STX4 - STX4

STX4
Идентификаторы
Псевдонимы	STX4, STX4A, p35-2, синтаксин 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 186591 MGI: 893577 ГомолоГен: 105435 Генные карты: STX4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16p11.2 Начинать 31,032,889 бп[1] Конец 31,042,975 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F3 Начинать 127,824,294 бп[2] Конец 127,849,019 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Активность рецептора SNAP • GO: 0001948 связывание с белками • активность активатора сфингомиелин фосфодиэстеразы • Привязка SNARE Сотовый компонент • цитоплазма • неотъемлемый компонент мембраны • цитозоль • эндосома • мембрана • синаптический пузырек • клеточная мембрана • адаксональная область миелиновой оболочки • дендритный позвоночник • синапс • внутриклеточный • поверхность клетки • вакуоль • сеть транс-Гольджи • базолатеральная плазматическая мембрана • соматодендритный компартмент • специфическая гранула • боковая петля • перинуклеарная область цитоплазмы • вакуоль хранения • внеклеточная экзосома • ламеллиподиум • Комплекс SNARE • внеклеточный • мембрана фагоцитарных везикул • эндомембранная система • пресинаптическая мембрана • фагоцитарный пузырек • мембрана пресинаптической активной зоны • постсинапс • глутаматергический синапс Биологический процесс • положительная регуляция дегрануляции эозинофилов • положительное регулирование миграции клеток • слияние органелл • слияние синаптических пузырьков с мембраной пресинаптической активной зоны • реакция на гидропероксид • GO: 0048554 положительное регулирование каталитической активности • пост-Гольджи-опосредованный везикулами транспорт • регуляция экзоцитоза • стыковка пузырьков • положительное регулирование локализации белка в плазматической мембране • положительная регуляция хемотаксиса • положительное регулирование пролиферации клеток • положительное регулирование локализации белка на поверхности клетки • регуляция внешнего апоптотического сигнального пути через рецепторы домена смерти • положительная регуляция секреции инсулина, участвующая в клеточном ответе на стимул глюкозы • внутриклеточный транспорт белка • транспорт нейротрансмиттеров • положительная регуляция секреции иммуноглобулинов • везикулярный транспорт • Комплексная сборка SNARE • положительная регуляция клеточной адгезии • длительная синаптическая потенциация • слияние везикул с мембраной эндоплазматического ретикулума и промежуточного компартмента Гольджи (ERGIC) • транспорт • экзоцитоз • слияние пузырьков • цитокин-опосредованный сигнальный путь • клеточный ответ на гамма-интерферон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6810	20909
Ансамбль	ENSG00000103496	ENSMUSG00000030805
UniProt	Q12846	P70452
RefSeq (мРНК)	NM_001272095 NM_001272096 NM_004604	NM_009294
RefSeq (белок)	NP_001259024 NP_001259025 NP_004595	NP_033320
Расположение (UCSC)	Chr 16: 31.03 - 31.04 Мб	Chr 7: 127,82 - 127,85 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Синтаксин-4 это белок что у людей кодируется STX4 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

STX4 был показан взаимодействовать с:

• Гельсолин,^[8]
• НАПА,^[9]
• RAB4A,^[10]
• SNAP-25,^{[11][12][13][14]}
• SNAP23,^{[12][14][15][16][17][18][19][20]}
• STXBP1,^[11][21]
• STXBP5,^[22]
• Синтаксин-связывающий белок 3,^[21][22]
• TXLNB,^[23]
• ВАМП2,^{[13][18][24][25]}
• VAMP3,^{[9][15][18][26]} и
• Связанный с пузырьками мембранный белок 8.^[18][26]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103496 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030805 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ли Х., Ходж Д.Р., Пей Г.К., Сет А. (июнь 1994 г.). «Выделение и анализ последовательности человеческого гена, кодирующего синтаксин». Ген. 143 (2): 303–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90117-1. PMID  8206394.
6. Low SH, Vasanji A, Nanduri J, He M, Sharma N, Koo M, Drazba J, Weimbs T. (февраль 2006 г.). «Синтаксины 3 и 4 концентрируются в отдельных кластерах на плазматической мембране до установления полярности клеток». Молекулярная биология клетки. 17 (2): 977–89. Дои:10.1091 / mbc.E05-05-0462. ЧВК  1356605. PMID  16339081.
7. «Ген энтреса: синтаксин 4 STX4».
8. Kalwat MA, Wiseman DA, Luo W, Wang Z, Thurmond DC (январь 2012 г.). «Гельсолин связывается с N-концом синтаксина 4 для регулирования экзоцитоза инсулиновых гранул». Молекулярная эндокринология. Балтимор, штат Мэриленд. 26 (1): 128–41. Дои:10.1210 / me.2011-1112. ЧВК  3248323. PMID  22108804.
9. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
10. Ли Л., Омата В., Кодзима И., Шибата Х. (февраль 2001 г.). «Прямое взаимодействие Rab4 с синтаксином 4». Журнал биологической химии. 276 (7): 5265–73. Дои:10.1074 / jbc.M003883200. PMID  11063739.
11. Hata Y, Südhof TC (июнь 1995 г.). «Новая повсеместная форма Munc-18 взаимодействует с множеством синтаксинов. Использование дрожжевой двугибридной системы для изучения взаимодействия между белками, участвующими в мембранном движении». Журнал биологической химии. 270 (22): 13022–8. Дои:10.1074 / jbc.270.22.13022. PMID  7768895.
12. Равичандран В., Чавла А., Рош, Пенсильвания (июнь 1996 г.). «Идентификация нового синтаксин- и синаптобревин / ВАМП-связывающего белка, SNAP-23, экспрессируемого в ненейрональных тканях». Журнал биологической химии. 271 (23): 13300–3. Дои:10.1074 / jbc.271.23.13300. PMID  8663154.
13. Рид Г.Л., Хунг А.К., Фицджеральд М.Л. (апрель 1999 г.). «Человеческие тромбоциты содержат белки SNARE и гомолог Sec1p, который взаимодействует с синтаксином 4 и фосфорилируется после активации тромбина: последствия для секреции тромбоцитов». Кровь. 93 (8): 2617–26. Дои:10.1182 / кровь.V93.8.2617. PMID  10194441.
14. Стигмайер М., Ян Б., Ю Дж. С., Хуанг Б., Шен М., Ю С., Ло И., Шеллер Р. Х. (декабрь 1998 г.). «Три новых белка семейства синтаксин / SNAP-25». Журнал биологической химии. 273 (51): 34171–9. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34171. PMID  9852078.
15. Имаи А., Нашида Т., Йоши С., Шимомура Х. (август 2003 г.). «Внутриклеточная локализация белков SNARE в ацинарных клетках околоушной железы крысы: комплексы SNARE на апикальной плазматической мембране». Архивы оральной биологии. 48 (8): 597–604. Дои:10.1016 / с0003-9969 (03) 00116-х. PMID  12828989.
16. Ли Г., Александр Е.А., Шварц Дж. Х. (май 2003 г.). «Специфичность изоформы синтаксина в регуляции экзоцитоза H + -АТФазы почек». Журнал биологической химии. 278 (22): 19791–7. Дои:10.1074 / jbc.M212250200. PMID  12651853.
17. Араки С., Тамори Й., Каваниси М., Шинода Х., Масуги Дж., Мори Х., Ники Т., Окадзава Х., Кубота Т., Касуга М. (май 1997 г.). «Ингибирование связывания SNAP-23 с синтаксином 4 с помощью Munc18c». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 234 (1): 257–62. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6560. PMID  9168999.
18. Paumet F, Le Mao J, Martin S, Galli T, David B, Blank U, Roa M (июнь 2000 г.). «Растворимые рецепторы белка прикрепления NSF (SNARE) в тучных клетках RBL-2H3: функциональная роль синтаксина 4 в экзоцитозе и идентификация секреторного компартмента, содержащего мембранный белок 8, связанный с везикулами». Журнал иммунологии. 164 (11): 5850–7. Дои:10.4049 / jimmunol.164.11.5850. PMID  10820264.
19. Каваниси М., Тамори Ю., Окадзава Х., Араки С., Шинода Х., Касуга М. (март 2000 г.). «Роль SNAP23 в инсулино-индуцированной транслокации GLUT4 в адипоцитах 3T3-L1. Опосредование образования комплекса между синтаксином4 и VAMP2». Журнал биологической химии. 275 (11): 8240–7. Дои:10.1074 / jbc.275.11.8240. PMID  10713150.
20. Freedman SJ, Song HK, Xu Y, Sun ZY, Eck MJ (апрель 2003 г.). «Гомотетрамерная структура N-концевого домена спиральной спирали SNAP-23». Журнал биологической химии. 278 (15): 13462–7. Дои:10.1074 / jbc.M210483200. PMID  12556468.
21. Шроу Т.Д., Лимоны П.П., Дин В.Л., Уайтхарт С.З. (август 2003 г.). «Роль белков Sec1 / Munc18 в экзоцитозе тромбоцитов». Биохимический журнал. 374 (Pt 1): 207–17. Дои:10.1042 / BJ20030610. ЧВК  1223584. PMID  12773094.
22. Видберг CH, Брайант Н.Дж., Джиротти М., Ри С., Джеймс Д.Е. (сентябрь 2003 г.). «Tomosyn взаимодействует с синтаксином t-SNAREs и SNAP23 и играет роль в стимулированной инсулином транслокации GLUT4». Журнал биологической химии. 278 (37): 35093–101. Дои:10.1074 / jbc.M304261200. PMID  12832401.
