RABAC1 - RABAC1

RABAC1
Идентификаторы
Псевдонимы	RABAC1, PRA1, PRAF1, YIP3, акцептор Rab 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 604925 MGI: 1201692 ГомолоГен: 38182 Генные карты: RABAC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.2 Начните 41,956,681 бп[1] Конец 41,959,321 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 A3 Начните 24,969,752 бп[2] Конец 24,972,754 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10567	14470
Ансамбль	ENSG00000105404	ENSMUSG00000003380
UniProt	Q9UI14	Q9Z0S9
RefSeq (мРНК)	NM_006423	NM_010261
RefSeq (белок)	NP_006414	NP_034391
Расположение (UCSC)	Chr 19: 41.96 - 41.96 Мб	Chr 7: 24.97 - 24.97 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

RABAC1 это ген что у людей кодирует белок Пренилированный акцептор Rab 1, также называемый PRA1, PRAF1 или RABAC1.^[5][6][7] Он очень консервативен у эукариот.^[5] Белок локализован на Гольджи.^[8] и поздние эндосомы,^[9] где он играет роль в везикулярном переносе, транспорте липидов и миграции клеток.^[10]

Взаимодействия

RABAC1 был показан взаимодействовать с многочисленными пренилированными членами Rab GTPase семья^[5][11][12] и ВАМП2.^[12]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105404 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003380 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Bucci C, Chiariello M, Lattero D, Maiorano M, Bruni CB (май 1999 г.). «Клонирование взаимодействия и характеристика кДНК, кодирующей пренилированный человеческий акцептор Rab (PRA1)». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 258 (3): 657–62. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0651. PMID  10329441.
6. Хатт Д.М., Да-Силва Л.Ф., Чанг Л.Х., Проссер, округ Колумбия, Нгзее, JK (июнь 2000 г.). «PRA1 ингибирует экстракцию мембраносвязанной GTPase Rab с помощью GDI1». Журнал биологической химии. 275 (24): 18511–9. Дои:10.1074 / jbc.M909309199. PMID  10751420.
7. «Ген Entrez: RABAC1 Rab акцептор 1 (пренилированный)».
8. Abdul-Ghani M, Gougeon PY, Prosser DC, Da-Silva LF, Ngsee JK (март 2001 г.). «Изоформы PRA нацелены на отдельные мембранные компартменты». Журнал биологической химии. 276 (9): 6225–33. Дои:10.1074 / jbc.M009073200. PMID  11096102.
9. Сиварс У., Айвазян Д., Пфеффер С.Р. (октябрь 2003 г.). «Yip3 катализирует диссоциацию эндосомальных комплексов Rab-GDI». Природа. 425 (6960): 856–9. Bibcode:2003Натура.425..856С. Дои:10.1038 / природа02057. PMID  14574414. S2CID  4421009.
10. Лю HP, Wu CC, Kao HY, Huang YC, Liang Y, Chen CC, Yu JS, Chang YS (март 2011 г.). «Нарушение регуляции протеома за счет истощения PRA1 подчеркивает роль PRA1 в транспорте липидов и миграции клеток». Молекулярная и клеточная протеомика. 10 (3): M900641 – MCP200. Дои:10.1074 / mcp.M900641-MCP200. ЧВК  3047168. PMID  20592422.
11. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
12. Мартинчич И., Перальта, ME, Нгзее, Дж. К. (октябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика двойного пренилированного рецептора Rab и VAMP2». Журнал биологической химии. 272 (43): 26991–8. Дои:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID  9341137.

дальнейшее чтение

• Мартинчич И., Перальта, ME, Нгзее, Дж. К. (октябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика двойного пренилированного рецептора Rab и VAMP2». Журнал биологической химии. 272 (43): 26991–8. Дои:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID  9341137.
• Фенстер С.Д., Чунг В.Дж., Чжай Р., Кейз-Лангхофф С., Восс Б., Гарнер А.М., Кемпф Ю., Киндлер С., Гундельфингер Е.Д., Гарнер С.К. (январь 2000 г.). «Piccolo, пресинаптический белок цинкового пальца, структурно связанный с фаготом». Нейрон. 25 (1): 203–14. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80883-1. PMID  10707984.
• Фигероа С., Тейлор Дж., Войтек А.Б. (июль 2001 г.). «Пренилированный акцепторный белок Rab представляет собой рецептор для пренилированных малых GTPases». Журнал биологической химии. 276 (30): 28219–25. Дои:10.1074 / jbc.M101763200. PMID  11335720.
• Буччи К., Де Грегорио Л., Бруни С.Б. (август 2001 г.). «Анализ экспрессии и хромосомное определение генов PRA1 и RILP». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 286 (4): 815–9. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5466. PMID  11520070.
• Evans DT, Tillman KC, Desrosiers RC (январь 2002 г.). «Цитоплазматические домены гликопротеина оболочки из различных лентивирусов взаимодействуют с пренилированным акцептором Rab». Журнал вирусологии. 76 (1): 327–37. Дои:10.1128 / JVI.76.1.327-337.2002. ЧВК  135700. PMID  11739697.
• Blancou P, Evans DT, Desrosiers RC (июнь 2005 г.). «PRA1 совместно локализуется с оболочкой, но не влияет на продукцию лентивируса приматов, инфекционность или включение оболочки». Журнал общей вирусологии. 86 (Pt 6): 1785–90. Дои:10.1099 / vir.0.80873-0. PMID  15914857.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. PMID  16169070.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Fo CS, Coleman CS, Wallick CJ, Vine AL, Bachmann AS (апрель 2006 г.). «Геномная организация, профиль экспрессии и характеристика нового семейства доменов белка PRA1, член 2 (PRAF2)». Ген. 371 (1): 154–65. Дои:10.1016 / j.gene.2005.12.009. PMID  16481131.
• Лю HP, Wu CC, Chang YS (сентябрь 2006 г.). «PRA1 способствует внутриклеточному перемещению и передаче сигналов NF-kappaB латентного мембранного белка 1 EBV». Журнал EMBO. 25 (17): 4120–30. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601282. ЧВК  1560356. PMID  16917502.
• Kim JT, Cho MY, Choi SC, Kim JW, Chae SK, Yoon DY, Kim JW, Lim JS (октябрь 2006 г.). «Пренилированный акцептор Rab 1 (PRA1) ингибирует передачу сигналов TCF / бета-катенин путем связывания с бета-катенином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 349 (1): 200–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.08.026. PMID  16930546.
• Дикисон В.М., Ричмонд А.М., Абу Иркеба А., Мартак Дж. Г., Хоге С. К., Брукс М. Дж., Осман М. И., Ханна Р., Мирс А. Дж., Чоудхури А. Ю., Сваруп А., Огилви Дж. М. (2012). «Роль пренилированного акцептора Rab 1 в развитии фоторецепторов позвоночных». BMC Neuroscience. 13: 152. Дои:10.1186/1471-2202-13-152. ЧВК  3576285. PMID  23241222.