NRXN1 - NRXN1

NRXN1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3B3Q
Идентификаторы
Псевдонимы	NRXN1, Hs.22998, PTHSL2, SCZD17, нейрексин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600565 MGI: 1096391 ГомолоГен: 21005 Генные карты: NRXN1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п16.3 Начните 49,918,503 бп[1] Конец 51,225,575 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 E5 Начните 90,033,631 бп[2] Конец 91,093,071 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • кальций-зависимое связывание с белками • связывание с белками семейства нейролигинов • рецепторное связывание • активность трансмембранного сигнального рецептора • связывание молекул клеточной адгезии • GO: 0001948 связывание с белками • связывание с рецептором фактора роста фибробластов 1 типа • связывание ионов кальция • связывание рецептора ацетилхолина • активность регулятора кальциевых каналов • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • везикул • не мембрана • мембрана • эндоцитарный пузырек • конус роста аксонов • синапс • поверхность клетки • соединение клеток • тело нейрональной клетки • эндоплазматический ретикулум • пресинаптическая мембрана • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны • пресинапс • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • ядрышко • макромолекулярный комплекс • Коллатераль Шаффера - синапс CA1 • глутаматергический синапс • ГАМК-ергический синапс • неотъемлемый компонент мембраны пресинаптической активной зоны Биологический процесс • кальций-зависимая клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны • локализация рецептора в синапсе • гетерофильная клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны • Кластеризация рецепторов глутамата NMDA • установление локализации белка • клеточная адгезия нейрона • кластеризация рецепторов гамма-аминомасляной кислоты • передача нейронального сигнала • кластеризация гефирина участвует в сборке постсинаптической плотности • кластеризация белков постсинаптической плотности 95 • обучение • регуляция активности рецептора AMPA • отрицательная регуляция сборки филоподия • сборка пресинаптической мембраны • регуляция активности рецепторов NMDA • вокализационное поведение • кластеризация нейролигинов, участвующих в сборке постсинаптической мембраны • поведение взрослых • положительная регуляция синаптической передачи, глутаматергическая • сборка постсинаптической мембраны • клеточная адгезия • ангиогенез • положительная регуляция возбуждающего постсинаптического потенциала • поведение социального организма • кластеризация белков, связанных с гуанилаткиназой • сборка синапсов • сборка белкового комплекса, участвующего в созревании синапсов • кластеризация синаптических пузырьков • локализация белка в синапсе • преобразование сигнала • дифференцировка гранулярных клеток мозжечка • положительная регуляция сборки синапсов • положительная регуляция сборки пресинаптической активной зоны • положительное регулирование локализации белка в плазматической мембране • положительная регуляция экспрессии генов • отрицательная регуляция экспрессии генов • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы А • развитие проекции нейрона • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • положительная регуляция сигнального пути рецептора фактора роста фибробластов • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • клеточный ответ на ион кальция • положительная регуляция активности протеинкиназы C • вокальное обучение • химическая синаптическая передача • регуляция секреции инсулина, участвующая в клеточном ответе на стимул глюкозы • управление аксоном • предымпульсное торможение • нервно-мышечный процесс, контролирующий баланс • положительная регуляция созревания синапсов • GO: 0010554 секреция нейротрансмиттера • регулирование груминга • адгезия синаптической мембраны • регуляция цикла синаптических везикул • регулирование сборки постсинаптической специализации • регулирование сборки пресинапса • регуляция постсинаптической плотности сборки • транс-синаптическая передача сигналов эндоканнабиноидами Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9378	18189
Ансамбль	ENSG00000179915	ENSMUSG00000024109
UniProt	P58400 Q9ULB1 Q49A31	P0DI97 Q9CS84
RefSeq (мРНК)	NM_001135659 NM_004801 NM_138735 NM_001320156 NM_001320157 NM_001330077 NM_001330078 NM_001330079 NM_001330081 NM_001330082 NM_001330083 NM_001330084 NM_001330085 NM_001330086 NM_001330087 NM_001330088 NM_001330089 NM_001330090 NM_001330091 NM_001330092 NM_001330093 NM_001330094 NM_001330095 NM_001330096 NM_001330097	NM_020252 NM_177284 NM_001346957 NM_001346958 NM_001346959 NM_001346960 NM_001346961 NM_001346962 NM_001347419
RefSeq (белок)	NP_001129131 NP_001307085 NP_001307086 NP_001317006 NP_001317007 NP_001317008 NP_001317010 NP_001317011 NP_001317012 NP_001317013 NP_001317014 NP_001317015 NP_001317016 NP_001317017 NP_001317018 NP_001317019 NP_001317020 NP_001317021 NP_001317022 NP_001317023 NP_001317024 NP_001317025 NP_001317026 NP_004792 NP_620072 NP_001129131.1 NP_004792.1 NP_620072.1 NP_004792.1 NP_004792.1 NP_620072.1	NP_001333886 NP_001333887 NP_001333888 NP_001333889 NP_001333890 NP_001333891 NP_001334348 NP_064648 NP_796258 NP_064648.3 NP_796258.2
Расположение (UCSC)	Chr 2: 49.92 - 51.23 Мб	Chr 17: 90.03 - 91.09 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нейрексин-1-альфа это белок что у людей кодируется NRXN1 ген.^[5]

