ВАМП2 - VAMP2 - Wikipedia

ВАМП2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3FIE, 3FII, 3РК2, 3RK3, 3RL0
Идентификаторы
Псевдонимы	ВАМП2, SYB2, VAMP-2, мембранный белок 2, связанный с везикулами, NEDHAHM
Внешние идентификаторы	OMIM: 185881 MGI: 1313277 ГомолоГен: 7591 Генные карты: ВАМП2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17p13.1 Начинать 8,159,149 бп[1] Конец 8,163,546 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B3 Начинать 69,088,490 бп[2] Конец 69,092,384 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Активность рецептора SNAP • самоассоциация белков • GO: 0001948 связывание с белками • привязка синтаксина-1 • Привязка SNARE • связывание кальмодулина • связывание синтаксина • связывание фосфолипидов • кальций-зависимое связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • цитозоль • клатриновая мембрана транспортной везикулы моноаминов • мембрана • секреторная мембрана гранул • клеточная мембрана • клатриновая мембрана транспортных везикул гамма-аминомасляной кислоты • синапс • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • мембрана синаптических везикул • мембрана из гранул зимогена • соединение клеток • проекция нейрона • цитоплазматический пузырек • везикула, покрытая клатрином • клатрин-скульптурная мембрана везикулы транспорта глутамата • секреторная гранула • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • комплекс синаптобревин 2-SNAP-25-синтаксин-1a-комплексин I • комплекс синаптобревин 2-SNAP-25-синтаксин-1а • Комплекс SNARE • комплекс синаптобревин 2-SNAP-25-синтаксин-1a-комплексин II • комплекс потенциалозависимых калиевых каналов • сеть транс-Гольджи • синаптический пузырек • везикул • перинуклеарная область цитоплазмы • конец проекции нейрона • мембрана везикул, покрытая клатрином Биологический процесс • естественная дегрануляция клеток-киллеров • секреция слизи • регуляция секреции гистамина тучными клетками • дегрануляция нейтрофилов • секреция глутамата • слияние пузырьков • дегрануляция эозинофилов • везикулярный транспорт • экзоцитоз • ответ на глюкозу • Слияние липидного бислоя • регулирование активности калиевых каналов задержанного выпрямителя • экзоцитоз, регулируемый ионами кальция • регуляция экзоцитоза • положительная регуляция внутриклеточного транспорта белков • транспорт белка • Гольджи к транспорту белков плазматической мембраны • экзоцитоз синаптических пузырьков • клеточный ответ на стимул инсулина • длительная синаптическая потенциация • регуляция опосредованного пузырьками транспорта • мембранная организация • сборка макромолекулярного комплекса • пост-Гольджи-опосредованный везикулами транспорт • GO: 0010554 секреция нейротрансмиттера Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6844	22318
Ансамбль	ENSG00000220205	ENSMUSG00000020894
UniProt	P63027	P63044
RefSeq (мРНК)	NM_014232 NM_001330125	NM_009497
RefSeq (белок)	NP_001317054 NP_055047	NP_033523
Расположение (UCSC)	Chr 17: 8.16 - 8.16 Мб	Chr 11: 69.09 - 69.09 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гипотетические модели конформаций VAMP2 и участие в сборке комплекса SNARE для высвобождения нейромедиатора

Связанный с пузырьками мембранный белок 2 (ВАМП2) это белок что у людей кодируется ВАМП2 ген.^[5][6]

Функция

Синаптобревины / ВАМП, синтаксины, и белок, связанный с синаптосомами массой 25 кДа SNAP25 являются основными компонентами белкового комплекса, участвующего в стыковке и / или слиянии синаптические везикулы с пресинаптической мембраной. VAMP2 является членом мембранный белок, связанный с пузырьками (ВАМП) / семейство синаптобревинов. Предполагается, что VAMP2 участвует в нейротрансмиттер выпуск на этапе между стыковкой и слияние. Мыши, лишенные функционального гена synaptobrevin2 / VAMP2, не могут выжить после рождения и имеют резко сниженную синаптическую передачу, около 10% от контроля.^[7] Белок образует стабильный комплекс с синтаксином, белком, связанным с синаптосомами, 25 кДа и комплексин. Он также образует особый комплекс с синаптофизин.^[6]

Клиническое значение

Гетерозиготный мутации в VAMP2 вызывают расстройство нервного развития с гипотония и аутичный особенности (с или без гиперкинетические движения ).^[8][9][10]

Взаимодействия

VAMP2 был показан взаимодействовать с:

• RABAC1,^[11]
• SNAP-25,^[12][13][14]
• SNAP23,^[15][16][17]
• STX1A,^{[13][14][18][19][20][21]} и
• STX4.^{[15][22][23][24]}

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000220205 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020894 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Арчер Б.Т., Озчелик Т., Ян Р., Франк У., Зюдхоф ТЦ (октябрь 1990 г.). «Структуры и хромосомные локализации двух генов человека, кодирующих синаптобревины 1 и 2». Журнал биологической химии. 265 (28): 17267–73. PMID  1976629.
6. «Ген Entrez: мембранный белок 2, связанный с пузырьками VAMP2 (синаптобревин 2)».
7. Шох С., Деак Ф., Кенигсторфер А., Можаева М., Сара Й., Зюдхоф ТЦ, Кавалали Е.Т. (ноябрь 2001 г.). «Функция SNARE проанализирована у мышей с нокаутом по синаптобревину / VAMP». Наука. 294 (5544): 1117–22. Bibcode:2001Научный ... 294.1117С. Дои:10.1126 / science.1064335. PMID  11691998. S2CID  40321111.
8. Salpietro V, Malintan NT, Llano-Rivas I, et al. (Апрель 2019). «Мутации в нервном пузыре SNARE VAMP2 влияют на слияние синаптических мембран и нарушают нейроразвитие человека». Американский журнал генетики человека. 104 (4): 721‐730. Дои:10.1016 / j.ajhg.2019.02.016. ЧВК  6451933. PMID  30929742.
9. Сунага Ю., Мурамацу К., Косаки К. и др. (Апрель 2020 г.). «Вариант нейронального везикулярного SNARE VAMP2 (синаптобревин-2): первое сообщение в Японии». Мозг и развитие. 42 (7): 529–533. Дои:10.1016 / j.braindev.2020.04.001. PMID  32336483. S2CID  216095891.
10. «Запись OMIM: расстройство нервного развития с гипотонией и аутизмом с гиперкинетическими движениями или без них».
11. Мартинчич И., Перальта, ME, Нгзее, Дж. К. (октябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика двойного пренилированного рецептора Rab и VAMP2». Журнал биологической химии. 272 (43): 26991–8. Дои:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID  9341137.
12. Ли Й, Чин Л.С., Вейгель К., Ли Л. (ноябрь 2001 г.). «Spring, новый белок пальца RING, регулирующий экзоцитоз синаптических везикул». Журнал биологической химии. 276 (44): 40824–33. Дои:10.1074 / jbc.M106141200. PMID  11524423.
13. Хао Дж. К., Салем Н., Пэн XR, Келли Р. Б., Беннет М. К. (март 1997 г.). «Влияние мутаций в везикулярно-ассоциированном мембранном белке (VAMP) на сборку мультимерных белковых комплексов». Журнал неврологии. 17 (5): 1596–603. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.17-05-01596.1997. ЧВК  6573372. PMID  9030619.
14. Чен X, Томчик Д.Р., Ковригин Э., Арак Д., Мачиус М., Зюдхоф ТК, Ризо Дж. (Январь 2002 г.). «Трехмерная структура комплекса комплексин / SNARE». Нейрон. 33 (3): 397–409. Дои:10.1016 / s0896-6273 (02) 00583-4. PMID  11832227. S2CID  17878965.
15. Paumet F, Le Mao J, Martin S, Galli T, David B, Blank U, Roa M (июнь 2000 г.). «Растворимые рецепторы белка прикрепления NSF (SNAREs) в тучных клетках RBL-2H3: функциональная роль синтаксина 4 в экзоцитозе и идентификация секреторного компартмента, содержащего мембранный белок 8, связанный с везикулами». Журнал иммунологии. 164 (11): 5850–7. Дои:10.4049 / jimmunol.164.11.5850. PMID  10820264.
16. Имаи А., Нашида Т., Йоши С., Шимомура Х. (август 2003 г.). «Внутриклеточная локализация белков SNARE в ацинарных клетках околоушной железы крысы: комплексы SNARE на апикальной плазматической мембране». Архивы оральной биологии. 48 (8): 597–604. Дои:10.1016 / с0003-9969 (03) 00116-х. PMID  12828989.
17. Каваниси М., Тамори Ю., Окадзава Х., Араки С., Шинода Х., Касуга М. (март 2000 г.). «Роль SNAP23 в инсулино-индуцированной транслокации GLUT4 в адипоцитах 3T3-L1. Опосредование образования комплекса между синтаксином4 и VAMP2». Журнал биологической химии. 275 (11): 8240–7. Дои:10.1074 / jbc.275.11.8240. PMID  10713150.
18. Дулубова И., Сугита С., Хилл С., Хосака М., Фернандес И., Зюдхоф ТК, Ризо Дж. (Август 1999 г.). «Конформационный переключатель синтаксина во время экзоцитоза: роль munc18». Журнал EMBO. 18 (16): 4372–82. Дои:10.1093 / emboj / 18.16.4372. ЧВК  1171512. PMID  10449403.
19. McMahon HT, Missler M, Li C, Südhof TC (октябрь 1995 г.). «Комплексины: цитозольные белки, регулирующие функцию рецептора SNAP». Клетка. 83 (1): 111–9. Дои:10.1016/0092-8674(95)90239-2. PMID  7553862. S2CID  675343.
20. Перес-Брангули Ф., Мухайсен А., Блази Дж. (Июнь 2002 г.). «Связывание Munc 18a с изоформами синтаксина 1A и 1B определяет его локализацию на плазматической мембране и блокирует сборку SNARE в трехгибридном системном анализе». Молекулярная и клеточная нейронауки. 20 (2): 169–80. Дои:10.1006 / mcne.2002.1122. PMID  12093152. S2CID  23927545.
21. Маргиттай М., Отто Х., Ян Р. (март 1999 г.). «Стабильное взаимодействие между синтаксином 1a и синаптобревином 2, опосредованное их трансмембранными доменами». Письма FEBS. 446 (1): 40–4. Дои:10.1016 / s0014-5793 (99) 00028-9. PMID  10100611. S2CID  9115709.
22. Моллинедо Ф., Мартин-Мартин Б., Калафат Дж., Набокина С.М., Лазо, Пенсильвания (январь 2003 г.). "Роль связанного с везикулами мембранного белка-2 через Q-растворимый N-этилмалеимид-чувствительный фактор присоединения рецептора белка / R-растворимый N-этилмалеимид-чувствительный фактор взаимодействия рецептора белка прикрепления в экзоцитозе специфических и третичных гранул нейтрофилов человека ". Журнал иммунологии. 170 (2): 1034–42. Дои:10.4049 / jimmunol.170.2.1034. PMID  12517971.
23. Джагадиш М.Н., Фернандес С.С., Хьюиш Д.Р., Маколей С.Л., Гоф К.Х., Грусовин Дж., Веркейлен А., Косгроув Л., Алафачи А., Френкель М.Дж., Уорд К.В. (август 1996 г.). «Чувствительные к инсулину ткани содержат изоформы А и В основного комплексного белка SNAP-25 (синаптосомно-связанный белок 25) в дополнение к синтаксину 4 и синаптобревинам 1 и 2». Биохимический журнал. 317. 317 (3): 945–54. Дои:10.1042 / bj3170945. ЧВК  1217577. PMID  8760387.
24. Рид Г.Л., Хунг А.К., Фицджеральд М.Л. (апрель 1999 г.). «Человеческие тромбоциты содержат белки SNARE и гомолог Sec1p, который взаимодействует с синтаксином 4 и фосфорилируется после активации тромбина: последствия для секреции тромбоцитов». Кровь. 93 (8): 2617–26. Дои:10.1182 / кровь.V93.8.2617. PMID  10194441.

дальнейшее чтение

• Брумелл Дж. Х., Волчук А., Сенгелов Х., Боррегаард Н., Сьютат А. М., Бейнтон Д. Ф., Гринштейн С., Клип А. (декабрь 1995 г.). «Субклеточное распределение стыковочных / гибридных белков в нейтрофилах, секреторных клетках с множественными экзоцитарными компартментами». Журнал иммунологии. 155 (12): 5750–9. PMID  7499863.
• Кутай У., Анерт-Хильгер Г., Хартманн Э., Виденманн Б., Рапопорт Т.А. (январь 1995 г.). «Транспортный путь синаптобревина через новый путь встраивания в мембрану эндоплазматического ретикулума». Журнал EMBO. 14 (2): 217–23. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb06994.x. ЧВК  398073. PMID  7835332.
• Чапман Э. Р., Ан С., Бартон Н., Ян Р. (ноябрь 1994 г.). «SNAP-25, t-SNARE, который связывается как с синтаксином, так и с синаптобревином через домены, которые могут образовывать спиральные спирали». Журнал биологической химии. 269 (44): 27427–32. PMID  7961655.
• Hunt JM, Bommert K, Charlton MP, Kistner A, Habermann E, Augustine GJ, Betz H (июнь 1994 г.). «Пост-докинг роль синаптобревина в слиянии синаптических пузырьков». Нейрон. 12 (6): 1269–79. Дои:10.1016 / 0896-6273 (94) 90443-Х. PMID  8011337. S2CID  799315.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Джагадиш М.Н., Фернандес С.С., Хьюиш Д.Р., Маколей С.Л., Гоф К.Х., Грусовин Дж., Веркейлен А., Косгроув Л., Алафачи А., Френкель М.Дж., Уорд К.В. (август 1996 г.). «Чувствительные к инсулину ткани содержат изоформы А и В основного комплексного белка SNAP-25 (синаптосомно-связанный белок 25) в дополнение к синтаксину 4 и синаптобревинам 1 и 2». Биохимический журнал. 317. 317 (3): 945–54. Дои:10.1042 / bj3170945. ЧВК  1217577. PMID  8760387.
• Мандон Б., Чжоу С.Л., Нильсен С., Неппер М.А. (август 1996 г.). «Синтаксин-4 локализован на апикальной плазматической мембране клеток собирательного канала почек крыс: возможная роль в транспортировке аквапорина-2». Журнал клинических исследований. 98 (4): 906–13. Дои:10.1172 / JCI118873. ЧВК  507504. PMID  8770861.
• Тиммерс К.И., Кларк А.Э., Омацу-Канбе М., Уайтхарт С.В., Беннетт М.К., Холман Г.Д., Кушман С.З. (декабрь 1996 г.). «Идентификация рецепторов SNAP во фракциях мембран жировых клеток крыс и в комплексах SNARE, коиммунопреципитированных с меченным эпитопом N-этилмалеимид-чувствительным гибридным белком». Биохимический журнал. 320. 320 (2): 429–36. Дои:10.1042 / bj3200429. ЧВК  1217948. PMID  8973549.
• Бец А., Окамото М., Бенселер Ф., Брозе Н. (январь 1997 г.). «Прямое взаимодействие крысиного гомолога unc-13 Munc13-1 с N-концом синтаксина». Журнал биологической химии. 272 (4): 2520–6. Дои:10.1074 / jbc.272.4.2520. PMID  8999968.
• Хао Дж. К., Салем Н., Пэн XR, Келли Р. Б., Беннет М. К. (март 1997 г.). «Влияние мутаций в везикулярно-ассоциированном мембранном белке (VAMP) на сборку мультимерных белковых комплексов». Журнал неврологии. 17 (5): 1596–603. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.17-05-01596.1997. ЧВК  6573372. PMID  9030619.
• Мартинчич И., Перальта, ME, Нгзее, Дж. К. (октябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика двойного пренилированного рецептора Rab и VAMP2». Журнал биологической химии. 272 (43): 26991–8. Дои:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID  9341137.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Weir ML, Klip A, Trimble WS (июль 1998 г.). «Идентификация человеческого гомолога ассоциированного с везикулярным мембранным белком (VAMP) белка 33 кДа (VAP-33): широко экспрессируемого белка, который связывается с VAMP». Биохимический журнал. 333. 333 (2): 247–51. Дои:10.1042 / bj3330247. ЧВК  1219579. PMID  9657962.
• Изенманн С., Хью-Гудолл Ю., Гэмбл Дж., Вадас М., Ваттенберг Б.В. (июль 1998 г.). «Изоформа сплайсинга мембранного протеина-1, ассоциированного с везикулами (VAMP-1), содержит сигнал нацеливания на митохондрии». Молекулярная биология клетки. 9 (7): 1649–60. Дои:10.1091 / mbc.9.7.1649. ЧВК  25402. PMID  9658161.
• Прекерис Р., Клумперман Дж., Чен Ю.А., Шеллер Р.Х. (ноябрь 1998 г.). «Синтаксин 13 опосредует цикл белков плазматической мембраны через эндосомы, реализующие тубуловезикулярную систему». Журнал клеточной биологии. 143 (4): 957–71. Дои:10.1083 / jcb.143.4.957. ЧВК  2132958. PMID  9817754.
• Нисимура Й., Хаяси М., Инада Х., Танака Т. (январь 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика гомологов млекопитающих ассоциированных с везикулами мембранных белков-ассоциированных (VAMP-ассоциированных) белков». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 254 (1): 21–6. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9876. PMID  9920726.
• Valdez AC, Cabaniols JP, Brown MJ, Roche PA (март 1999 г.). «Синтаксин 11 связан с SNAP-23 на поздних эндосомах и в сети транс-Гольджи». Журнал клеточной науки. 112. 112 (6): 845–54. PMID  10036234.
• Маргиттай М., Отто Х., Ян Р. (март 1999 г.). «Стабильное взаимодействие между синтаксином 1a и синаптобревином 2, опосредованное их трансмембранными доменами». Письма FEBS. 446 (1): 40–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00028-9. PMID  10100611. S2CID  9115709.
• Фасшауэр Д., Антонин В., Маргиттай М., Пабст С., Ян Р. (май 1999 г.). «Смешанные и неродственные комплексы SNARE. Характеристика сборки и биофизических свойств». Журнал биологической химии. 274 (22): 15440–6. Дои:10.1074 / jbc.274.22.15440. PMID  10336434.