PRMT3 - PRMT3

PRMT3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2FYT, 3SMQ, 4HSG, 4QQN, 4РИЛ
Идентификаторы
Псевдонимы	PRMT3, HRMT1L3, протеин-аргининметилтрансфераза 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 603190 MGI: 1919224 ГомолоГен: 24255 Генные карты: PRMT3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11п15.1 Начинать 20,387,558 бп[1] Конец 20,509,338 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B4 Начинать 49,778,346 бп[2] Конец 49,858,265 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • активность метилтрансферазы • трансферазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • протеин-аргинин-N-метилтрансферазная активность • связывание нуклеиновой кислоты • гистон-аргинин-N-метилтрансферазная активность • протеин-аргинин омега-N асимметричная метилтрансферазная активность • связывание рибосом Сотовый компонент • рибосома • цитоплазма • цитозоль • ядро клетки Биологический процесс • метилирование • отрицательная регуляция убиквитинирования белков • пептидил-аргинин N-метилирование • метилирование белков • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • метилирование пептидиларгинина до асимметричного диметиларгинина • метилирование гистона аргинина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10196	71974
Ансамбль	ENSG00000185238	ENSMUSG00000030505
UniProt	O60678	Q922H1
RefSeq (мРНК)	NM_001145166 NM_001145167 NM_005788	NM_133740
RefSeq (белок)	NP_001138638 NP_001138639 NP_005779	NP_598501
Расположение (UCSC)	Chr 11: 20.39 - 20.51 Мб	Chr 7: 49,78 - 49,86 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок аргинин-N-метилтрансфераза 3 является фермент что у людей кодируется PRMT3 ген.^[5][6]

Модельные организмы

Prmt3 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Аномальный
Рецессивный смертельное исследование	Нормальный
Плодородие	Нормальный
Общие наблюдения	Аномальный
Масса тела	Аномальный[7]
Беспокойство	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Аномальный[8]
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Аномальный[9]
Рентгенография	Нормальный
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Аномальный[10]
Клиническая химия	Нормальный
Гематология	Нормальный
Лимфоциты периферической крови	Аномальный
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Гистопатология кожи	Нормальный
Гистопатология мозга	Нормальный
Гистопатология глаз	Нормальный
Сальмонелла инфекционное заболевание	Нормальный[11]
Citrobacter инфекционное заболевание	Нормальный[12]
Все тесты и анализы от[13][14]

Модельные организмы были использованы при изучении функции PRMT3. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Prmt3^{tm1a (EUCOMM) Wtsi[15][16]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.^[17][18][19]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[13][20] Было проведено 27 испытаний на мутант мышей и семь значительных отклонений.^[13] Меньше, чем ожидалось гомозиготный мутант мыши выжили до отлучение от груди из-за гидроцефалия. Остальные тесты проводились на обоих гетерозиготный и гомозиготные мутантные взрослые мыши. Самцы гетерзиготных мышей имели пониженную респираторный коэффициент. Гомозиготные самки имели пониженную массу тела, длину и минеральную плотность костей. Гомозиготные самцы имели аномальную периферическую кровь лимфоцит количество и гомозиготы обоих полов имели аномалии глаз.^[13]

Взаимодействия

PRMT3 был показан взаимодействовать с RPS2.^[21]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000185238 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030505 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Тан Дж., Гэри Дж. Д., Кларк С., Хершман HR (июль 1998 г.). «PRMT 3, протеин-аргинин-N-метилтрансфераза I типа, которая отличается от PRMT1 своей олигомеризацией, субклеточной локализацией, субстратной специфичностью и регуляцией». Журнал биологической химии. 273 (27): 16935–45. Дои:10.1074 / jbc.273.27.16935. PMID  9642256.
6. «Ген Entrez: протеин аргининметилтрансфераза 3 PRMT3».
7. «Данные о массе тела для Prmt3». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
8. «Данные косвенной калориметрии для Prmt3». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
9. «Данные DEXA для Prmt3». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
10. «Данные морфологии глаза для Prmt3». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
11. "Сальмонелла данные о заражении Prmt3 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
12. "Citrobacter данные о заражении Prmt3 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
13. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
14. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
15. «Международный консорциум нокаут-мышей».
16. "Информатика генома мыши".
17. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В. и др. (Июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
18. Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
19. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
20. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (июнь 2011 г.). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
21. Чой С., Юнг ЧР, Ким Дж.Й., Им Д.С. (сентябрь 2008 г.) «PRMT3 ингибирует убиквитинирование рибосомного белка S2 и вместе образует активный ферментный комплекс». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Общие предметы. 1780 (9): 1062–9. Дои:10.1016 / j.bbagen.2008.05.010. PMID  18573314.

дальнейшее чтение

• Сингх В., Миранда Т. Б., Цзян В., Франкель А., Ремер М. Э., Робб В. А. и др. (Октябрь 2004 г.). «Опухолевый супрессор DAL-1 / 4.1B взаимодействует с протеином аргинин-N-метилтрансферазой 3 (PRMT3) и подавляет его способность метилировать субстраты in vitro и in vivo». Онкоген. 23 (47): 7761–71. Дои:10.1038 / sj.onc.1208057. PMID  15334060.
• Бачанд Ф., Сильвер ПА (июль 2004 г.). «PRMT3 представляет собой рибосомную протеинметилтрансферазу, которая влияет на клеточные уровни рибосомных субъединиц». Журнал EMBO. 23 (13): 2641–50. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600265. ЧВК  449775. PMID  15175657.
• Смит Дж. Дж., Рюкнагель К. П., Ширхорн А., Тан Дж., Немет А., Линдер М. и др. (Май 1999 г.). «Необычные участки метилирования аргинина в поли (A) -связывающем белке II и метилирование in vitro белком аргининметилтрансферазами PRMT1 и PRMT3». Журнал биологической химии. 274 (19): 13229–34. Дои:10.1074 / jbc.274.19.13229. PMID  10224081.

внешняя ссылка

• PRMT3 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• PRMT3 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.