Синтаксин 3 - Syntaxin 3

STX3
Идентификаторы
Псевдонимы	STX3, STX3A, Синтаксин 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 600876 MGI: 103077 ГомолоГен: 80191 Генные карты: STX3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q12.1 Начинать 59,713,456 бп[1] Конец 59,805,882 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начинать 11,775,118 бп[2] Конец 11,819,403 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Активность рецептора SNAP • GO: 0001948 связывание с белками • связывание арахидоновой кислоты • Привязка SNARE Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • межклеточное соединение • конус роста • секреторная гранула • вакуоль • дендрит • Комплекс SNARE • азурофильная гранула • специфическая гранула • апикальная плазматическая мембрана • проекция нейрона • внеклеточная экзосома • ламеллиподиум • концевой бутон фоторецепторной клетки • ленточный синапс • синаптический пузырек • пресинаптическая мембрана • меланосома • мембрана из гранул зимогена • клеточная мембрана • постсинапс • эндомембранная система • мембрана пресинаптической активной зоны • Коллатераль Шаффера - синапс CA1 • глутаматергический синапс Биологический процесс • стыковка синаптических пузырьков • слияние синаптических пузырьков с мембраной пресинаптической активной зоны • Липидный бислой слияния • стыковка пузырьков • положительное регулирование локализации белка в плазматической мембране • положительная регуляция хемотаксиса • положительное регулирование пролиферации клеток • положительное регулирование локализации белка на поверхности клетки • внутриклеточный транспорт белка • транспорт нейротрансмиттеров • развитие проекции нейрона • везикулярный транспорт • положительная регуляция клеточной адгезии • длительная синаптическая потенциация • экзоцитоз • слияние пузырьков • экзоцитарная вставка рецептора нейромедиатора к постсинаптической мембране • транспорт • цитокин-опосредованный сигнальный путь • везикулярный транспорт в синапсе Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6809	20908
Ансамбль	ENSG00000166900	ENSMUSG00000041488
UniProt	Q13277	Q64704
RefSeq (мРНК)	NM_001178040 NM_004177	NM_001025307 NM_001025308 NM_001286543 NM_011502 NM_152220 NM_001360386
RefSeq (белок)	NP_001171511 NP_004168	NP_001020478 NP_001273472 NP_035632 NP_689344 NP_001347315
Расположение (UCSC)	Chr 11: 59.71 - 59.81 Мб	Chr 19: 11.78 - 11.82 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Синтаксин 3, также известный как STX3, это белок^[5] который у человека кодируется STX3 ген.^[6][7]

Функция

В белок кодируемый этим геном, является членом синтаксин семейство клеточных рецепторов для транспорта пузырьки которые участвуют в экзоцитоз в нейтрофилы.^[6] STX3 играет важную роль в росте невриты и служит прямой мишенью для омега-6 арахидоновая кислота.^[8]Мутации в синтаксине 3 вызывают Болезнь включения микроворсинок.^[9]

