PDCD5 - PDCD5

PDCD5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ГГБ, 2CRU, 2К6Б
Идентификаторы
Псевдонимы	PDCD5, TFAR19, программируемая гибель клеток 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 604583 MGI: 3782009 ГомолоГен: 10506 Генные карты: PDCD5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.11 Начинать 32,581,190 бп[1] Конец 32,587,453 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание гепарина • GO: 0001948 связывание с белками • активность активатора ацетилтрансферазы • связывание бета-тубулина Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточная экзосома • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • клеточный ответ на бета-стимул трансформирующего фактора роста • отрицательная регуляция опосредованного шаперонами сворачивания белков • положительное регулирование высвобождения цитохрома с из митохондрий • апоптотический процесс • положительная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • положительная регуляция экспрессии генов • положительная регуляция импорта белка в наружную мембрану митохондрий • отрицательное регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция апоптотического процесса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9141	100042424
Ансамбль	ENSG00000105185	н / д
UniProt	O14737	P56812
RefSeq (мРНК)	NM_004708	XM_001478256
RefSeq (белок)	NP_004699	NP_062720
Расположение (UCSC)	Chr 19: 32,58 - 32,59 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок запрограммированной гибели клеток 5 это белок что у людей кодируется PDCD5 ген.^[4][5]

Этот ген кодирует белок, экспрессируемый в опухолевые клетки в течение апоптоз независимо от стимулов, вызывающих апоптоз. До индукции апоптоза этот генный продукт распределяется как в ядре, так и в цитоплазма.

Как только апоптоз индуцируется, уровень этого белка увеличивается и, перемещаясь из цитоплазмы, он накапливается в ядро. Хотя его точная функция не определена, считается, что этот белок играет раннюю и универсальную роль в апоптозе.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105185 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Лю Х, Ван И, Чжан И, Сон Кью, Ди Си, Чен Дж, Тан Дж, Ма Д. (февраль 1999 г.). «TFAR19, новый ген, связанный с апоптозом, клонированный из линии клеток лейкемии человека TF-1, может усиливать апоптоз некоторых опухолевых клеток, вызванный отменой фактора роста». Biochem Biophys Res Commun. 254 (1): 203–10. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9893. PMID  9920759.
5. "Энтрез Ген: PDCD5 запрограммированная гибель клеток 5".

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Чен Ю., Сун Р., Хан В. и др. (2002). «Ядерная транслокация PDCD5 (TFAR19): ранний сигнал апоптоза?». FEBS Lett. 509 (2): 191–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 03062-9. PMID  11741587. S2CID  26547410.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Сюй М., Ченг Н., Гуй Л. и др. (2004). «5'-вышестоящая область гена 5 программируемой гибели клеток человека содержит высокоактивный промотор, не содержащий ТАТА, который активируется этопозидом». Ген. 329: 39–49. Дои:10.1016 / j.gene.2003.12.025. PMID  15033527.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Лю Д., Яо Х, Чен Й и др. (2006). «N-концевой фрагмент из 26 остатков белка 5 человеческой программируемой гибели клеток может образовывать стабильную α-спираль с уникальным электростатическим потенциалом». Biochem. J. 392 (Pt 1): 47–54. Дои:10.1042 / BJ20050688. ЧВК  1317663. PMID  16083422.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Ма Х, Руан Дж, Ван И и др. (2006). «Два однонуклеотидных полиморфизма с неравновесным сцеплением в 5'-регуляторной области гена запрограммированной гибели клеток человека влияют на активность промотора и восприимчивость к хроническому миелолейкозу у населения Китая». Clin. Рак Res. 11 (24 Pt 1): 8592–9. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-0039. PMID  16361542.
• Ян Ю.Х., Чжао М., Ли В.М. и др. (2007). «Экспрессия гена запрограммированной клеточной смерти 5 участвует в регуляции апоптоза в опухолевых клетках желудка». Апоптоз. 11 (6): 993–1001. Дои:10.1007 / s10495-006-6714-6. PMID  16547588. S2CID  21178139.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Ван Н., Лу Х.С., Гуань З.П. и др. (2007). «Участие PDCD5 в регуляции апоптоза в фибробластоподобных синовиоцитах ревматоидного артрита». Апоптоз. 12 (8): 1433–41. Дои:10.1007 / s10495-007-0070-z. PMID  17468978. S2CID  21175365.