Нейрексины представляют собой семейство белков, которые функционируют в нервной системе позвоночных как молекулы клеточной адгезии и рецепторы. Они кодируются несколькими несвязанными генами, два из которых, NRXN1 и NRXN3, являются одними из крупнейших известных генов человека. Три гена (NRXN1-3) используют два альтернативных промотора и включают множество альтернативно сплайсированных экзонов для генерации тысяч различных транскриптов мРНК и изоформ белков. Большинство транскриптов продуцируются вышестоящим промотором и кодируют изоформы альфа-нейрексина; гораздо меньшее количество транскриптов продуцируется нижележащим промотором и кодирует изоформы бета-нейрексина. Альфа-нейрексины содержат последовательности, подобные эпидермальному фактору роста (EGF-подобные), и домены ламинина G, и было показано, что они взаимодействуют с нейрексофилины. Бета-нейрексины лишены EGF-подобных последовательностей и содержат меньше доменов ламинина G, чем альфа-нейрексины.^[5]

Функция

Нейрексины находятся пресинаптическая мембрана молекулы клеточной адгезии которые связаны в первую очередь с нейролигины, белки, которые были связаны с аутизм. Аутизм характеризуется широким спектром социальных и когнитивных нарушений, которые частично объясняются неправильной синаптической связью между нейроны.^[6] Это отсутствие связи часто связано с мутациями в NRXN1. Структурные варианты NRXN1a (neurexin1 alpha) согласуются с мутациями, предрасполагающими к аутизму.^[7] Эти альфа-нейрексины участвуют в коммуникации через механизмы связывания кальциевых каналов и экзоцитоза везикул, чтобы гарантировать правильное высвобождение нейромедиаторов. Они особенно необходимы для высвобождения глутамата и ГАМК.^[8] Последствия участия нейрексина в аутизме были определены посредством делеции в кодирующих экзонах NRXN1a, особенно на моделях мышей с нокаутом. Эти мыши показали нарушение социального функционирования, снижение двигательной реакции в новых ситуациях и усиление агрессивного поведения у самцов.^[6] Социальное функционирование имел большое значение для этого гена и его связи с расстройство аутистического спектра.

Геномика

Ген находится в единственной копии на коротком плече хромосомы 2 (2p16.3). Ген имеет длину 1112 187 оснований, расположен на цепи Крика (минус) и кодирует белок из 1477 аминокислот (молекулярная масса 161,883 кДа).

Мутации этого гена, которые прерывают его экспрессию, были связаны с шизофрения, аутизм, и умственная отсталость (Мутации NRXN1 и заболевания головного мозга ).

Взаимодействия

NRXN1 показал взаимодействовать с участием NLGN1.^[9][10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000179915 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024109 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: нейрексин 1 NRXN1».
6. Grayton H .; Missler M .; Collier D .; Фернандес К. (2013). «Измененное социальное поведение мышей с нокаутом по нейрексину 1α напоминает основные симптомы расстройств нервного развития». PLOS ONE. 8 (6): e67114. Дои:10.1371 / journal.pone.0067114. ЧВК  3696036. PMID  23840597.
7. Ян Дж .; Noltner K .; Feng J .; Li W .; Schroer R .; Скиннер С .; Zeng W .; Schwartz C.E .; Соммер С.С. (2008). «Структурные варианты нейрексина 1альфа, связанные с аутизмом». Neurosci Lett. 438 (3): 368–70. Дои:10.1016 / j.neulet.2008.04.074. PMID  18490107. S2CID  7520448.
8. Missler M .; Zhang W .; Rohlmann A .; Kattenstroth G .; Hammer R.E .; Gottmann K .; Sudhof T.C. (2003). «Альфа-нейрексины соединяют каналы Ca2 + с экзоцитозом синаптических везикул». Природа. 423 (6943): 939–948. Дои:10.1038 / природа01755. PMID  12827191. S2CID  10315093.
9. Комолетти, Давиде; Флинн Робин; Дженнингс Лори Л; Чубыкин Александр; Мацумура Такехито; Хасегава Хана; Зюдхоф Томас С; Тейлор Палмер (декабрь 2003 г.). «Характеристика взаимодействия рекомбинантного растворимого нейролигина-1 с нейрексином-1бета». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 278 (50): 50497–50505. Дои:10.1074 / jbc.M306803200. ISSN  0021-9258. PMID  14522992.
10. Ихченко, К; Nguyen T; Südhof T C (февраль 1996 г.). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексином нескольких нейролигинов». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 271 (5): 2676–2682. Дои:10.1074 / jbc.271.5.2676. ISSN  0021-9258. PMID  8576240.