Взаимодействия

Синтаксин 3 показал способность взаимодействовать с SNAP-25,^[10][11][12] SNAP23^{[11][12][13][14]} и SNAP29.^[12]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166900 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000041488 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ибараки К., Хорикава Х.П., Морита Т., Мори Х., Сакимура К., Мишина М., Сайсу Х., Абэ Т. (июнь 1995 г.). «Идентификация четырех различных форм синтаксина 3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 211 (3): 997–1005. Дои:10.1006 / bbrc.1995.1910. PMID  7598732.
6. Мартин-Мартин Б., Набокина С.М., Лазо П.А., Моллинедо Ф. (март 1999 г.). «Совместная экспрессия нескольких генов синтаксина человека в нейтрофилах и дифференцирующихся клетках HL-60: вариантные изоформы и обнаружение синтаксина 1». J. Leukoc. Биол. 65 (3): 397–406. Дои:10.1002 / jlb.65.3.397. HDL:10261/59829. PMID  10080545. S2CID  18988377.
7. «Энтрез Ген: синтаксин 3 STX3».
8. Дариос Ф., Давлетов Б. (апрель 2006 г.). «Жирные кислоты омега-3 и омега-6 стимулируют расширение клеточной мембраны, воздействуя на синтаксин 3». Природа. 440 (7085): 813–7. Bibcode:2006Натура 440..813D. Дои:10.1038 / природа04598. PMID  16598260. S2CID  4411524.
9. Wiegerinck CL, Janecke AR, Schneeberger K, Vogel GF, van Haaften-Visser DY, Escher JC, Adam R, Thöni CE, Pfaller K, Jordan AJ, Weis CA, Nijman IJ, Monroe GR, van Hasselt PM, Cutz E, Klumperman Дж., Клеверс Х., Ньивенхуис Э. Э., Хаувен Р. Х., ван Хаафтен Дж., Хесс М. В., Хубер Л. А., Стапельбрук Дж. М., Мюллер Т., Миддендорп С. (2014). «Потеря синтаксина 3 вызывает вариантную болезнь включения микроворсинок». Гастроэнтерология. 147 (1): 65–68.e10. Дои:10.1053 / j.gastro.2014.04.002. PMID  24726755.
10. Hata Y, Südhof TC (июнь 1995 г.). «Новая повсеместная форма Munc-18 взаимодействует с множеством синтаксинов. Использование дрожжевой двугибридной системы для изучения взаимодействия между белками, участвующими в мембранном движении». J. Biol. Chem. 270 (22): 13022–8. Дои:10.1074 / jbc.270.22.13022. PMID  7768895.
11. Равичандран В., Чавла А., Рош, Пенсильвания (июнь 1996 г.). «Идентификация нового синтаксин- и синаптобревин / ВАМП-связывающего белка, SNAP-23, экспрессируемого в ненейрональных тканях». J. Biol. Chem. 271 (23): 13300–3. Дои:10.1074 / jbc.271.23.13300. PMID  8663154.
12. Стигмайер М., Ян Б., Ю Дж. С., Хуанг Б., Шен М., Ю С., Ло И., Шеллер Р. Х. (декабрь 1998 г.). «Три новых белка семейства синтаксин / SNAP-25». J. Biol. Chem. 273 (51): 34171–9. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34171. PMID  9852078.
13. Имаи А., Нашида Т., Йоши С., Шимомура Х. (август 2003 г.). «Внутриклеточная локализация белков SNARE в ацинарных клетках околоушной железы крысы: комплексы SNARE на апикальной плазматической мембране». Arch. Оральный Биол. 48 (8): 597–604. Дои:10.1016 / S0003-9969 (03) 00116-X. PMID  12828989.
14. Араки С., Тамори Й., Каваниси М., Шинода Х., Масуги Дж., Мори Х., Ники Т., Окадзава Х., Кубота Т., Касуга М. (май 1997 г.). «Ингибирование связывания SNAP-23 с синтаксином 4 с помощью Munc18c». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 234 (1): 257–62. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6560. PMID  9168999.

