PCBP1 - PCBP1

PCBP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WVN, 1ZTG, 3ВКЭ
Идентификаторы
Псевдонимы	PCBP1, HEL-S-85, HNRPE1, HNRPX, hnRNP-E1, hnRNP-X, поли (rC) связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601209 MGI: 1345635 ГомолоГен: 68506 Генные карты: PCBP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п13.3 Начинать 70,087,477 бп[1] Конец 70,089,203 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 D1 Начинать 86,524,492 бп[2] Конец 86,526,321 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание мРНК • Связывание РНК • связывание нуклеиновой кислоты • связывание одноцепочечной ДНК • Последовательно-специфичное связывание одноцепочечной ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание кадгерина Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточная экзосома • мембрана • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • ядерное пятнышко • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • репликация вирусного генома РНК • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Метаболический процесс РНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5093	23983
Ансамбль	ENSG00000169564	ENSMUSG00000051695
UniProt	Q15365	P60335
RefSeq (мРНК)	NM_006196	NM_011865
RefSeq (белок)	NP_006187	NP_035995
Расположение (UCSC)	Chr 2: 70.09 - 70.09 Мб	Chr 6: 86,52 - 86,53 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Поли (rC) -связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется PCBP1 ген.^[5]

Считается, что этот безинтронный ген был создан ретротранспозиция полностью процессированной мРНК PCBP-2. Этот ген и PCBP-2 имеют паралоги (PCBP3 и PCBP4), которые, как полагают, возникли в результате дублирования целых генов. Белок, кодируемый этим геном, кажется многофункциональным. Это вместе с PCBP2 и ГНРНПК соответствует основному клеточному поли (rC) -связывающему белку. Он содержит три K-гомологичный (KH) домены, которые могут участвовать в связывании РНК. Этот кодируемый белок вместе с ПКБП-2 также действует как трансляционные коактиваторы полиовирус РНК посредством специфичного для последовательности взаимодействия со стеблем-петлей IV IRES и способствует репликации РНК полиовируса путем связывания с его 5'-концевой структурой клеверного листа.

Он также участвует в контроле трансляции мРНК 15-липоксигеназы, вирус папилломы человека мРНК L2 типа 16 и гепатит А РНК вируса. Также предполагается, что кодируемый белок играет роль в формировании комплекса мРНП альфа-глобина, специфичного для последовательности, который связан со стабильностью мРНК альфа-глобина.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169564 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051695 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Томмеруп Н., Лефферс Х (май 1997 г.). «Назначение генов, содержащих KH-бокс человека, путем гибридизации in situ: HNRNPK картируется с 9q21.32-q21.33, PCBP1 с 2p12-p13, а PCBP2 с 12q13.12-q13.13, дистальнее FRA12A». Геномика. 32 (2): 297–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0121. PMID  8833161.
6. «Ген Entrez: связывающий поли (rC) белок 1 PCBP1».

