PIR (ген) - PIR (gene)

PIR
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4ERO, 4EWD, 4GUL, 1J1L, 4EWA, 4HLT, 3ACL, 4EWE
Идентификаторы
Псевдонимы	PIR, пирин
Внешние идентификаторы	OMIM: 300931 MGI: 1916906 ГомолоГен: 2717 Генные карты: PIR
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xp22.2 Начинать 15,384,799 бп[1] Конец 15,493,564 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X F5 Начинать 164,269,371 бп[2] Конец 164,373,011 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции • активность диоксигеназы • связывание ионов металлов • кверцетин-2,3-диоксигеназная активность Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • цитозоль • нуклеоплазма Биологический процесс • миелоидная дифференцировка клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • окислительно-восстановительный процесс • дифференцировка моноцитов • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • пищеварение • регуляция транскрипции на основе нуклеиновых кислот Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8544	69656
Ансамбль	ENSG00000087842	ENSMUSG00000031379
UniProt	O00625	Q9D711
RefSeq (мРНК)	NM_003662 NM_001018109	NM_001301402 NM_027153
RefSeq (белок)	NP_001018119 NP_003653	NP_001288331 NP_081429
Расположение (UCSC)	Chr X: 15.38 - 15.49 Мб	Chr X: 164,27 - 164,37 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Пирин это белок что у людей кодируется PIR ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член надсемейство купинов. Кодируемый белок представляет собой ядерный белок, содержащий Fe (II), экспрессирующийся во всех тканях организма и концентрирующийся в точечных субядерных структурах. Взаимодействие с ядерным фактором I / фактором транскрипции CCAAT-бокса, а также с онкобелком, кодируемым В-клеточной лимфомой 3, предполагает, что кодируемый белок может действовать как транскрипционный кофактор и участвовать в регуляции транскрипции и репликации ДНК. Описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов.^[6]

Взаимодействия

Было показано, что PIR (ген) взаимодействовать с BCL3.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000087842 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031379 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Вендлер В.М., Креммер Э., Форстер Р., Виннакер Э.Л. (май 1997 г.). «Идентификация пирина, нового высококонсервативного ядерного белка». J Biol Chem. 272 (13): 8482–9. Дои:10.1074 / jbc.272.13.8482. PMID  9079676.
6. «Ген Entrez: пирин PIR (ядерный белок, связывающий железо)».
7. Dechend, R; Hirano F; Lehmann K; Heissmeyer V; Ansieau S; Wulczyn F G; Scheidereit C; Leutz A (июнь 1999 г.). «Онкопротеин Bcl-3 действует как связующий фактор между NF-kappaB / Rel и ядерными ко-регуляторами». Онкоген. 18 (22): 3316–23. Дои:10.1038 / sj.onc.1202717. ISSN  0950-9232. PMID  10362352.

дальнейшее чтение

• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Адамс М., Цзя З (2005). «Структурный и биохимический анализ показывает, что пирины обладают кверцетиназной активностью». J. Biol. Chem. 280 (31): 28675–82. Дои:10.1074 / jbc.M501034200. PMID  15951572.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Колланд Ф., Жак Х, Троплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Пан Х., Бартлам М., Цзэн К. и др. (2004). «Кристаллическая структура пирина человека: железосвязывающий ядерный белок и кофактор транскрипции». J. Biol. Chem. 279 (2): 1491–8. Дои:10.1074 / jbc.M310022200. PMID  14573596.
• Цзэн Кью, Ли Х, Бартлам М. и др. (2004). «Очистка, кристаллизация и предварительный рентгеноструктурный анализ человеческого пирина». Acta Crystallogr. D. 59 (Pt 8): 1496–8. Дои:10.1107 / S0907444903012289. PMID  12876364.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Деченд Р., Хирано Ф., Леманн К. и др. (1999). «Онкопротеин Bcl-3 действует как связующий фактор между NF-kappaB / Rel и ядерными ко-регуляторами». Онкоген. 18 (22): 3316–23. Дои:10.1038 / sj.onc.1202717. PMID  10362352.