NLGN1 - NLGN1

NLGN1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3B3Q
Идентификаторы
Псевдонимы	NLGN1, NL1, нейролигин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600568 MGI: 2179435 ГомолоГен: 56690 Генные карты: NLGN1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q26.31 Начните 173,396,284 бп[1] Конец 174,286,644 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 A3 Начните 25,426,215 бп[2] Конец 26,332,460 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание домена PDZ • активность димеризации белков • связывание молекул клеточной адгезии • связывание с белками каркаса • GO: 0004091 активность гидролазы сложного эфира карбоновой кислоты • связывание с белками семейства нейрексинов • связывание бета-амилоида • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • синапс • неотъемлемый компонент мембраны • NMDA селективный рецепторный комплекс глутамата • аппарат Гольджи • соединение клеток • дендритный вал • кончик филоподия • дендритный позвоночник • постсинаптическая мембрана • мембрана • дендрит • возбуждающий синапс • внешняя сторона плазматической мембраны • поверхность клетки • пресинапс • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент постсинаптической мембраны • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • перекрывающий компонент мембраны • постсинапс • глутаматергический синапс • асимметричный, глутаматергический, возбуждающий синапс • неотъемлемый компонент мембраны постсинаптической специализации Биологический процесс • Кластеризация рецепторов глутамата NMDA • положительное регулирование сборки оборок • положительная регуляция экзоцитоза синаптических везикул • регуляция активности рецептора AMPA • ритмический процесс • положительная регуляция синаптической передачи, глутаматергическая • гетерофильная клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны • положительная регуляция циркадного цикла сна / бодрствования, бодрствования • регуляция дыхательного газообмена процессами неврологической системы • кальций-зависимая клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны • гетеротетрамеризация белков • транспорт синаптических пузырьков • организация кнопки терминала • организация синапсов • положительная регуляция синаптической передачи, ГАМКергическая • кластеризация белков постсинаптической плотности 95 • локализация рецептора в синапсе • локализация белка в синапсе • кластеризация нейрексинов участвует в сборке пресинаптической мембраны • положительная регуляция эндоцитоза синаптических везикул • нацеливание на синаптические пузырьки • гомоолигомеризация белков • положительное регулирование локализации белка в синапсе • развитие проекции нейрона • нацеливание на белок • GO: 0010740 положительная регуляция передачи внутриклеточного сигнала • длительная синаптическая потенциация • развитие нервной системы • Кластеризация рецепторов глутамата AMPA • передача нейронального сигнала • кластеризация синаптических пузырьков • положительная регуляция кластеризации синаптических везикул • организация цитоскелетного матрикса в активной зоне • сборка синапсов • установление локализации белка • модуляция химической синаптической передачи • положительное регулирование сборки филоподия • клеточная адгезия • регуляция дифференцировки нейронов • клеточная адгезия нейрона • положительная регуляция развития дендритных позвонков • регуляция активности рецепторов NMDA • положительная регуляция возбуждающего постсинаптического потенциала • отрицательная регуляция морфогенеза дендритных шипов • положительная регуляция сборки синапсов • сборка возбуждающих синапсов • положительная регуляция сборки пресинаптической активной зоны • ретроградная транс-синаптическая передача сигналов посредством транс-синаптического белкового комплекса • эндоцитоз синаптических пузырьков • сборка постсинаптической мембраны • сборка пресинаптической мембраны • клеточный ответ на ион кальция • сборка постсинаптической специализации • сборка пресинапса • регулирование пресинаптической организации • адгезия синаптической мембраны • ветвление проекции нейронов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	22871	192167
Ансамбль	ENSG00000169760	ENSMUSG00000063887
UniProt	Q8N2Q7	Q99K10
RefSeq (мРНК)	NM_014932 NM_001365923 NM_001365924 NM_001365925 NM_001365926 NM_001365927 NM_001365928 NM_001365929 NM_001365930 NM_001365931 NM_001365932 NM_001365933 NM_001365934 NM_001365935 NM_001365936	NM_001163387 NM_138666 NM_001357095 NM_001357096 NM_001357097
RefSeq (белок)	NP_055747 NP_001352852 NP_001352853 NP_001352854 NP_001352855 NP_001352856 NP_001352857 NP_001352858 NP_001352859 NP_001352860 NP_001352861 NP_001352862 NP_001352863 NP_001352864 NP_001352865	NP_001156859 NP_619607 NP_001344024 NP_001344025 NP_001344026
Расположение (UCSC)	Chr 3: 173.4 - 174.29 Мб	Chr 3: 25,43 - 26,33 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нейролигин-1 это белок что у людей кодируется NLGN1 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует член нейролигин семейство белков поверхности нейрональных клеток. Нейролигин-1 действует как сайт-специфичный лиганд сплайсинга для β-нейрексинов и, как было показано, локализуется в постсинаптическом компартменте возбуждающих синапсов и участвует в формировании и ремоделировании синапсов центральной нервной системы.^[7][8]

