Пентатрикопептидный повтор - Pentatricopeptide repeat
| Пентатрикопептидный повтор | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | PPR | ||||||||
| Pfam | PF01535 | ||||||||
| Pfam клан | CL0020 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002885 | ||||||||
| PROSITE | PS51375 | ||||||||
| |||||||||
В пентатрикопептидный повтор (PPR) - это 35-аминокислота мотив последовательности. Белки, содержащие пентатрикопептидные повторы, представляют собой семейство белки обычно встречается в завод Королевство. Их отличает наличие тандемных вырожденных мотивов PPR.[1] и относительным отсутствием интроны в кодирующих их генах.[2]
Примерно 450 таких белков было идентифицировано в Арабидопсис геном, и еще 477 в рис геном.[3] Несмотря на большой размер семейства белков, генетические данные позволяют предположить, что избыточность функций между белками PPR в Арабидопсис.[2]
Назначение белков PPR в настоящее время обсуждается. Было показано, что многие из тех, кто Арабидопсис взаимодействовать (часто существенно) с митохондрии и другие органеллы[2] и что они, возможно, участвуют в Редактирование РНК.[4] Однако для этого редактирования требуется много транс-белков, и исследования продолжают искать, какие белки необходимы.[5]
Структура ППР решена. Он складывается в спираль-поворот-спираль структура аналогична найденным в тетратрикопептид повторение. Несколько повторов белка образуют кольцо вокруг однониточная РНК молекула чувствительным к последовательности способом, напоминающим TAL эффекторы.[6]
Примеры
Человеческие гены, кодирующие белки, содержащие этот повтор, включают:
использованная литература
- ^ Mingler MK, Hingst AM, Clement SL, Yu LE, Reifur L, Koslowsky DJ (ноябрь 2006 г.). «Идентификация белков пентатрикопептидных повторов в Trypanosoma brucei». Мол. Biochem. Паразитол. 150 (1): 37–45. Дои:10.1016 / j.molbiopara.2006.06.006. PMID 16837079.
- ^ а б c Лурин С., Андрес С., Обург С., Беллауи М., Биттон Ф, Брюьер С., Кабош М., Дебаст С., Гуальберто Дж., Хоффманн Б., Лечарни А., Ле Рет М., Мартин-Магнетт М.Л., Миро Х., Петерс Н., Рену Дж. , Шурек Б., Таконнат Л., Малый I (август 2004 г.). «Полногеномный анализ белков пентатрикопептидных повторов Arabidopsis показывает их важную роль в биогенезе органелл». Растительная клетка. 16 (8): 2089–103. Дои:10.1105 / tpc.104.022236. ЧВК 519200. PMID 15269332.
- ^ О'Тул Н., Хаттори М., Андрес К., Иида К., Лурин С., Шмитц-Линневебер С., Сугита М., Смолл I. (июнь 2008 г.). «О распространении семейства генов пентатрикопептидных повторов в растениях». Мол. Биол. Evol. 25 (6): 1120–8. Дои:10.1093 / molbev / msn057. PMID 18343892.
- ^ Котера Э., Тасака М., Шиканай Т. (январь 2005 г.). «Повторяющийся белок пентатрикопептида необходим для редактирования РНК в хлоропластах». Природа. 433 (7023): 326–30. Дои:10.1038 / природа03229. PMID 15662426.
- ^ Такенака М., Вербицкий Д., Зехрманн А., Бреннике А. (июнь 2010 г.). «Обратный генетический скрининг выявляет пять PPR-белков E-класса, участвующих в редактировании РНК в митохондриях Arabidopsis Thaliana». J Biol Chem. 285 (35): 27122–27129. Дои:10.1074 / jbc.M110.128611. ЧВК 2930711. PMID 20566637.
- ^ Инь П, Ли Цюй, Ян Ц., Лю И, Лю Дж, Ю Ф и др. (Декабрь 2013). «Структурная основа для модульного распознавания одноцепочечной РНК белками PPR». Природа. 504 (7478): 168–71. Дои:10.1038 / природа12651. PMID 24162847.
 | Эта молекулярная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |