RAB3A - RAB3A

Эта статья о гене человека. Для жеста руки см. Знак рабии.

RAB3A
Идентификаторы
Псевдонимы	RAB3A, член семейства онкогенов РАН
Внешние идентификаторы	OMIM: 179490 MGI: 97843 ГомолоГен: 20629 Генные карты: RAB3A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19п13.11 Начинать 18,196,784 бп[1] Конец 18,204,042 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 B3.3 | 8 34,15 см Начинать 70,754,679 бп[2] Конец 70,758,677 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание АТФазы • Связывание GTP • связывание миозина V • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • Активность активатора АТФазы • GTP-зависимое связывание с белками • ГТФазная активность • Связывание с ингибитором диссоциации GDP Сотовый компонент • внеклеточный пузырек • эндосома • клатриновая мембрана транспортной везикулы моноаминов • мембрана • синаптический пузырек • клеточная мембрана • клатриновая мембрана транспортных везикул гамма-аминомасляной кислоты • клатрин-скульптурная мембрана транспортных везикул ацетилхолина • аксон • терминальный бутон • Акросома • внутриклеточная органелла • клатрин-скульптурная мембрана везикулы транспорта глутамата • цитозоль • секреторная мембрана гранул • закрепленный компонент мембраны синаптического пузырька • везикул • макромолекулярный комплекс • пресинаптическая активная зона • секреторная гранула • перинуклеарная область цитоплазмы Биологический процесс • процесс дыхательной системы • положительная регуляция активности АТФазы • аксоногенез • развитие легких • экзоцитоз синаптических пузырьков • регуляция кратковременной синаптической пластичности нейронов • вызванная секреция нейромедиаторов • митохондриальная организация • ответ на электрический раздражитель • постэмбриональное развитие • конститутивный секреторный путь • поддержание структуры пресинаптической активной зоны • секреция глутамата • регуляция экзоцитоза • регуляция слияния синаптических пузырьков с мембраной пресинаптической активной зоны • нервно-мышечная синаптическая передача • рециклинг синаптических пузырьков • сенсорное восприятие прикосновения • транспорт белка • положительная регуляция экзоцитоза • созревание синаптических пузырьков • GO: 0010554 секреция нейротрансмиттера • положительная регуляция регулируемого секреторного пути • экзоцитоз • дегрануляция нейтрофилов • посттрансляционная модификация • транспорт • внутриклеточный транспорт белка • стыковка пузырьков, участвующих в экзоцитозе • секреция белка • Передача сигнала белка Rab • локализация белка на плазматической мембране • восстановление плазматической мембраны • регуляция прайминга синаптических пузырьков • транспорт синаптических пузырьков • экзоцитоз акросомных пузырьков • регуляция экзоцитоза синаптических везикул • экзоцитоз, регулируемый ионами кальция • кластеризация синаптических пузырьков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5864	19339
Ансамбль	ENSG00000105649	ENSMUSG00000031840
UniProt	P20336	P63011
RefSeq (мРНК)	NM_002866	NM_001166399 NM_009001 NM_001328047
RefSeq (белок)	NP_002857 NP_002857.1	NP_001159871 NP_001314976 NP_033027 NP_001365821 NP_001365822
Расположение (UCSC)	Chr 19: 18,2 - 18,2 Мб	Chr 8: 70,75 - 70,76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Связанный с Ras белок Rab-3A это белок что у людей кодируется RAB3A ген.^[5][6][7] Он участвует в вызываемом кальцием экзоцитозе в нейронах.

Взаимодействия

Было показано, что RAB3A взаимодействовать с:

• RIMS1,^[8][9]
• UNC13A,^[10]
• RPH3A,^[8][11][12] и
• CHM.^[13][14]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105649 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031840 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Rousseau-Merck MF, Zahraoui A, Bernheim A, Touchot N, Miglierina R, Tavitian A, Berger R (январь 1990 г.). «Картирование хромосомы человеческого гена rab3A, связанного с ras, в 19p13.2». Геномика. 5 (4): 694–8. Дои:10.1016/0888-7543(89)90110-9. PMID  2687157.
6. Brondyk WH, McKiernan CJ, Fortner KA, Stabila P, Holz RW, Macara IG (март 1995 г.). «Клонирование взаимодействия Rabin3, нового белка, который связывается с Ras-подобной GTPase Rab3A». Mol Cell Biol. 15 (3): 1137–43. Дои:10.1128 / MCB.15.3.1137. ЧВК  230335. PMID  7532276.
7. «Ген Entrez: RAB3A RAB3A, член семейства онкогенов RAS».
8. Фукуда М (апрель 2003 г.). «Отчетливая Rab-специфичность связывания Rim1, Rim2, рабфилина и Noc2. Идентификация критической детерминанты распознавания Rab3A / Rab27A с помощью Rim2». J. Biol. Chem. 278 (17): 15373–80. Дои:10.1074 / jbc.M212341200. PMID  12578829.
9. Бец А., Такур П., Юнге Х. Дж., Эшери У., Ри Дж. С., Шойс В., Розенмунд С., Реттиг Дж., Брозе Н. (апрель 2001 г.). «Функциональное взаимодействие белков активной зоны Munc13-1 и RIM1 при праймировании синаптических везикул». Нейрон. 30 (1): 183–96. Дои:10.1016 / s0896-6273 (01) 00272-0. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-F596-C. PMID  11343654. S2CID  155875.
10. «Белок unc-13 гомолог A». UniProt.
11. Остермайер С., Брюнгер А.Т. (февраль 1999 г.). «Структурная основа эффекторной специфичности Rab: кристаллическая структура небольшого G-белка Rab3A в комплексе с эффекторным доменом рабфилина-3A». Клетка. 96 (3): 363–74. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80549-8. PMID  10025402. S2CID  15162326.
12. Вебер Э, Джиллинг Т., Кирк К.Л. (март 1996 г.). «Отличительные функциональные свойства Rab3A и Rab3B в нейроэндокринных клетках PC12». J. Biol. Chem. 271 (12): 6963–71. Дои:10.1074 / jbc.271.12.6963. PMID  8636125.
13. Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (январь 1994 г.). «REP-2, белок сопровождения Rab, кодируемый геном, подобным хориидеремии». J. Biol. Chem. 269 (3): 2111–7. PMID  8294464.
14. Перейра-Леал Дж. Б., Стром М., Годфри Р. Ф., Сибра МС (январь 2003 г.). «Структурные детерминанты взаимодействия Rab и Rab Escort белков: мотивы семейства Rab определяют консервативную поверхность связывания». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 301 (1): 92–7. Дои:10.1016 / s0006-291x (02) 02963-7. PMID  12535645.

дальнейшее чтение

• Хосрави-Фар Р., Лутц Р. Дж., Кокс А. Д., Конрой Л., Борн Дж. Р., Синенски М., Балч В. Е., Басс Дж. Э., Der CJ (1991). «Изопреноидная модификация кроличьих белков, оканчивающаяся мотивами СС или СХС». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 88 (14): 6264–8. Дои:10.1073 / pnas.88.14.6264. ЧВК  52063. PMID  1648736.
• Захрауи А., Тушо Н., Шарден П., Тавитян А. (1989). «Гены Rab человека кодируют семейство GTP-связывающих белков, связанных с продуктами YPT1 и SEC4 дрожжей, участвующими в секреции». J. Biol. Chem. 264 (21): 12394–401. PMID  2501306.
• Фарнсворт CC, Seabra MC, Ericsson LH, Gelb MH, Glomset JA (1995). «Rab геранилгеранилтрансфераза катализирует геранилгеранилирование соседних цистеинов в малых GTPases Rab1A, Rab3A и Rab5A». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (25): 11963–7. Дои:10.1073 / пнас.91.25.11963. ЧВК  45356. PMID  7991565.
• Маккирнан CJ, Brondyk WH, Macara IG (1993). «Rab3A GTPase взаимодействует с множеством факторов через один и тот же эффекторный домен. Мутационный анализ перекрестного связывания Rab3A с предполагаемым целевым белком». J. Biol. Chem. 268 (32): 24449–52. PMID  8226995.
• Траск Б., Фертитта А., Кристенсен М., Янгблом Дж., Бергманн А., Коупленд А., де Йонг П., Моренвайзер Н., Олсен А., Каррано А. (1993). «Флуоресцентное гибридизационное картирование хромосомы 19 человека: расположение цитогенетических полос 540 космид и 70 генов или ДНК-маркеров». Геномика. 15 (1): 133–45. Дои:10.1006 / geno.1993.1021. PMID  8432525.
• Йоханнес Л., Ф. Перес, член парламента Ларан-Чич, Генри Дж. П., Дарчен Ф. (1996). «Характеристика взаимодействия мономерного GTP-связывающего белка Rab3a с геранилгеранилтрансферазой II». Евро. J. Biochem. 239 (2): 362–8. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0362u.x. PMID  8706741.
• Бертон Дж. Л., Слепнев В., Де Камилли П. В. (1997). «Эволюционно консервативный домен в подсемействе Rabs имеет решающее значение для взаимодействия с фактором обмена гуаниловых нуклеотидов Mss4». J. Biol. Chem. 272 (6): 3663–8. Дои:10.1074 / jbc.272.6.3663. PMID  9013620.
• Гепперт М., Года Ю., Стивенс CF, Südhof TC (1997). «Небольшой GTP-связывающий белок Rab3A регулирует позднюю стадию слияния синаптических везикул». Природа. 387 (6635): 810–4. Дои:10.1038/42954. PMID  9194562. S2CID  4359038.
• Мартинчич I, Перальта М.Э., Нгзее Дж. К. (1997). «Выделение и характеристика двойного пренилированного рецептора Rab и VAMP2». J. Biol. Chem. 272 (43): 26991–8. Дои:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID  9341137.
• Остермайер С, Брюнгер АТ (1999). «Структурная основа эффекторной специфичности Rab: кристаллическая структура небольшого G-белка Rab3A в комплексе с эффекторным доменом рабфилина-3A». Клетка. 96 (3): 363–74. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80549-8. PMID  10025402. S2CID  15162326.
• Чон Й.Дж., Ли TH, Ли Дж.Й., Ким Дж. Х., Пак Джей Би (1999) «Фосфатидная кислота важна для транслокации Rab3A из цитозоля на фосфолипидные мембраны». NeuroReport. 10 (13): 2859–63. Дои:10.1097/00001756-199909090-00029. PMID  10511453.
• Салливан М., Олсен А.С., Хуслей М.Д. (2000). «Геномная организация человеческого гена циклической AMP-специфической фосфодиэстеразы PDE4C и его хромосомная локализация в 19p13.1, между RAB3A и JUND». Клетка. Сигнал. 11 (10): 735–42. Дои:10.1016 / S0898-6568 (99) 00037-6. PMID  10574328.
• Клабек А., Генри Дж. П., Дарчен Ф (2000). «Биохимическая характеристика белка, активирующего Rab3-GTPase, показывает механизм, сходный с механизмом Ras-GAP». J. Biol. Chem. 275 (41): 31786–91. Дои:10.1074 / jbc.M003705200. PMID  10859313.
• Хейнс Л.П., Эванс Г.Дж., Морган А., Бургойн Р.Д. (2001). «Прямая ингибирующая роль Rab3-специфического эффектора, Noc2, в Ca2 + -регулируемом экзоцитозе в нейроэндокринных клетках». J. Biol. Chem. 276 (13): 9726–32. Дои:10.1074 / jbc.M006959200. PMID  11134008.
• Чжан И, Луан З, Лю А., Ху Г (2001). «Каркасный белок CASK опосредует взаимодействие между рабфилином 3a и бета-нейрексинами». FEBS Lett. 497 (2–3): 99–102. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02450-4. PMID  11377421. S2CID  33119468.
• Луо Х.Р., Сайарди А., Нагата Е., Е К., Ю Х, Юнг Т.С., Ло Х, Джайн С., Сава А., Снайдер С.Х. (2001). «GRAB: физиологический фактор обмена гуаниновых нуклеотидов на Rab3A, который взаимодействует с инозитол-гексакисфосфаткиназой». Нейрон. 31 (3): 439–51. Дои:10.1016 / S0896-6273 (01) 00384-1. PMID  11516400. S2CID  10990373.
• Пийпер А., Лезер Дж, Лутц М.П., ​​Бейл М., Зеузем С. (2001). «Субклеточное распределение и функция Rab3A-D в ацинарных клетках поджелудочной железы AR42J». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 287 (3): 746–51. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5651. PMID  11563859.
• Курода TS, Фукуда М, Арига Х, Микошиба К (2002). «Домен гомологии Slp синаптотагмин-подобных белков 1-4 и Slac2 функционирует как новый связывающий домен Rab27A». J. Biol. Chem. 277 (11): 9212–8. Дои:10.1074 / jbc.M112414200. PMID  11773082.