Взаимодействия

NLGN1 был показан взаимодействовать с NRXN1^[9][10] и DLG4.^[11]

Смотрите также

• Нейрексины: NRXN1, NRXN2, NRXN3

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169760 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063887 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Филиберт Р.А., Уинфилд С.Л., Сандху Х.К., Мартин Б.М., Джиннс Э.И. (апрель 2000 г.). «Структура и экспрессия гена нейролигина-3 человека». Ген. 246 (1–2): 303–10. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00049-4. PMID  10767552.
6. Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К., Хиросава М., Охара О. (апрель 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 7 (2): 143–50. Дои:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID  10819331.
7. «Ген Энтреза: нейролигин 1 NLGN1».
8. Шайффеле П., Фан Дж., Чой Дж., Феттер Р., Серафини Т. (июнь 2000 г.). «Нейролигин, экспрессируемый в ненейрональных клетках, запускает пресинаптическое развитие в контактирующих аксонах». Клетка. 101 (6): 657–69. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80877-6. PMID  10892652. S2CID  16095623.
9. Комолетти Д., Флинн Р., Дженнингс Л.Л. и др. (Декабрь 2003 г.). «Характеристика взаимодействия рекомбинантного растворимого нейролигина-1 с нейрексином-1бета». Журнал биологической химии. 278 (50): 50497–505. Дои:10.1074 / jbc.M306803200. PMID  14522992.
10. Ихченко К., Нгуен Т., Зюдхоф ТЦ (февраль 1996 г.). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексином нескольких нейролигинов». Журнал биологической химии. 271 (5): 2676–82. Дои:10.1074 / jbc.271.5.2676. PMID  8576240.
11. Ирие М., Хата Ю., Такеучи М. и др. (Сентябрь 1997 г.). «Связывание нейролигинов с PSD-95». Наука. 277 (5331): 1511–5. Дои:10.1126 / science.277.5331.1511. PMID  9278515.

дальнейшее чтение

• Cantallops I, Cline HT (сентябрь 2000 г.). «Формирование синапсов: если он похож на утку и крякает, как утка». Текущая биология. 10 (17): R620–3. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 00663-1. PMID  10996085. S2CID  15851386.
• Ичченко К., Хата Ю., Нгуен Т. и др. (Май 1995 г.). «Нейролигин 1: сайт-специфичный лиганд сплайсинга для бета-нейрексинов». Клетка. 81 (3): 435–43. Дои:10.1016/0092-8674(95)90396-8. PMID  7736595. S2CID  15638953.
• Ихченко К., Нгуен Т., Зюдхоф ТЦ (февраль 1996 г.). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексином нескольких нейролигинов». Журнал биологической химии. 271 (5): 2676–82. Дои:10.1074 / jbc.271.5.2676. PMID  8576240.
• Ирие М., Хата Ю., Такеучи М. и др. (Сентябрь 1997 г.). «Связывание нейролигинов с PSD-95». Наука. 277 (5331): 1511–5. Дои:10.1126 / science.277.5331.1511. PMID  9278515.
• Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К. и др. (Июнь 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 6 (3): 197–205. Дои:10.1093 / днарес / 6.3.197. PMID  10470851.
• Шайффеле П., Фан Дж., Чой Дж., Феттер Р., Серафини Т. (июнь 2000 г.). «Нейролигин, экспрессируемый в ненейрональных клетках, запускает пресинаптическое развитие в контактирующих аксонах». Клетка. 101 (6): 657–69. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80877-6. PMID  10892652. S2CID  16095623.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (Декабрь 2002 г.). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Комолетти Д., Флинн Р., Дженнингс Л.Л. и др. (Декабрь 2003 г.). «Характеристика взаимодействия рекомбинантного растворимого нейролигина-1 с нейрексином-1бета». Журнал биологической химии. 278 (50): 50497–505. Дои:10.1074 / jbc.M306803200. PMID  14522992.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (Январь 2004 г.). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Природа Генетика. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (Октябрь 2004 г.). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Геномные исследования. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Чубыкин А.А., Лю X, Комолетти Д., Цигельный И., Тейлор П., Südhof TC (июнь 2005 г.). «Рассечение индукции синапсов нейролигинами: эффект мутации нейролигина, связанной с аутизмом». Журнал биологической химии. 280 (23): 22365–74. Дои:10.1074 / jbc.M410723200. PMID  15797875.
• Музный Д.М., Шерер С.Е., Кауль Р. и др. (Апрель 2006 г.). «Последовательность ДНК, аннотация и анализ хромосомы 3 человека». Природа. 440 (7088): 1194–8. Дои:10.1038 / природа04728. PMID  16641997.
• Ли Х, Чжан Дж, Цао З, Ву Дж, Ши И (сентябрь 2006 г.). «Структура раствора домена GOPC PDZ и его взаимодействие с С-концевым мотивом нейролигина». Белковая наука. 15 (9): 2149–58. Дои:10.1110 / пс. 062087506. ЧВК  2242614. PMID  16882988.