COPG - COPG

COPG1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1R4X
Идентификаторы
Псевдонимы	COPG1, COPG, субъединица комплекса белка-катомера гамма 1, субъединица комплекса оболочки COPI гамма 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 615525 MGI: 1858696 ГомолоГен: 56745 Генные карты: COPG1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q21.3 Начните 129,249,606 бп[1] Конец 129,277,773 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 D1 | 6 39,13 см Начните 87,887,814 бп[2] Конец 87,913,595 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • структурная молекулярная активность Сотовый компонент • цитоплазма • мембранное пальто • Мембрана везикул, покрытая COPI • мембрана • транспортная везикула • цитозоль • цитоплазматический пузырек • аппарат Гольджи • Мембрана Гольджи • Покрытие везикул COPI • мембрана эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум • эндоплазматический ретикулум-промежуточный компартмент Гольджи Биологический процесс • ретроградный везикулярный транспорт, Гольджи в ER • транспорт белка • транспорт органелл по микротрубочкам • внутриклеточный транспорт белка • установление локализации Гольджи • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • везикулярный транспорт • опосредованный пузырьками Гольджи транспорт • секреция белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	22820	54161
Ансамбль	ENSG00000181789	ENSMUSG00000030058
UniProt	Q9Y678	Q9QZE5
RefSeq (мРНК)	NM_016128	NM_017477 NM_201244
RefSeq (белок)	NP_057212	NP_059505 NP_957696
Расположение (UCSC)	Chr 3: 129,25 - 129,28 Мб	Chr 6: 87,89 - 87,91 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гамма субъединицы коатомера это белок что у людей кодируется COPG ген.^[5][6] Это один из семи белков в COPI комплекс коатомера, который покрывает пузырьки, когда они отпочковываются от Гольджи сложный.^[5]

Взаимодействия

COPG было показано взаимодействовать с участием Дофаминовый рецептор D1,^[7] COPZ1^[5][8] и COPB1.^[5][9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000181789 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030058 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Футацумори М., Касаи К., Такацу Х., Шин Х.В., Накаяма К. (февраль 2001 г.). «Идентификация и характеристика новых изоформ субъединиц COP I». J Biochem. 128 (5): 793–801. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022817. PMID  11056392.
6. «Ген Entrez: белковый комплекс катомера COPG, субъединица гамма».
7. Бермак, Джейсон С; Ли Мин; Буллок Клейтон; Weingarten Paul; Чжоу Цюнь-Юн (февраль 2002 г.). «Взаимодействие гамма-СОР с транспортным мотивом на С-конце рецептора D1». Евро. J. Cell Biol. Германия. 81 (2): 77–85. Дои:10.1078/0171-9335-00222. ISSN  0171-9335. PMID  11893085.
8. Faulstich, D; Auerbach S; Orci L; Ravazzola M; Wegchingel S; Lottspeich F; Stenbeck G; Хартер С; Виланд Ф. Т.; Tschochner H (октябрь 1996). «Архитектура катомера: молекулярная характеристика дельта-COP и белковых взаимодействий в комплексе» (PDF). J. Cell Biol. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 135 (1): 53–61. Дои:10.1083 / jcb.135.1.53. ISSN  0021-9525. ЧВК  2121028. PMID  8858162.
9. Лоу, М; Kreis T. E (ноябрь 1996 г.). «Сборка in vivo катомера, предшественника покрытия COP-I». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 271 (48): 30725–30. Дои:10.1074 / jbc.271.48.30725. ISSN  0021-9258. PMID  8940050.

