NPLOC4 - NPLOC4

NPLOC4
Белок NPLOC4 PDB 1nj3.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNPLOC4, NPL4, гомолог NPL4, фактор узнавания убиквитина
Внешние идентификаторыOMIM: 606590 MGI: 2679787 ГомолоГен: 5403 Генные карты: NPLOC4
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение NPLOC4
Геномное расположение NPLOC4
Группа17q25.3Начинать81,556,887 бп[1]
Конец81,648,465 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NPLOC4 217796 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_017921
NM_001369698

NM_001195023
NM_199469

RefSeq (белок)

NP_060391
NP_001356627
NP_060391.2

NP_001181952
NP_955763

Расположение (UCSC)Chr 17: 81,56 - 81,65 МбChr 11: 120,38 - 120,44 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гомолог белка 4 ядерной локализации белка это белок что у людей кодируется NPLOC4 ген.[5][6][7]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции NPLOC4. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Nploc4tm1a (EUCOMM) Wtsi[12][13] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.[14][15][16]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[10][17] Было проведено 26 испытаний и два фенотипы сообщалось. Нет гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши; у этих животных не наблюдалось никаких значительных отклонений от нормы.[10]

Взаимодействия

NPLOC4 был показан взаимодействовать с UFD1L.[5][18]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000182446 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039703 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Ботта А., Тандой С., Фини Дж., Калабрезе Дж., Даллапиккола Б., Новелли Дж. (Сентябрь 2001 г.). «Клонирование и характеристика гена, кодирующего человеческий NPL4, белок, взаимодействующий с убиквитиновым слитым белком деградации (UFD1L)». Ген. 275 (1): 39–46. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00649-7. PMID  11574150.
  6. ^ Мейер Х. Х., Короче Дж. Г., Зееманн Дж., Паппин Д., Уоррен Дж. (Июнь 2000 г.). «Комплекс Ufd1 и Npl4 млекопитающих связывает AAA-ATPase, p97, с убиквитином и путями ядерного транспорта». EMBO J. 19 (10): 2181–92. Дои:10.1093 / emboj / 19.10.2181. ЧВК  384367. PMID  10811609.
  7. ^ «Ген Entrez: локализация 4-го гомолога ядерного белка NPLOC4 (S. cerevisiae)».
  8. ^ "Сальмонелла данные о заражении Nploc4 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ "Citrobacter данные о заражении Nploc4 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  11. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  12. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  13. ^ "Информатика генома мыши".
  14. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  15. ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  16. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  17. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
  18. ^ Девушка А, МакКоннелл Э, Флек К., Паламарчук А., Войчик С. (август 2008 г.). «Анализ мутантов с делецией Npl4 в клетках млекопитающих раскрывает новые мотивы, взаимодействующие с Ufd1, и предполагает регуляторную роль Npl4 в ERAD». Exp. Cell Res. 314 (14): 2715–23. Дои:10.1016 / j.yexcr.2008.06.008. PMID  18586029.

дальнейшее чтение