дальнейшее чтение

• Missler M, Südhof TC (1998). «Нейрексины: три гена и 1001 продукт». Тенденции Genet. 14 (1): 20–26. Дои:10.1016 / S0168-9525 (97) 01324-3. PMID  9448462.
• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Ушкарев Ю.А., Петренко А.Г., Гепперт М, Зюдхоф ТЦ (1992). «Нейрексины: синаптические поверхностные белки клетки, связанные с рецептором альфа-латротоксина и ламинином». Наука. 257 (5066): 50–56. Bibcode:1992 Наука ... 257 ... 50U. Дои:10.1126 / science.1621094. PMID  1621094.
• Ихченко К., Нгуен Т., Зюдхоф ТЦ (1996). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексином нескольких нейролигинов». J. Biol. Chem. 271 (5): 2676–2682. Дои:10.1074 / jbc.271.5.2676. PMID  8576240.
• Петренко А.Г., Ульрих Б., Мисслер М. и др. (1996). «Структура и эволюция нейрексофилина». J. Neurosci. 16 (14): 4360–9. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.16-14-04360.1996. ЧВК  6578849. PMID  8699246.
• Hata Y, Butz S, Südhof TC (1996). «CASK: новый гомолог dlg / PSD95 с N-концевым кальмодулин-зависимым доменом протеинкиназы, идентифицированным взаимодействием с нейрексинами». J. Neurosci. 16 (8): 2488–94. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.16-08-02488.1996. ЧВК  6578772. PMID  8786425.
• Перин М.С. (1996). «Мотивы зеркального отображения опосредуют взаимодействие COOH-конца множественных синаптотагминов с нейрексинами и кальмодулином». Биохимия. 35 (43): 13808–13816. Дои:10.1021 / bi960853x. PMID  8901523.
• Нгуен Т., Зюдхоф TC (1997). «Связывающие свойства нейролигина 1 и нейрексина 1beta обнаруживают функцию гетерофильных молекул клеточной адгезии». J. Biol. Chem. 272 (41): 26032–26039. Дои:10.1074 / jbc.272.41.26032. PMID  9325340.
• Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (1): 31–39. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID  9628581.
• Missler M, Hammer RE, Südhof TC (1999). «Связывание нейрексофилина с альфа-нейрексинами. Один домен LNS функционирует как независимо сворачивающаяся единица связывания лиганда». J. Biol. Chem. 273 (52): 34716–34723. Дои:10.1074 / jbc.273.52.34716. PMID  9856994.
• Клейдерлейн Дж. Дж., Ниссон П. Е., Джесси Дж. И др. (1999). «Повторы CCG в кДНК человеческого мозга». Гм. Genet. 103 (6): 666–673. Дои:10.1007 / s004390050889. PMID  9921901. S2CID  23696667.
• Бидерер Т., Зюдхоф ТК (2001). «Мяты как адаптеры. Прямое связывание с нейрексинами и рекрутирование munc18». J. Biol. Chem. 275 (51): 39803–39806. Дои:10.1074 / jbc.C000656200. PMID  11036064.
• Королл М, Ратьен Ф.Г., Фолькмер Х. (2001). «Молекула распознавания нервных клеток нейрофасцин взаимодействует с синтенином-1, но не с синтенином-2, оба из которых проявляют самоассоциирующую активность». J. Biol. Chem. 276 (14): 10646–10654. Дои:10.1074 / jbc.M010647200. PMID  11152476.
• Фукуда М, Микошиба К (2001). «Характеристика белка KIAA1427 как атипичного синаптотагмина (Syt XIII)». Biochem. J. 354 (Pt 2): 249–57. Дои:10.1042/0264-6021:3540249. ЧВК  1221650. PMID  11171101.
• Фукуда М, Микошиба К (2001). «Синаптотагмин-подобный белок 1-3: новое семейство тандемных C2-белков С-концевого типа». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 281 (5): 1226–1233. Дои:10.1006 / bbrc.2001.4512. PMID  11243866.
• Роуэн Л., Янг Дж., Бердитт Б. и др. (2002). «Анализ генов нейрексинов человека: альтернативный сплайсинг и создание разнообразия белков». Геномика. 79 (4): 587–597. Дои:10.1006 / geno.2002.6734. PMID  11944992.
• Табучи К., Südhof TC (2002). «Структура и эволюция генов нейрексинов: понимание механизма альтернативного сплайсинга». Геномика. 79 (6): 849–859. Дои:10.1006 / geno.2002.6780. PMID  12036300.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Res. 12 (11): 1773–1784. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P58400 (Нейрексин-1-бета) в PDBe-KB.