НПЭППС - NPEPPS

Эта статья посвящена цитозольной аланинаминопептидазе. Для аланиламинопептидазы клеточной мембраны см. Аланин аминопептидаза.

НПЭППС
Идентификаторы
Псевдонимы	НПЭППС, AAP-S, MP100, PSA, аминопептидаза, чувствительная к пуромицину
Внешние идентификаторы	OMIM: 606793 MGI: 1101358 ГомолоГен: 36199 Генные карты: НПЭППС
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.32 Начинать 47,522,942 бп[1] Конец 47,623,276 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 D | 11 60,95 см Начинать 97,205,842 бп[2] Конец 97,280,638 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание пептида • связывание ионов цинка • пептидазная активность • активность металлоаминопептидазы • металлопептидазная активность • гидролазная активность • связывание ионов металлов • аминопептидазная активность Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • ядро клетки • цитозоль • цитоплазма Биологический процесс • полиубиквитинирование белков • клеточный ответ на гипоксию • положительное регулирование доставки белка в митохондрии • пептидный катаболический процесс • протеолиз Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9520	19155
Ансамбль	ENSG00000141279	ENSMUSG00000001441
UniProt	P55786	Q11011
RefSeq (мРНК)	NM_006310 NM_001330257	NM_008942
RefSeq (белок)	NP_001317186 NP_006301	NP_032968
Расположение (UCSC)	Chr 17: 47.52 - 47.62 Мб	Chr 11: 97.21 - 97.28 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Пуромицин-чувствительная аминопептидаза также известен как цитозольная аланиламинопептидаза или же аланин-аминопептидаза (AAP) (EC 3.4.11.14 ) является фермент что у людей кодируется НПЭППС ген.^[5][6][7] Он используется как биомаркер обнаружить повреждение почки, и это может быть использовано для диагностики некоторых заболевания почек. Он находится на высоких уровнях в моча когда есть проблемы с почками.^[8]

Функция

Этот ген кодирует пуромицин-чувствительную аминопептидазу, металлопептидазу цинка, которая гидролизует аминокислоты с N-конца своего субстрата. Белок был локализован как в цитоплазме, так и в клеточных мембранах. Этот фермент разлагается энкефалины в головном мозге, и исследования на мышах предполагают, что он участвует в протеолитических событиях, регулирующих клеточный цикл.^[7] Он был идентифицирован как новый модификатор ТАУ -индуцированная нейродегенерация с нейропротекторным действием через прямые протеолиз белка TAU.^[9][10] Утрата функции NPEPPS усугубляет нейродегенерация.^[11]

Структура

Ген

В НПЭППС ген расположен в хромосома 17q 21, состоящий из 25 экзоны и занимающий 40 кб.

Протеин

NPEPPS - это повсеместно встречающийся 100 кДа Zn²⁺ металлопептидаза сильно выражен в мозге.^[12] Два изоферменты были обнаружены, и они по-разному выражаются в нервной системе.^[13] Glu 309 - один из активных сайтов глутаматы, и это мутация может превратить фермент в неактивный связывающий белок.^[14]

Функция

Было высказано предположение, что NPEPPS действует в различных процессах, включая метаболизм нейропептидаза, регулирование клеточный цикл, и гидролиз протеасомальных продуктов в аминокислоты.^[15][16][17] NPEPPS - это основная протеаза для переваривания SOD1, аналогично его роли в TAU-индуцированной нейродегенерации.^[10][18] Сообщается также, что NPEPPS играет роль в создании и уничтожении MHC пептиды, представленные классом, и в ограничивающем классе MHC представление Ag в дендритных клетках.^[19]

