PADI2 - PADI2

PADI2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4N20, 4N22, 4Н24, 4Н25, 4N26, 4N28, 4N2A, 4N2B, 4N2C, 4N2D, 4N2E, 4N2F, 4N2G, 4N2H, 4N2I, 4N2K, 4N2L, 4Н2М, 4N2N
Идентификаторы
Псевдонимы	PADI2, PAD-H19, PAD2, PDI2, пептидиларгининдезиминаза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 607935 MGI: 1338892 ГомолоГен: 7214 Генные карты: PADI2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.13 Начните 17,066,761 бп[1] Конец 17,119,451 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 D3 | 4 73.01 см Начните 140,906,344 бп[2] Конец 140,952,586 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • связывание рецептора эстрогена • гидролазная активность • протеин-аргининдезиминазная активность • активность гомодимеризации белков • связывание ионов металлов Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • транскрипционно активный хроматин • цитоплазма • цитозоль • внеклеточная область • ядро клетки • просвет азурофильных гранул Биологический процесс • отрицательная регуляция хемокин-опосредованного сигнального пути • цитруллинирование белков • хроматин-опосредованное поддержание транскрипции • цитруллинирование гистона H3-R26 • развитие черной субстанции • сигнальный путь внутриклеточного рецептора эстрогена • регуляция разборки хроматина • отрицательная регуляция хемотаксиса лимфоцитов • организация хроматина • дегрануляция нейтрофилов • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии • цитруллинирование гистонов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11240	18600
Ансамбль	ENSG00000117115	ENSMUSG00000028927
UniProt	Q9Y2J8	Q08642
RefSeq (мРНК)	NM_007365	NM_008812
RefSeq (белок)	NP_031391	NP_032838
Расположение (UCSC)	Chr 1: 17.07 - 17.12 Мб	Chr 4: 140.91 - 140.95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протеин-аргининдеиминаза типа 2 является фермент что у людей кодируется PADI2 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член пептидил аргининдеиминаза семейство ферментов, которые катализируют пост-переводной удаление белков путем преобразования аргинин остатки в цитруллины в присутствии ионы кальция. У членов семьи есть отличные субстрат специфичность и тканеспецифичность выражение узоры. Фермент типа II является наиболее широко экспрессируемым членом семейства. Известные субстраты для этого фермента включают: миелин основной белок в Центральная нервная система и виментин в скелетная мышца и макрофаги.

Считается, что этот фермент играет роль в возникновении и прогрессировании нейродегенеративный человеческие расстройства, включая Альцгеймера болезнь и рассеянный склероз, и это также было замешано в патогенез глаукомы. Этот ген существует в кластере с четырьмя другими паралогичный гены.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000117115 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028927 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ватанабэ К., Сэншу Т. (октябрь 1989 г.). «Выделение и характеристика клонов кДНК, кодирующих пептидиларгинин деиминазу скелетных мышц крысы». J Biol Chem. 264 (26): 15255–60. PMID  2768262.
6. «Ген Entrez: пептидиларгининдезиминаза PADI2, тип II».

дальнейшее чтение

• Vossenaar ER, Zendman AJ, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2004). «PAD, растущее семейство цитруллинирующих ферментов: гены, особенности и участие в болезни». BioEssays. 25 (11): 1106–18. Дои:10.1002 / bies.10357. PMID  14579251.
• Чаванас С., Мешин М.К., Начат Р. и др. (2006). «Дезиминазы и деструкция пептидиларгинина в биологии и патологии: значение для гомеостаза кожи». J. Dermatol. Наука. 44 (2): 63–72. Дои:10.1016 / j.jdermsci.2006.07.004. PMID  16973334.
• Москарелло М.А., Мастронарди Ф.Г., Вуд Д.Д. (2007). «Роль цитруллинированных белков предполагает новый механизм в патогенезе рассеянного склероза». Neurochem. Res. 32 (2): 251–6. Дои:10.1007 / s11064-006-9144-5. ЧВК  1794624. PMID  17031564.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 6 (1): 63–70. Дои:10.1093 / днарес / 6.1.63. PMID  10231032.
• Вентер Дж. К., Адамс, доктор медицины, Майерс Э. У. и др. (2001). «Последовательность генома человека». Наука. 291 (5507): 1304–51. Дои:10.1126 / science.1058040. PMID  11181995.
• Исигами А., Осава Т., Асага Х. и др. (2002). «Человеческая пептидиларгининдезиминаза типа II: молекулярное клонирование, генная организация и экспрессия в коже человека». Arch. Biochem. Биофизы. 407 (1): 25–31. Дои:10.1016 / S0003-9861 (02) 00516-7. PMID  12392711.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чаванас С., Мешин М.К., Такахара Х. и др. (2004). «Сравнительный анализ кластеров генов пептидиларгининдезиминазы мыши и человека выявил высококонсервативные некодирующие сегменты и новый человеческий ген, PADI6». Ген. 330: 19–27. Дои:10.1016 / j.gene.2003.12.038. PMID  15087120.
• Самбандам Т., Белоусова М., Акавити-Лопер М.А. и др. (2005). «Повышение уровня пептидиларгининдезиминазы II типа в гипоксических астроцитах». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 325 (4): 1324–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.10.173. PMID  15555572.
• Накаяма-Хамада М., Сузуки А., Кубота К. и др. (2005). «Сравнение ферментативных свойств hPADI2 и hPADI4». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 327 (1): 192–200. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.11.152. PMID  15629448.
• Исигами А., Осава Т., Хирацука М. и др. (2005). «Аномальное накопление цитруллинированных белков, катализируемое пептидиларгининдезиминазой в экстрактах гиппокампа пациентов с болезнью Альцгеймера». J. Neurosci. Res. 80 (1): 120–8. Дои:10.1002 / jnr.20431. PMID  15704193.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Бхаттачарья С.К., Крабб Дж. С., Бонилья В. Л. и др. (2006). «Протеомика вовлекает пептидиларгининдеиминазу 2 и цитруллинирование зрительного нерва в патогенез глаукомы». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Наука. 47 (6): 2508–14. Дои:10.1167 / iovs.05-1499. PMID  16723463.
• Мастронарди Ф.Г., Нур А., Вуд Д.Д. и др. (2007). «Остров CpG пептидиларгининдейиназы 2 в белом веществе рассеянного склероза гипометилирован». J. Neurosci. Res. 85 (9): 2006–16. Дои:10.1002 / jnr.21329. PMID  17469138.