дальнейшее чтение

• Kiledjian M, Wang X, Liebhaber SA (1995). «Идентификация двух белков домена KH в комплексе стабильности мРНП альфа-глобина». EMBO J. 14 (17): 4357–64. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00110.x. ЧВК  394520. PMID  7556077.
• Лефферс Х, Дейгаард К., Селис Дж. Э. (1995). «Характеристика двух основных клеточных поли (rC)-связывающих белков человека, каждый из которых содержит три K-гомологичных (KH) домена». Евро. J. Biochem. 230 (2): 447–53. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20581.x. PMID  7607214.
• Aasheim HC, Loukianova T, Deggerdal A, Smeland EB (1994). «Тканеспецифическая экспрессия и структура кДНК человеческого транскрипта, кодирующего связывающий нуклеиновую кислоту [олиго (dC)] белок, родственный пре-мРНК-связывающему белку K.» Нуклеиновые кислоты Res. 22 (6): 959–64. Дои:10.1093 / nar / 22.6.959. ЧВК  307915. PMID  8152927.
• Блин Л. Б., Свидерек К. М., Ричардс О. и др. (1996). «Поли (rC) связывающий белок 2 связывается со стеблем-петлей IV 5'-некодирующей области полиовирусной РНК: идентификация с помощью автоматической жидкостной хроматографии-тандемной масс-спектрометрии». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (20): 11115–20. Дои:10.1073 / пнас.93.20.11115. ЧВК  38293. PMID  8855318.
• Киледжиан М., ДеМария СТ, Брюер Г., Новик К. (1997). «Идентификация AUF1 (гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин D) как компонента комплекса стабильности мРНК альфа-глобина». Мол. Клетка. Биол. 17 (8): 4870–6. Дои:10.1128 / MCB.17.8.4870. ЧВК  232339. PMID  9234743.
• Ван З., День N, Трифиллис П., Киледжиан М. (1999). «Комплекс стабильности мРНК функционирует с поли (A) -связывающим белком для стабилизации мРНК in vitro». Мол. Клетка. Биол. 19 (7): 4552–60. Дои:10.1128 / MCB.19.7.4552. ЧВК  84253. PMID  10373504.
• Макеев А.В., Чхеидзе А.Н., Либхабер С.А. (1999). «Набор высококонсервативных РНК-связывающих белков, альфаСР-1 и альфаСР-2, участвующих в стабилизации мРНК, коэкспрессируется из гена без интрона и его содержащего интрон паралога». J. Biol. Chem. 274 (35): 24849–57. Дои:10.1074 / jbc.274.35.24849. PMID  10455157.
• Макеев А.В., Либхабер С.А. (2000). «Идентификация двух новых генов млекопитающих создает подсемейство РНК-связывающих белков KH-домена». Геномика. 67 (3): 301–16. Дои:10.1006 / geno.2000.6244. PMID  10936052.
• Судзуки Х., Фукуниси Ю., Кагава И. и др. (2001). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши». Genome Res. 11 (10): 1758–65. Дои:10.1101 / гр.180101. ЧВК  311163. PMID  11591653.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Yeap BB, Voon DC, Vivian JP и др. (2002). «Новое связывание HuR и поли (C) -связывающего белка с консервативным UC-богатым мотивом в 3'-нетранслируемой области матричной РНК рецептора андрогена». J. Biol. Chem. 277 (30): 27183–92. Дои:10.1074 / jbc.M202883200. PMID  12011088.
• Уолтер Б.Л., Петрушка Т.Б., Эренфельд Э., Семлер Б.Л. (2002). «Определенные детерминанты домена KH поли (rC) связывающего белка для инициации трансляции полиовируса и репликации вирусной РНК». Дж. Вирол. 76 (23): 12008–22. Дои:10.1128 / JVI.76.23.12008-12022.2002. ЧВК  136902. PMID  12414943.
• Джайлз К.М., Дейли Дж. М., Беверидж Д. Д. и др. (2003). «3'-нетранслируемая область мРНК p21WAF1 представляет собой составную цис-действующую последовательность, связанную с РНК-связывающими белками из клеток рака молочной железы, включая HuR и поли (C)-связывающий белок». J. Biol. Chem. 278 (5): 2937–46. Дои:10.1074 / jbc.M208439200. PMID  12431987.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Пикеринг Б.М., Митчелл С.А., Эванс-младший, Уиллис А.Е. (2003). «Связывающий белок полипиримидинового тракта и связывающий поли r (C) белок 1 взаимодействуют с BAG-1 IRES и стимулируют его активность in vitro и in vivo». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (2): 639–46. Дои:10.1093 / нар / гкг146. ЧВК  140511. PMID  12527772.
• Пиллаи М.Р., Чако П., Кесари Л.А. и др. (2003). «Экспрессия рецепторов фолиевой кислоты и гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина E1 у женщин с опосредованным вирусом папилломы человека превращением ткани шейки матки в рак». J. Clin. Патол. 56 (8): 569–74. Дои:10.1136 / jcp.56.8.569. ЧВК  1770025. PMID  12890803.
• Адамс DJ, Беверидж DJ, ван дер Вейден Л. и др. (2004). «HADHB, HuR и CP1 связываются с дистальной 3'-нетранслируемой областью мРНК ренина человека и дифференциально модулируют экспрессию ренина». J. Biol. Chem. 278 (45): 44894–903. Дои:10.1074 / jbc.M307782200. PMID  12933794.
• Эванс Дж. Р., Митчелл С. А., Сприггс К. А. и др. (2003). «Члены семейства связывающих поли (rC) белков стимулируют активность входного сегмента внутренней рибосомы c-myc in vitro и in vivo». Онкоген. 22 (39): 8012–20. Дои:10.1038 / sj.onc.1206645. PMID  12970749.
• Чхеидзе А.Н., Либхабер С.А. (2003). «Новый набор сигналов ядерной локализации определяет распределение белков, связывающих РНК alphaCP». Мол. Клетка. Биол. 23 (23): 8405–15. Дои:10.1128 / MCB.23.23.8405-8415.2003. ЧВК  262676. PMID  14612387.