дальнейшее чтение

• Ибараки К., Хорикава Х.П., Морита Т., Мори Х., Сакимура К., Мишина М., Сайсу Х., Абэ Т. (1995). «Идентификация четырех различных форм синтаксина 3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 211 (3): 997–1005. Дои:10.1006 / bbrc.1995.1910. PMID  7598732.
• Хата Y, Südhof TC (1995). «Новая повсеместная форма Munc-18 взаимодействует с множеством синтаксинов. Использование дрожжевой двугибридной системы для изучения взаимодействия между белками, участвующими в мембранном движении». J. Biol. Chem. 270 (22): 13022–8. Дои:10.1074 / jbc.270.22.13022. PMID  7768895.
• Ли К., Ульрих Б., Чжан Дж. З., Андерсон Р. Г., Брозе Н., Зюдхоф ТК (1995). «Ca (2 +) - зависимая и независимая активность нервных и ненейральных синаптотагминов». Природа. 375 (6532): 594–9. Bibcode:1995 Натур. 375..594L. Дои:10.1038 / 375594a0. PMID  7791877. S2CID  4265549.
• Morgans CW, Brandstätter JH, Kellerman J, Betz H, Wässle H (1996). «Комплекс SNARE, содержащий синтаксин 3, присутствует в ленточных синапсах сетчатки». J. Neurosci. 16 (21): 6713–21. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.16-21-06713.1996. ЧВК  6579260. PMID  8824312.
• Теллам Дж. Т., Маколей С. Л., Макинтош С., Хьюиш Д. Р., Уорд К. В., Джеймс Д. Е. (1997). «Характеристика Munc-18c и синтаксина-4 в адипоцитах 3T3-L1. Предполагаемая роль в инсулинозависимом движении GLUT-4». J. Biol. Chem. 272 (10): 6179–86. Дои:10.1074 / jbc.272.10.6179. PMID  9045631.
• Делгросси М.Х., Бреуза Л., Мирре С., Шаврие П., Ле Бивик А. (1997). «Синтаксин 3 человека локализован апикально в клетках кишечника человека». J. Cell Sci. 110 (18): 2207–14. PMID  9378770.
• Галли Т., Захрауи А., Вайдьянатан В.В., Рапосо Дж., Тиан Дж. М., Карин М., Ниманн Х., Лувард Д. (1998). «Новый мембранный белок, нечувствительный к столбняку, нечувствительный к везикулам, в комплексах SNARE апикальной плазматической мембраны эпителиальных клеток». Мол. Биол. Клетка. 9 (6): 1437–48. Дои:10.1091 / mbc.9.6.1437. ЧВК  25366. PMID  9614185.
• Риенто К., Галли Т., Янссон С., Энхольм С., Лехтонен Э., Олкконен В.М. (1998). «Взаимодействие Munc-18-2 с синтаксином 3 контролирует ассоциацию апикальных SNARE в эпителиальных клетках». J. Cell Sci. 111 (17): 2681–8. PMID  9701566.
• Стигмайер М., Ян Б., Ю Дж. С., Хуанг Б., Шен М., Ю. С., Ло И., Шеллер Р. Х. (1998). «Три новых белка семейства синтаксин / SNAP-25». J. Biol. Chem. 273 (51): 34171–9. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34171. PMID  9852078.
• Мартин-Мартин Б., Набокина С.М., Лазо П.А., Моллинедо Ф. (1999). «Совместная экспрессия нескольких генов синтаксина человека в нейтрофилах и дифференцирующихся клетках HL-60: вариантные изоформы и обнаружение синтаксина 1». J. Leukoc. Биол. 65 (3): 397–406. Дои:10.1002 / jlb.65.3.397. HDL:10261/59829. PMID  10080545. S2CID  18988377.
• Фассауэр Д., Антонин В., Маргиттай М., Пабст С., Ян Р. (1999). «Смешанные и неродственные комплексы SNARE. Характеристика сборки и биофизических свойств» (PDF). J. Biol. Chem. 274 (22): 15440–6. Дои:10.1074 / jbc.274.22.15440. PMID  10336434. S2CID  2555394.
• Томас Д.М., Фергюсон Г.Д., Хершман Х.Р., Эльферинк Л.А. (1999). «Функциональный и биохимический анализ доменов C2 синаптотагмина IV». Мол. Биол. Клетка. 10 (7): 2285–95. Дои:10.1091 / mbc.10.7.2285. ЧВК  25443. PMID  10397765.
• Риенто К., Кауппи М., Керанен С., Олкконен В.М. (2000). «Munc18-2, функциональный партнер синтаксина 3, контролирует перемещение апикальной мембраны в эпителиальных клетках». J. Biol. Chem. 275 (18): 13476–83. Дои:10.1074 / jbc.275.18.13476. PMID  10788461.
• Кауппи М, Вольфарт Г, Олкконен В.М. (2002). «Анализ интерфейса связывания синтаксинов Munc18b. Использование мутанта Munc18b для анализа функций синтаксинов 2 и 3». J. Biol. Chem. 277 (46): 43973–9. Дои:10.1074 / jbc.M208315200. PMID  12198139.
• Имаи А, Нашида Т, Йоши С, Шимомура Х (2003). «Внутриклеточная локализация белков SNARE в ацинарных клетках околоушной железы крысы: комплексы SNARE на апикальной плазматической мембране». Arch. Оральный Биол. 48 (8): 597–604. Дои:10.1016 / S0003-9969 (03) 00116-X. PMID  12828989.
• Bandyopadhyay BC, Swaim WD, Liu X, Redman RS, Patterson RL, Ambudkar IS (2005). «Апикальная локализация функционального TRPC3 / TRPC6-Ca2 + -сигнального комплекса в поляризованных эпителиальных клетках. Роль в апикальном притоке Ca2 +». J. Biol. Chem. 280 (13): 12908–16. Дои:10.1074 / jbc.M410013200. PMID  15623527.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Низкий SH, Васанджи А., Нандури Дж., Хе М., Шарма Н., Ку М., Дразба Дж., Веймбс Т. (2006). «Синтаксины 3 и 4 концентрируются в отдельных кластерах на плазматической мембране до установления полярности клеток». Мол. Биол. Клетка. 17 (2): 977–89. Дои:10.1091 / mbc.E05-05-0462. ЧВК  1356605. PMID  16339081.