Пероксиредоксин 1 - Peroxiredoxin 1

PRDX1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2RII, 3HY2, 4XCS
Идентификаторы
Псевдонимы	PRDX1, MSP23, NKEF-A, NKEFA, PAG, PAGA, PAGB, PRX1, PRXI, TDPX2, пероксиредоксин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 176763 MGI: 99523 ГомолоГен: 99789 Генные карты: PRDX1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п34.1 Начните 45,511,036 бп[1] Конец 45,523,047 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • антиоксидантная активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность пероксиредоксина • идентичное связывание с белками • оксидоредуктазная активность • активность тиоредоксинпероксидазы • пероксидазная активность • Связывание РНК • связывание кадгерина Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • меланосома • миелин • митохондрия • внеклеточная экзосома • ядро клетки • внеклеточный матрикс • внеклеточный Биологический процесс • развитие скелетной системы • удаление супероксидных радикалов • ответ на окислительный стресс • гомеостаз сетчатки • гомеостаз эритроцитов • катаболический процесс перекиси водорода • клеточная пролиферация • окислительно-восстановительный процесс • регуляция стресс-активируемого каскада MAPK • цитотоксичность, опосредованная естественными клетками-киллерами • окислительно-восстановительный гомеостаз клеток • активация естественных клеток-киллеров • реакция на активные формы кислорода • клеточный ответ на окислительный стресс • регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • активация лейкоцитов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5052	18477
Ансамбль	ENSG00000117450	ENSMUSG00000028691
UniProt	Q06830	P35700
RefSeq (мРНК)	NM_181697 NM_001202431 NM_002574 NM_181696	NM_011034
RefSeq (белок)	NP_001189360 NP_002565 NP_859047 NP_859048	NP_035164
Расположение (UCSC)	Chr 1: 45.51 - 45.52 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Пероксиредоксин-1 это белок что у людей кодируется PRDX1 ген.^[4][5]

Функция

Этот ген кодирует член пероксиредоксин семейство антиоксидантных ферментов, восстанавливающих перекись водорода и алкилгидропероксиды ^[6]. Кодируемый белок может играть антиоксидантную защитную роль в клетках и может способствовать противовирусной активности CD8 (+) Т-клеток. Этот белок может иметь пролиферативный эффект и играть роль в развитии или прогрессировании рака. Для этого гена были идентифицированы три варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.^[5]

Взаимодействия

Пероксиредоксин 1 может взаимодействовать с участием PRDX4.^[7] Химиопротеомический подход показал, что пероксиредоксин 1 является основной мишенью теонелластерона.^[8]