Клиническое значение

NPEPPS индуцируется в нейронах, экспрессирующих мутантный Хантингтин и имеет решающее значение для предотвращения накопления полиглутамин в нормальных клетках. Сообщается, что он является основной последовательностью полиглутамина, переваривающей пептидазу, при нейродегенеративных заболеваниях, таких как Болезнь Хантингтона.^[20] Было показано, что повышение активности NPEPPS in vivo может эффективно блокировать накопление гиперфосфорилированного белка TAU и, таким образом, замедлять прогрессирование заболевания, предполагая, что повышение активности NPEPPS может быть возможным терапевтическим подходом для устранения накопления токсичных субстратов, которые участвуют в нейродегенеративных заболеваниях. .^[21]

Взаимодействия

• Циклинзависимая киназа 5 ^[22]
• SOD1 ^[18]
• ТАУ ^[10]
• Тетрагидропиридин ^[23]
• β-амилоид ^[24]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000141279 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001441 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Tobler AR, Constam DB, Schmitt-Gräff A, Malipiero U, Schlapbach R, Fontana A (март 1997 г.). «Клонирование человеческой пуромицин-чувствительной аминопептидазы и доказательства экспрессии в нейронах». Журнал нейрохимии. 68 (3): 889–97. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1997.68030889.x. PMID  9048733. S2CID  30408265.
6. Томпсон М.В., Тоблер А., Фонтана А., Херш Л. Б. (май 1999 г.). «Клонирование и анализ гена человеческой пуромицин-чувствительной аминопептидазы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 258 (2): 234–40. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0604. PMID  10329370.
7. «Ген Entrez: NPEPPS-аминопептидаза, чувствительная к пуромицину».
8. Холдт Б, Питерс Э., Нагель Х.Р., Штайнер М. (2008). «Автоматический анализ активности аланин-аминопептидазы в моче». Клиническая химия и лабораторная медицина. 46 (4): 537–40. Дои:10.1515 / CCLM.2008.103. PMID  18302530. S2CID  45057277.
9. Sengupta S, Horowitz PM, Karsten SL, Jackson GR, Geschwind DH, Fu Y, Berry RW, Binder LI (декабрь 2006 г.). «Расщепление тау-белка пуромицин-чувствительной аминопептидазой in vitro». Биохимия. 45 (50): 15111–9. Дои:10.1021 / bi061830d. PMID  17154549.
10. Янаги К., Танака Т., Като К., Садик Г., Морихара Т., Кудо Т., Такеда М. (декабрь 2009 г.). «Вовлечение пуромицин-чувствительной аминопептидазы в протеолиз тау-белка в культивируемых клетках и ослабление протеолиза лобно-височной деменции и паркинсонизма, связанных с мутантным тау-геном хромосомы 17 (FTDP-17)». Психогериатрия. 9 (4): 157–66. Дои:10.1111 / j.1479-8301.2010.00307.x. PMID  20377816.
11. Karsten SL, Sang TK, Gehman LT, Chatterjee S, Liu J, Lawless GM, Sengupta S, Berry RW, Pomakian J, Oh HS, Schulz C, Hui KS, Wiedau-Pazos M, Vinters HV, Binder LI, Geschwind DH, Джексон Г.Р. (сентябрь 2006 г.). «Геномный скрининг модификаторов таупатии идентифицирует пуромицин-чувствительную аминопептидазу как ингибитор тау-индуцированной нейродегенерации». Нейрон. 51 (5): 549–60. Дои:10.1016 / j.neuron.2006.07.019. PMID  16950154. S2CID  8389733.
12. Роусон Н.С. (ноябрь 2009 г.). «Доступ к связанным административным данным использования здравоохранения для фармакоэпидемиологических и фармакоэкономических исследований в Канаде: противовирусные препараты в качестве примера». Фармакоэпидемиология и безопасность лекарств. 18 (11): 1072–9. Дои:10.1002 / pds.1822. PMID  19650154. S2CID  22999576.
13. Бартон С. (1816-01-01). «Некоторые наблюдения, касающиеся медицинских свойств Pyrola Umbellata и земляничного дерева Uva Ursi из Линнея». Медико-хирургические операции. 7: 143–9. Дои:10.1177/095952871600700108. ЧВК  2129051. PMID  20895273.
14. Томпсон М.В., Говиндасвами М., Херш Л.Б. (май 2003 г.). «Мутация остатков активного сайта пуромицин-чувствительной аминопептидазы: превращение фермента в каталитически неактивный связывающий белок». Архивы биохимии и биофизики. 413 (2): 236–42. Дои:10.1016 / с0003-9861 (03) 00123-1. PMID  12729622.
15. Херш Л. Б., Смит Т. Е., МакКелви Дж. Ф. (июль 1980 г.). «Расщепление эндорфинов на эндорфины des-Tyr гомогенной аминопептидазой головного мозга крупного рогатого скота». Природа. 286 (5769): 160–2. Дои:10.1038 / 286160a0. PMID  7402309. S2CID  4257825.
16. Констам Д. Б., Тоблер А. Р., Ренсинг-Эль А., Кемлер И., Херш Л. Б., Фонтана А. (ноябрь 1995 г.). «Пуромицин-чувствительная аминопептидаза. Анализ последовательности, экспрессия и функциональная характеристика». Журнал биологической химии. 270 (45): 26931–9. Дои:10.1074 / jbc.270.45.26931. PMID  7592939.
17. Сарич Т., Грэф К.И., Голдберг А.Л. (ноябрь 2004 г.). «Путь деградации пептидов, генерируемых протеасомами: ключевая роль тиметолигопептидазы и других металлопептидаз». Журнал биологической химии. 279 (45): 46723–32. Дои:10.1074 / jbc.M406537200. PMID  15328361.
18. Рен Джи, Ма Зи, Хуэй М., Кудо Л.К., Хуэй К.С., Карстен С.Л. (7 мая 2011 г.). «Cu, Zn-супероксиддисмутаза 1 (SOD1) является новой мишенью для пуромицин-чувствительной аминопептидазы (PSA / NPEPPS): PSA / NPEPPS является возможным модификатором бокового амиотрофического склероза». Молекулярная нейродегенерация. 6: 29. Дои:10.1186/1750-1326-6-29. ЧВК  3113298. PMID  21548977.
19. Towne CF, York IA, Neijssen J, Karow ML, Murphy AJ, Valenzuela DM, Yancopoulos GD, Neefjes JJ, Rock KL (февраль 2008 г.). «Пуромицин-чувствительная аминопептидаза ограничивает представление MHC класса I в дендритных клетках, но не влияет на ответы CD8 Т-клеток во время вирусных инфекций». Журнал иммунологии. 180 (3): 1704–12. Дои:10.4049 / jimmunol.180.3.1704. PMID  18209067.
20. Бутани Н., Венкатраман П., Голдберг А.Л. (март 2007 г.). «Пуромицин-чувствительная аминопептидаза - основная пептидаза, ответственная за переваривание последовательностей полиглутамина, высвобождаемых протеасомами во время деградации белка». Журнал EMBO. 26 (5): 1385–96. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601592. ЧВК  1817637. PMID  17318184.
21. Кудо Л.К., Парфенова Л., Рен Дж., Ви Н, Хуэй М., Ма З., Лау К., Грей М., Бардаг-Горце Ф, Видау-Пазос М., Хуэй К.С., Карстен С.Л. (май 2011 г.). «Пуромицин-чувствительная аминопептидаза (PSA / NPEPPS) препятствует развитию нейропатологии у мышей с двойными трансгенными генами hPSA / TAU (P301L)». Молекулярная генетика человека. 20 (9): 1820–33. Дои:10.1093 / hmg / ddr065. PMID  21320871.
22. Хубер Р.Дж., Каталано А, О'Дей Д.Х. (январь 2013 г.). «Циклинзависимая киназа 5 представляет собой кальмодулин-связывающий белок, который связывается с пуромицин-чувствительной аминопептидазой в ядре Dictyostelium». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1833 (1): 11–20. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2012.10.005. PMID  23063531.
23. Аэлури Р., Ганджи Р. Дж., Марапака А. К., Пиллаламарри В., Алла М., Аддлагатта А. (декабрь 2015 г.). «Тетрагидропиридины с высокой функциональностью являются цитотоксическими и селективными ингибиторами человеческой пуромицин-чувствительной аминопептидазы». Европейский журнал медицинской химии. 106: 26–33. Дои:10.1016 / j.ejmech.2015.10.026. PMID  26513642.
24. Kruppa AJ, Ott S, Chandraratna DS, Irving JA, Page RM, Speretta E, Seto T, Camargo LM, Marciniak SJ, Lomas DA, Crowther DC (декабрь 2013 г.). «Подавление токсичности Aβ с помощью пуромицин-чувствительной аминопептидазы не зависит от ее протеолитической активности». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1832 (12): 2115–26. Дои:10.1016 / j.bbadis.2013.07.019. ЧВК  3898073. PMID  23911349.

