENSG00000186416	ENSMUSG00000044149
UniProt	O15226	Q8BY02
RefSeq (мРНК)	NM_001173487 NM_001173488 NM_017544	NM_029891
RefSeq (белок)	NP_060014	NP_084167
Расположение (UCSC)	Chr X: 119,59 - 119,61 Мб	Chr X: 36,89 - 36,9 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

NF-каппа-B-репрессивный фактор это белок что у людей кодируется НКРФ ген.^[5][6]

Этот ген кодирует фактор транскрипции который взаимодействует с конкретными негативные регуляторные элементы (NRE), чтобы опосредовать репрессию транскрипции определенных NK-каппа-B-чувствительных генов.

Белок располагается преимущественно в ядрышко с небольшой долей в нуклеоплазма и цитоплазма.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186416 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000044149 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нурбахш М., Хаузер Х (январь 2000 г.). «Конститутивное молчание промотора IFN-бета опосредуется NRF (фактор репрессии NF-kappaB), ядерным ингибитором NF-kappaB». EMBO J. 18 (22): 6415–25. Дои:10.1093 / emboj / 18.22.6415. ЧВК  1171704. PMID  10562553.
6. «Энтрез Ген: фактор репрессии NKRF NF-kappaB».

дальнейшее чтение

• Фраттини А., Фаранда С., Баньяско Л. и др. (1997). «Идентификация нового члена (ZNF183) семейства генов безымянного пальца в Xq24-25». Ген. 192 (2): 291–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00108-X. PMID  9224902.
• Фэн Х, Го З., Нурбахш М. и др. (2002). «Идентификация элемента отрицательного ответа в промоторе индуцибельной синтазы оксида азота (hiNOS) человека: роль репрессирующего фактора NF-каппа B (NRF) в базальной репрессии гена hiNOS». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (22): 14212–7. Дои:10.1073 / pnas.212306199. ЧВК  137863. PMID  12381793.
• Scherl A, Couté Y, Déon C и др. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Мол. Биол. Клетка. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Цзяньфэн Д., Фэн Дж., Чаонэн Дж. И др. (2004). «Клонирование правильной полноразмерной кДНК фактора репрессии NF-kappaB». Мол. Клетки. 16 (3): 397–401. PMID  14744032.
• Niedick I, Froese N, Oumard A, et al. (2005). «Ядрышковая локализация и анализ подвижности репрессирующего фактора NF-kappaB NRF». J. Cell Sci. 117 (Pt 16): 3447–58. Дои:10.1242 / jcs.01129. PMID  15226370.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Драйкхаузен У., Хибенталь-Миллоу К., Бартельс М. и др. (2005). «Фактор репрессии NF-kappaB ингибирует удлинение транскрипции вируса иммунодефицита человека типа 1 с помощью фактора, индуцирующего чувствительность к DRB». Мол. Клетка. Биол. 25 (17): 7473–83. Дои:10.1128 / MCB.25.17.7473-7483.2005. ЧВК  1190279. PMID  16107696.
• Фукуяма Р., Нг К.П., Чичек М. и др. (2007). «Роль IKK и осцилляторной кинетики NFkappaB в экспрессии гена MMP-9 и химиорезистентности к 5-фторурацилу в клетках колоректального рака RKO». Мол. Канцероген. 46 (5): 402–13. Дои:10.1002 / mc.20288. PMID  17186550.
• Reboll MR, Oumard A, Gazdag AC, et al. (2007). «Активность NRF IRES опосредуется РНК-связывающим белком JKTBP1 и 14-нуклеотидным элементом РНК». РНК. 13 (8): 1328–40. Дои:10.1261 / rna.545407. ЧВК  1924892. PMID  17592041.