Клиническое значение

Как ферменты, которые борются окислительный стресс, пероксиредоксины играют важную роль в здоровье и болезнях.^[9] Было показано, что пероксиредоксин 1 и пероксиредоксин 2 высвобождаются некоторыми клетками при стимуляции LPS или TNF-альфа.^[10] Высвобожденный пероксиредоксин может затем действовать, вызывая воспалительные процессы. цитокины.^[10] Уровни пероксиредоксина 1 повышены при раке поджелудочной железы, и он потенциально может действовать как маркер для диагностики и прогноза этого заболевания.^[11] В некоторых типах рак было установлено, что пероксиредоксин 1 действует как супрессор опухолей, а другие исследования показывают, что пероксиредоксин 1 сверхэкспрессируется при определенных раковых заболеваниях человека.^[12] Недавнее исследование показало, что пероксиредоксин 1 может играть роль в туморогенез путем регуляции пути mTOR / p70S6K при плоскоклеточном раке пищевода.^[12] Паттерны экспрессии пероксиредоксина 1 вместе с пероксиредоксином 4 вовлечены в злокачественное новообразование рака легких человека.^[13] Также было показано, что пероксиредоксин 1 может играть важную роль в патогенезе острого респираторного дистресс-синдрома из-за его роли в развитии воспаления.^[14]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000117450 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Проспери М.Т., Фербус Д., Карчински И., Губен Г. (май 1993 г.). «КДНК человека, соответствующая гену, сверхэкспрессируемому во время пролиферации клеток, кодирует продукт, имеющий гомологию с амебными и бактериальными белками». Журнал биологической химии. 268 (15): 11050–6. PMID  8496166.
5. «Энтрез Ген: пероксиредоксин 1 PRDX1».
6. Wu, C; Дай, Н; Ян, Л; Лю, Т; Cui, C; Чен, Т; Ли, Х (июль 2017 г.). «Сульфирование разделяющего цистеина в человеческом пероксиредоксине 1: комплексный масс-спектрометрический анализ». Свободная радикальная биология и медицина. 108: 785–792. Дои:10.1016 / j.freeradbiomed.2017.04.341. ЧВК  5564515. PMID  28450148.
7. Jin DY, Chae HZ, Rhee SG, Jeang KT (декабрь 1997 г.). «Регуляторная роль новой тиоредоксинпероксидазы человека в активации NF-kappaB». Журнал биологической химии. 272 (49): 30952–61. Дои:10.1074 / jbc.272.49.30952. PMID  9388242.
8. Маргаруччи Л., Монти М.С., Тоско А., Эспозито Р., Зампелла А., Сепе В., Моззикафреддо М., Риччио Р., Касапулло А. (январь 2015 г.). «Теонелластерон, стероидный метаболит, выделенный из губки Theonella, защищает пероксиредоксин-1 от реакций окислительного стресса». Химические коммуникации. 51 (9): 1591–3. Дои:10.1039 / c4cc09205h. PMID  25503482.
9. Эль Этер Э., Аль-Масри А.А. (май 2015 г.). «Изоформы пероксиредоксина связаны с факторами риска сердечно-сосудистых заболеваний при сахарном диабете 2 типа». Бразильский журнал медико-биологических исследований. 48 (5): 465–9. Дои:10.1590 / 1414-431X20144142. ЧВК  4445671. PMID  25742636.
10. Mullen L, Hanschmann EM, Lillig CH, Herzenberg LA, Ghezzi P (2015). «Окисление цистеина нацелено на пероксиредоксины 1 и 2 для высвобождения экзосом с помощью нового механизма окислительно-восстановительной секреции». Молекулярная медицина. 21: 98–108. Дои:10.2119 / молмед.2015.00033. ЧВК  4461588. PMID  25715249.
11. Cai CY, Zhai LL, Wu Y, Tang ZG (февраль 2015 г.). «Экспрессия и клиническое значение пероксиредоксина-1 у пациентов с раком поджелудочной железы». Европейский журнал хирургической онкологии. 41 (2): 228–35. Дои:10.1016 / j.ejso.2014.11.037. PMID  25434328.
12. Гун Ф, Хоу Г, Лю Х, Чжан М. (февраль 2015 г.). «Пероксиредоксин 1 способствует онкогенезу, регулируя активность пути mTOR / p70S6K при плоскоклеточном раке пищевода». Медицинская онкология. 32 (2): 455. Дои:10.1007 / s12032-014-0455-0. PMID  25579166.
13. Цзян Х., Ву Л., Мишра М., Чавшин Х.А., Вэй Кью (2014). «Экспрессия пероксиредоксина 1 и 4 способствует развитию рака легких у человека». Американский журнал исследований рака. 4 (5): 445–60. ЧВК  4163610. PMID  25232487.
14. Лю Д., Мао П, Хуан И, Лю И, Лю Х, Панг Х, Ли И (2014). «Протеомный анализ легочной ткани на модели острого повреждения легких у крыс: идентификация PRDX1 как промотора воспаления». Медиаторы воспаления. 2014: 1–14. Дои:10.1155/2014/469358. ЧВК  4082880. PMID  25024510.