23. Ногами С., Сато С., Танака-Накадате С., Йошида К., Накано М., Терано А., Ширатаки Х. (июль 2004 г.). «Идентификация и характеристика изоформ таксилина». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 319 (3): 936–43. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.05.073. PMID  15184072.
24. Моллинедо Ф., Мартин-Мартин Б., Калафат Дж., Набокина С.М., Лазо, Пенсильвания (январь 2003 г.). "Роль ассоциированного с везикулами мембранного белка-2 посредством взаимодействия рецептора белка прикрепления Q-растворимого N-этилмалеимида и рецептора белка прикрепления R-растворимого N-этилмалеимида фактора в экзоцитозе специфических и третичных гранул нейтрофилов человека ". Журнал иммунологии. 170 (2): 1034–42. Дои:10.4049 / jimmunol.170.2.1034. PMID  12517971.
25. Джагадиш М.Н., Фернандес С.С., Хьюиш Д.Р., Маколей С.Л., Гоф К.Х., Грусовин Дж., Веркейлен А., Косгроув Л., Алафаци А., Френкель М.Дж., Уорд К.В. (август 1996 г.). «Чувствительные к инсулину ткани содержат изоформы А и В основного комплексного белка SNAP-25 (синаптосомно-связанный белок 25) в дополнение к синтаксину 4 и синаптобревинам 1 и 2». Биохимический журнал. 317 (3): 945–54. Дои:10.1042 / bj3170945. ЧВК  1217577. PMID  8760387.
26. Полгар Дж., Чунг С.Х., Рид Г.Л. (август 2002 г.). «Связанный с пузырьками мембранный белок 3 (VAMP-3) и VAMP-8 присутствуют в тромбоцитах человека и необходимы для секреции гранул». Кровь. 100 (3): 1081–3. Дои:10.1182 / blood.v100.3.1081. PMID  12130530.

дальнейшее чтение

• Беннетт М.К., Гарсия-Аррарас Дж. Э., Эльферинк Л. А., Петерсон К., Флеминг А. М., Хазука С. Д., Шеллер Р. Х. (сентябрь 1993 г.). «Семейство синтаксинов везикулярных транспортных рецепторов». Клетка. 74 (5): 863–73. Дои:10.1016/0092-8674(93)90466-4. PMID  7690687. S2CID  37698687.
• Ли К., Ульрих Б., Чжан Дж. З., Андерсон Р. Г., Брозе Н., Зюдхоф ТК (июнь 1995 г.). «Ca (2 +) - зависимая и независимая активность нервных и ненейронных синаптотагминов». Природа. 375 (6532): 594–9. Дои:10.1038 / 375594a0. PMID  7791877. S2CID  4265549.
• Джагадиш М.Н., Фернандес С.С., Хьюиш Д.Р., Маколей С.Л., Гоф К.Х., Грусовин Дж., Веркейлен А., Косгроув Л., Алафачи А., Френкель М.Дж., Уорд К.В. (август 1996 г.). «Чувствительные к инсулину ткани содержат изоформы А и В основного комплексного белка SNAP-25 (синаптосомно-связанный белок 25) в дополнение к синтаксину 4 и синаптобревинам 1 и 2». Биохимический журнал. 317 (Pt 3): 945–54. Дои:10.1042 / bj3170945. ЧВК  1217577. PMID  8760387.
• Мандон Б., Чжоу С.Л., Нильсен С., Неппер М.А. (август 1996 г.). «Синтаксин-4 локализован на апикальной плазматической мембране клеток собирательного канала почек крыс: возможная роль в транспортировке аквапорина-2». Журнал клинических исследований. 98 (4): 906–13. Дои:10.1172 / JCI118873. ЧВК  507504. PMID  8770861.
• Тиммерс К.И., Кларк А.Э., Омацу-Канбе М., Уайтхарт С.В., Беннетт М.К., Холман Г.Д., Кушман С.З. (декабрь 1996 г.). «Идентификация рецепторов SNAP во фракциях мембран жировых клеток крыс и в комплексах SNARE, коиммунопреципитированных с меченным эпитопом N-этилмалеимид-чувствительным гибридным белком». Биохимический журнал. 320 (Pt 2): 429–36. Дои:10.1042 / bj3200429. ЧВК  1217948. PMID  8973549.
• Теллам Дж. Т., Маколей С. Л., Макинтош С., Хьюиш Д. Р., Уорд К. В., Джеймс Д. Е. (март 1997 г.). «Характеристика Munc-18c и синтаксина-4 в адипоцитах 3T3-L1. Предполагаемая роль в инсулинозависимом движении GLUT-4». Журнал биологической химии. 272 (10): 6179–86. Дои:10.1074 / jbc.272.10.6179. PMID  9045631.
