POM121 - POM121

POM121
Идентификаторы
Псевдонимы	POM121, P145, POM121A, POM121 трансмембранный нуклеопорин
Внешние идентификаторы	OMIM: 615753 MGI: 2137624 ГомолоГен: 70878 Генные карты: POM121
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q11.23 Начните 72,879,365 бп[1] Конец 72,951,440 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 G2 Начните 135,376,141 бп[2] Конец 135,394,546 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры • связывание с последовательностью ядерной локализации Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • ядерная оболочка • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • эндоплазматический ретикулум • ядро клетки • центральный транспортный канал ядерной поры • ядерная пора ядерная корзина • нуклеоплазма • не мембрана • ядерная пора • клетка-хозяин Биологический процесс • транспорт мРНК • транспорт белка • GO: 0022415 вирусный процесс • экспорт мРНК из ядра • Экспорт РНК из ядра • импорт белка в ядро • регулирование гликолитического процесса • экспорт тРНК из ядра • белковое сумоилирование • вирусная транскрипция • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • регуляция клеточного ответа на тепло Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9883	107939
Ансамбль	ENSG00000196313	ENSMUSG00000053293
UniProt	Q96HA1	Q8K3Z9
RefSeq (мРНК)	NM_001257190 NM_172020 NM_001367610	NM_148932
RefSeq (белок)	NP_001244119 NP_742017 NP_001354539	NP_683734
Расположение (UCSC)	Chr 7: 72,88 - 72,95 Мб	Chr 5: 135,38 - 135,39 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок мембраны поры ядерной оболочки ПОМ 121 это белок что у людей кодируется POM121 ген.^[5][6][7] Были описаны альтернативно сплайсированные варианты, которые кодируют разные изоформы белков, но была определена полноразмерная природа только одной.^[8]

Функция

В ядерная оболочка создает четкие ядерный и цитоплазматический компартменты в эукариотических клетках. Он состоит из двух концентрических мембран, перфорированных ядерные поры, большие белковые комплексы, которые образуют водные каналы для регулирования потока макромолекул между ядром и цитоплазмой. Эти комплексы состоят как минимум из 100 различных полипептидных субъединиц, многие из которых относятся к нуклеопорин семья. Этот ген кодирует член нуклеопоринов, содержащих FG-повтор. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой интегральный мембранный белок который локализуется в центральном кольцевом комплексе спиц и участвует в прикреплении комплекса ядерных пор к ядерной оболочке.^[8]

Антитела против этого белка можно использовать для идентификации ядерной оболочки в иммунофлуоресценция эксперименты.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196313 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053293 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Халльберг Э., Возняк Р.В., Блобель Г. (август 1993 г.). «Интегральный мембранный белок порового мембранного домена ядерной оболочки содержит нуклеопорин-подобную область». J Cell Biol. 122 (3): 513–21. Дои:10.1083 / jcb.122.3.513. ЧВК  2119659. PMID  8335683.
6. Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
7. Фунакоши Т., Маэшима К., Яхата К., Сугано С., Имамото Ф., Имамото Н. (октябрь 2007 г.). «Два различных гена POM121 человека: потребность в формировании комплексов ядерных пор». FEBS Lett. 581 (25): 4910–6. Дои:10.1016 / j.febslet.2007.09.021. PMID  17900573. S2CID  12819086.
8. «Ген Entrez: POM121, мембранный гликопротеин POM121 (homo sapiens)».
9. Kihlmark M, Imreh G, Hallberg E (октябрь 2001 г.). «Последовательная деградация белков ядерной оболочки во время апоптоза». J. Cell Sci. 114 (Pt 20): 3643–53. PMID  11707516.

дальнейшее чтение

• Бодур К., Шейх С., Энарсон П. и др. (1999). «Функция и сборка сложных белков ядерной поры». Biochem. Cell Biol. 77 (4): 321–9. Дои:10.1139 / bcb-77-4-321. PMID  10546895.
• Кипершток С., Осава Г.А., Лян Л.Ф. и др. (1995). «POM-ZP3, двудольный транскрипт, полученный из человеческого ZP3 и гомолог POM121». Геномика. 25 (2): 354–9. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80033-И. PMID  7789967.
• Фушье Р.А., Мейер Б.Е., Саймон Дж. Х. и др. (1998). «Взаимодействие белка Vpr вируса иммунодефицита человека 1 типа с комплексом ядерных пор». Дж. Вирол. 72 (7): 6004–13. Дои:10.1128 / JVI.72.7.6004-6013.1998. ЧВК  110405. PMID  9621063.
• Дайгл Н., Бодуэн Дж., Хартнелл Л. и др. (2001). «Комплексы ядерных пор образуют неподвижные сети и имеют очень низкий оборот в живых клетках млекопитающих». J. Cell Biol. 154 (1): 71–84. Дои:10.1083 / jcb.200101089. ЧВК  2196857. PMID  11448991.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хиллиер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК хромосомы 7 человека». Природа. 424 (6945): 157–64. Дои:10.1038 / природа01782. PMID  12853948.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Эрикссон C, Рустум C, Холлберг E (2004). «Динамические свойства белков комплекса ядерных пор в gp210-дефицитных клетках». FEBS Lett. 572 (1–3): 261–5. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.07.044. PMID  15304359. S2CID  22760247.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.