дальнейшее чтение

• Вуд З.А., Шредер Э., Робин Харрис Дж., Пул Л.Б. (январь 2003 г.). «Структура, механизм и регуляция пероксиредоксинов». Тенденции в биохимических науках. 28 (1): 32–40. Дои:10.1016 / S0968-0004 (02) 00003-8. PMID  12517450.
• Саури Х., Баттерфилд Л., Ким А., Шау Х. (март 1995 г.). «Антиоксидантная функция рекомбинантного человеческого фактора усиления естественных киллеров». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 208 (3): 964–9. Дои:10.1006 / bbrc.1995.1428. PMID  7702627.
• Шау Х, Баттерфилд Л. Х., Чиу Р., Ким А. (1994). «Клонирование и анализ последовательности генов-кандидатов человеческого фактора увеличения естественных киллеров». Иммуногенетика. 40 (2): 129–34. Дои:10.1007 / BF00188176. PMID  8026862.
• Каваи С., Такешита С., Окадзаки М., Кикуно Р., Кудо А., Аманн Э. (апрель 1994 г.). «Клонирование и характеристика OSF-3, нового члена семейства MER5, экспрессируемого в остеобластических клетках мыши». Журнал биохимии. 115 (4): 641–3. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124388. PMID  8089076.
• Шау Х., Ким А. (февраль 1994 г.). «Идентификация фактора повышения естественного киллера как основного антиоксиданта в красных кровяных тельцах человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 199 (1): 83–8. Дои:10.1006 / bbrc.1994.1197. PMID  8123050.
• Проспери М. Т., Апиу Ф, Дютрийо Б., Губен Дж. (Январь 1994 г.). «Организация и хромосомная принадлежность двух локусов человеческого гена PAG: PAGA, кодирующего функциональный ген, и PAGB, процессированного псевдогена». Геномика. 19 (2): 236–41. Дои:10.1006 / geno.1994.1053. PMID  8188254.
• Вен С.Т., Ван Эттен Р.А. (октябрь 1997 г.). «Продукт гена PAG, стресс-индуцированный белок с антиоксидантными свойствами, представляет собой Abl SH3-связывающий белок и физиологический ингибитор активности тирозинкиназы c-Abl». Гены и развитие. 11 (19): 2456–67. Дои:10.1101 / gad.11.19.2456. ЧВК  316562. PMID  9334312.
• Jin DY, Chae HZ, Rhee SG, Jeang KT (декабрь 1997 г.). «Регуляторная роль новой тиоредоксинпероксидазы человека в активации NF-kappaB». Журнал биологической химии. 272 (49): 30952–61. Дои:10.1074 / jbc.272.49.30952. PMID  9388242.
• Оутинен П.А., Суд С.К., Пфайфер С.И., Памиди С., Подор Т.Дж., Ли Дж., Вайц Д.И., Остин Р.К. (август 1999 г.). «Стресс эндоплазматического ретикулума, вызванный гомоцистеином, и остановка роста приводят к специфическим изменениям в экспрессии генов в эндотелиальных клетках сосудов человека». Кровь. 94 (3): 959–67. Дои:10.1182 / blood.V94.3.959.415k20_959_967. PMID  10419887.
• Янагава Т., Исикава Т., Исии Т., Табучи К., Иваса С., Баннаи С., Омура К., Судзуки Х., Ёсида Х. (октябрь 1999 г.). «Экспрессия пероксиредоксина I в опухолях щитовидной железы человека». Письма о раке. 145 (1–2): 127–32. Дои:10.1016 / S0304-3835 (99) 00243-8. PMID  10530780.
• Но Д.Й., Ан С.Дж., Ли Р.А., Ким С.В., Парк И.А., Чае Х.З. (2001). «Сверхэкспрессия пероксиредоксина при раке груди человека». Противораковые исследования. 21 (3B): 2085–90. PMID  11497302.
• Xu XR, Huang J, Xu ZG, Qian BZ, Zhu ZD, Yan Q, Cai T, Zhang X, Xiao HS, Qu J, Liu F, Huang QH, Cheng ZH, Li NG, Du JJ, Hu W, Shen KT , Лу Г, Фу Г, Чжун М, Сюй Ш, Гу Вай, Хуанг У, Чжао XT, Ху ГХ, Гу Дж. Р., Чен З, Хан Ц. (декабрь 2001 г.). «Понимание гепатоцеллюлярного канцерогенеза на уровне транскриптома путем сравнения профилей экспрессии генов гепатоцеллюлярной карциномы с профилями соответствующей доброкачественной печени». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (26): 15089–94. Bibcode:2001PNAS ... 9815089X. Дои:10.1073 / pnas.241522398. ЧВК  64988. PMID  11752456.
• Ким С.Х., Фунтулакис М., Кэрнс Н., Любек Г. (2002). Уровни протеина подтипов пероксиредоксина человека в головном мозге пациентов с болезнью Альцгеймера и синдромом Дауна. Журнал нейронной передачи. Дополнение. С. 223–35. Дои:10.1007/978-3-7091-6262-0_18. ISBN  978-3-211-83704-7. PMID  11771746.
• Рабийуд Т., Хеллер М., Гаснье Ф., Люче С., Рей С., Эберсолд Р., Бенахмед М., Луизо П., Лунарди Дж. (Май 2002 г.). «Протеомический анализ клеточного ответа на окислительный стресс. Доказательства избыточного окисления пероксиредоксинов in vivo в их активном центре». Журнал биологической химии. 277 (22): 19396–401. Дои:10.1074 / jbc.M106585200. PMID  11904290.
• Чанг Т.С., Чон В., Чхве С.И., Ю С., Кан С.В., Ри С.Г. (июль 2002 г.). «Регулирование активности пероксиредоксина I с помощью Cdc2-опосредованного фосфорилирования». Журнал биологической химии. 277 (28): 25370–6. Дои:10.1074 / jbc.M110432200. PMID  11986303.
• Wagner E, Luche S, Penna L, Chevallet M, Van Dorsselaer A, Leize-Wagner E, Rabilloud T (сентябрь 2002 г.). «Метод обнаружения избыточного окисления цистеинов: пероксиредоксины окисляются in vivo в цистеине активного центра во время окислительного стресса». Биохимический журнал. 366 (Pt 3): 777–85. Дои:10.1042 / BJ20020525. ЧВК  1222825. PMID  12059788.
• Шен К., Натан К. (февраль 2002 г.). «Неизбыточная антиоксидантная защита множеством двухцистеиновых пероксиредоксинов в клетках рака простаты человека». Молекулярная медицина. 8 (2): 95–102. Дои:10.1007 / BF03402079. ЧВК  2039972. PMID  12080185.
• Ян К.С., Кан С.В., Ву Х.А., Хван С.К., Чае Х.З., Ким К., Ри С.Г. (октябрь 2002 г.). «Инактивация пероксиредоксина I человека во время катализа в результате окисления цистеина каталитического сайта до цистеин-сульфиновой кислоты». Журнал биологической химии. 277 (41): 38029–36. Дои:10.1074 / jbc.M206626200. PMID  12161445.
• Гейбен-Линн Р., Курсар М., Браун Н.В., Аддо М.М., Шау Х., Либерман Дж., Блеск А.Д., Уокер Б.Д. (январь 2003 г.). «Противовирусная активность ВИЧ-1 рекомбинантных факторов, усиливающих естественные клетки-киллеры, NKEF-A и NKEF-B, членов семейства пероксиредоксинов». Журнал биологической химии. 278 (3): 1569–74. Дои:10.1074 / jbc.M209964200. PMID  12421812.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q06830 (Пероксиредоксин-1) в PDBe-KB.