внешние ссылки

• Человек COPG1 расположение генома и COPG1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Лоу М., Крейс Т.Э. (1997). «Сборка in vivo катомера, предшественника покрытия COP-I». J. Biol. Chem. 271 (48): 30725–30. Дои:10.1074 / jbc.271.48.30725. PMID  8940050.
• Павел Дж, Хартер С., Виланд Ф.Т. (1998). «Обратимая диссоциация катомера: функциональная характеристика субкомплекса бета / дельта-оболочка белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (5): 2140–5. Bibcode:1998ПНАС ... 95.2140П. Дои:10.1073 / пнас.95.5.2140. ЧВК  19276. PMID  9482852.
• Фишер К.Д., Хелмс Дж. Б., Чжао Л., Виланд Ф. Т. (2000). «Сайт-специфическое фото-перекрестное связывание для взаимодействия зонда Arf1 с белками, участвующими в почковании везикул COPI». Методы. 20 (4): 455–64. Дои:10.1006 / мет.2000.0958. PMID  10720466.
• Эугстер А., Фриджерио Г., Дейл М., Дуден Р. (2000). «Домены COP I, необходимые для целостности коатомера и новых взаимодействий с ARF и ARF-GAP». EMBO J. 19 (15): 3905–17. Дои:10.1093 / emboj / 19.15.3905. ЧВК  306616. PMID  10921873.
• Ху RM, Хан ZG, Song HD и др. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97.9543H. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
• Салливан Б.М., Харрисон-Лавуа К.Дж., Маршанский В.В. и др. (2000). «RGS4 и RGS2 связывают коатомер и ингибируют ассоциацию COPI с мембранами Гольджи и внутриклеточный транспорт». Мол. Биол. Ячейка. 11 (9): 3155–68. Дои:10.1091 / mbc.11.9.3155. ЧВК  14982. PMID  10982407.
• Хан Й., Ли Й. Дж., Юн Дж. Х. и др. (2000). «Дупликация генов, кодирующих не клатриновый белок оболочки гамма-COP в эволюции позвоночных, насекомых и растений». FEBS Lett. 482 (1–2): 31–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02033-0. PMID  11018518. S2CID  36356269.
• Паульссон К.М., Клеймер М.Дж., Гриффит Дж. И др. (2002). «Ассоциация тапазина и COPI обеспечивает механизм ретроградного транспорта молекул класса I главного комплекса гистосовместимости (MHC) из комплекса Гольджи в эндоплазматический ретикулум». J. Biol. Chem. 277 (21): 18266–71. Дои:10.1074 / jbc.M201388200. PMID  11884415.
• Бермак Дж. К., Ли М., Буллок С. и др. (2002). «Взаимодействие гамма-СОР с транспортным мотивом на С-конце рецептора D1». Евро. J. Cell Biol. 81 (2): 77–85. Дои:10.1078/0171-9335-00222. PMID  11893085.
• Канзаки М., Уотсон Р.Т., Хоу Дж. К. и др. (2003). «Малый GTP-связывающий белок TC10 по-разному регулирует две разные популяции нитчатого актина в адипоцитах 3T3L1». Мол. Биол. Ячейка. 13 (7): 2334–46. Дои:10.1091 / mbc.01-10-0490. ЧВК  117317. PMID  12134073.
• Сюй Y, Мартин С., Джеймс Д.Э., Хонг В. (2003). «GS15 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Ykt6 и участвует в движении в ранних цистернах аппарата Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 13 (10): 3493–507. Дои:10.1091 / mbc.E02-01-0004. ЧВК  129961. PMID  12388752.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Роде Х.М., Чеонг Ф.Й., Конрад Г. и др. (2004). «Человеческая фосфатидилинозитолфосфатаза SAC1 взаимодействует с комплексом коатомера I». J. Biol. Chem. 278 (52): 52689–99. Дои:10.1074 / jbc.M307983200. PMID  14527956.
• Уотсон П.Дж., Фриджерио Г., Коллинз Б.М. и др. (2004). «Домен придатка Гамма-КС - устройство и функции». Движение. 5 (2): 79–88. Дои:10.1111 / j.1600-0854.2004.00158.x. PMID  14690497. S2CID  24249308.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.