• Араки С., Тамори Й., Каваниси М., Шинода Х., Масуги Дж., Мори Х., Ники Т., Окадзава Х., Кубота Т., Касуга М. (май 1997 г.). «Ингибирование связывания SNAP-23 с синтаксином 4 с помощью Munc18c». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 234 (1): 257–62. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6560. PMID  9168999.
• Иноуэ Т., Нильсен С., Мандон Б., Террис Дж., Кишор Б.К., Неппер М.А. (ноябрь 1998 г.). «SNAP-23 в почках крысы: совместная локализация с аквапорином-2 в везикулах собирательного протока». Американский журнал физиологии. 275 (5, часть 2): F752-60. Дои:10.1152 / айпренал.1998.275.5.F752. PMID  9815132.
• Рид Г.Л., Хунг А.К., Фицджеральд М.Л. (апрель 1999 г.). «Человеческие тромбоциты содержат белки SNARE и гомолог Sec1p, который взаимодействует с синтаксином 4 и фосфорилируется после активации тромбина: последствия для секреции тромбоцитов». Кровь. 93 (8): 2617–26. Дои:10.1182 / кровь.V93.8.2617. PMID  10194441.
• Мин Дж., Окада С., Канзаки М., Элмендорф Дж. С., Кокер К. Дж., Цереза ​​Б. П., Сю Л. Дж., Нода Й., Салтиель А. Р., Пессин Дж. Э. (июнь 1999 г.). «Synip: новый регулируемый инсулином синтаксин 4-связывающий белок, опосредующий транслокацию GLUT4 в адипоцитах». Молекулярная клетка. 3 (6): 751–60. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 80007-1. PMID  10394363.
• Thomas DM, Ferguson GD, Herschman HR, Elferink LA (июль 1999 г.). «Функциональный и биохимический анализ доменов C2 синаптотагмина IV». Молекулярная биология клетки. 10 (7): 2285–95. Дои:10.1091 / mbc.10.7.2285. ЧВК  25443. PMID  10397765.
• Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B., Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (ноябрь 1999 г.). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой». Международный журнал рака. 83 (4): 456–64. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID  10508479.
• Paumet F, Le Mao J, Martin S, Galli T, David B, Blank U, Roa M (июнь 2000 г.). «Растворимые рецепторы белка прикрепления NSF (SNARE) в тучных клетках RBL-2H3: функциональная роль синтаксина 4 в экзоцитозе и идентификация секреторного компартмента, содержащего мембранный белок 8, связанный с везикулами». Журнал иммунологии. 164 (11): 5850–7. Дои:10.4049 / jimmunol.164.11.5850. PMID  10820264.
• Ли Л., Омата В., Кодзима И., Шибата Х. (февраль 2001 г.). «Прямое взаимодействие Rab4 с синтаксином 4». Журнал биологической химии. 276 (7): 5265–73. Дои:10.1074 / jbc.M003883200. PMID  11063739.
• Логан М.Р., Лейси П., Баблитц Б., Мокбель Р. (февраль 2002 г.). «Экспрессия эозинофилов-мишеней SNARE в качестве потенциальных родственных рецепторов для ассоциированного с пузырьками мембранного белка-2 при экзоцитозе». Журнал аллергии и клинической иммунологии. 109 (2): 299–306. Дои:10.1067 / май.2002.121453. PMID  11842301.
• Dent J, Kato K, Peng XR, Martinez C, Cattaneo M, Poujol C, Nurden P, Nurden A, Trimble WS, Ware J (март 2002 г.). «Прототип тромбоцитарного септина и его участие в секреции». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (5): 3064–9. Дои:10.1073 / pnas.052715199. ЧВК  122473. PMID  11880646.
• Персквист Н., Роберг К., Кулите А., Стендаль О. (март 2002 г.). «Rab5a GTPase регулирует слияние между патоген-содержащими фагосомами и цитоплазматическими органеллами в нейтрофилах человека». Журнал клеточной науки. 115 (Pt 6): 1321–30. PMID  11884531.
• Полгар Дж., Чунг С.Х., Рид Г.Л. (август 2002 г.). «Связанный с пузырьками мембранный белок 3 (VAMP-3) и VAMP-8 присутствуют в тромбоцитах человека и необходимы для секреции гранул». Кровь. 100 (3): 1081–3. Дои:10.1182 / blood.V100.3.1081. PMID  12130530.
• Scales SJ, Hesser BA, Masuda ES, Scheller RH (август 2002 г.). «Amisyn, новый синтаксин-связывающий белок, который может регулировать сборку комплекса SNARE». Журнал биологической химии. 277 (31): 28271–9. Дои:10.1074 / jbc.M204929200. PMID  12145319.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P70452 (Синтаксин-4 мыши) на PDBe-KB.