дальнейшее чтение

• Томпсон М.В., Херш Л.Б. (сентябрь 2003 г.). «Анализ консервативных остатков человеческой пуромицин-чувствительной аминопептидазы». Пептиды. 24 (9): 1359–65. Дои:10.1016 / j.peptides.2003.07.012. PMID  14706550. S2CID  24646812.
• Бауэр В.О., Нанда И., Бек Г., Шмид М., Якоб Ф. (2001). «Пуромицин-чувствительная аминопептидаза человека: клонирование 3 'UTR, доказательства полиморфизма на уровне 140 а.о. и уточненная хромосомная локализация 17q21». Цитогенетика и клеточная генетика. 92 (3–4): 221–4. Дои:10.1159/000056907. PMID  11435692. S2CID  28906058.
• де Гандариас Дж. М., Ирасуста Дж., Гиль Дж., Фернандес Д., Варона А., Касис Л. (ноябрь 1999 г.). «Онтогенез пуромицин-чувствительной и нечувствительной аминопептидазной активности в нескольких субклеточных фракциях мозга крысы». Бюллетень исследований мозга. 50 (4): 283–90. Дои:10.1016 / S0361-9230 (99) 00189-6. PMID  10582526. S2CID  6673357.
• Хубер Г., Томпсон А., Грюнингер Ф., Мехлер Х., Хохштрассер Р., Хаури Х. П., Малхерб П. (март 1999 г.). «Клонирование кДНК и молекулярная характеристика металлопротеиназы мозга человека MP100: кандидат в бета-секретазу?». Журнал нейрохимии. 72 (3): 1215–23. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0721215.x. PMID  10037494. S2CID  28498743.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Кюссено О., Бертон П., Кочанд-Приолле Б., Мейтленд, штат Нью-Джерси, Ле Дюк А (сентябрь 1994 г.). «Иммуноцитохимическое сравнение культивированных нормальных эпителиальных клеток предстательной железы с срезами ткани предстательной железы». Экспериментальные исследования клеток. 214 (1): 83–92. Дои:10.1006 / excr.1994.1236. PMID  8082751.
• Констам Д. Б., Тоблер А. Р., Ренсинг-Эль А., Кемлер И., Херш Л. Б., Фонтана А. (ноябрь 1995 г.). «Пуромицин-чувствительная аминопептидаза. Анализ последовательности, экспрессия и функциональная характеристика». Журнал биологической химии. 270 (45): 26931–9. Дои:10.1074 / jbc.270.45.26931. PMID  7592939.
• Маклеллан С., Дайер С., Родригес Г., Херш Л. Б. (ноябрь 1988 г.). «Исследования тканевого распределения пуромицин-чувствительных энкефалин-деградирующих аминопептидаз». Журнал нейрохимии. 51 (5): 1552–9. Дои:10.1111 / j.1471-4159.1988.tb01124.x. PMID  3171591. S2CID  20808131.