OTUD6B - OTUD6B - Wikipedia

OTUD6B
Идентификаторы
ПсевдонимыOTUD6B, DUBA-5, DUBA5, CGI-77, OTU домен, содержащий 6B, IDDFSDA, OTU деубиквитиназу 6B
Внешние идентификаторыOMIM: 612021 MGI: 1919451 ГомолоГен: 6064 Генные карты: OTUD6B
Расположение гена (человек)
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек)[1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение OTUD6B
Геномное расположение OTUD6B
Группа8q21.3Начинать91,070,196 бп[1]
Конец91,087,095 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001286745
NM_016023

NM_152812

RefSeq (белок)

NP_001273674
NP_057107

NP_690025

Расположение (UCSC)Chr 8: 91.07 - 91.09 МбChr 4: 14,81 - 14,83 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

OTU домен, содержащий 6B это белок что у людей кодируется OTUD6B ген.[5]

OTUD6B - это функционал деубиквитинирующий фермент, класс протеаза что конкретно раскалывает убиквитин связи, отрицая действие убиквитинлигазы. OTUD6B, также известный как DUBA5, принадлежит к подсемейству DUB, характеризующемуся домен опухоли яичника (ОТУ).[5] Функция OTUD6B может быть связана с ростом и распространением.[6][7] Эта гипотеза подтверждается недавним исследованием, показывающим, что мыши с нокаутом OTUD6B, полученные в результате делеции экзона 4, нежизнеспособны и меньше по размеру.[8] У людей мутации OTUD6B связаны с синдромом умственной отсталости, связанным с дисморфическими особенностями.[8]

Предыдущие исследования модельных организмов (см. Ниже) не могут быть проверены этим редактором.

Модельные организмы были использованы при исследовании функции OTUD6B. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Otud6btm1a (EUCOMM) Wtsi[13][14] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[15][16][17]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[11][18] Было проведено двадцать пять испытаний гомозиготный мутант взрослых мышей, однако значительных отклонений не наблюдалось.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000155100 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040550 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б "Entrez Gene: домен OTU, содержащий 6B". Получено 2011-08-30.
  6. ^ Соболь А., Асконас С., Алани С., Вебер М.Дж., Анантанараянан В., Осипо С., Боккетта М. (ноябрь 2016 г.). «Изоформы деубиквитиназы OTUD6B являются важными регуляторами роста и пролиферации». Молекулярные исследования рака. 15 (2): 117–127. Дои:10.1158 / 1541-7786.MCR-16-0281-Т. ЧВК  5290186. PMID  27864334.
  7. ^ Сюй Цз, Чжэн И, Чжу И, Конг Х, Ху Л. (январь 2011 г.). «Доказательства участия OTUD-6B в клеточном цикле В-лимфоцитов после цитокиновой стимуляции». PLOS ONE. 6 (1): e14514. Дои:10.1371 / journal.pone.0014514. ЧВК  3022568. PMID  21267069.
  8. ^ а б Сантьяго-Сим, Тереза; Burrage, Lindsay C .; Эбштейн, Фредерик; Tokita, Mari J .; Миллер, Маркус; Би, Вэйминь; Braxton, Alicia A .; Розенфельд, Джилл А .; Шахрур, Махер (2017-04-06). «Биаллельные варианты в OTUD6B вызывают синдром умственной отсталости, связанный с припадками и дисморфическими особенностями». Американский журнал генетики человека. 100 (4): 676–688. Дои:10.1016 / j.ajhg.2017.03.001. ISSN  1537-6605. ЧВК  5384096. PMID  28343629.
  9. ^ "Сальмонелла данные о заражении Otud6b ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ "Citrobacter данные о заражении Otud6b ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  11. ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  12. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  13. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей». Архивировано из оригинал на 2012-03-20. Получено 2012-01-05.
  14. ^ "Информатика генома мыши".
  15. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  16. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  17. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  18. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение