STX2 - STX2

STX2
Идентификаторы
Псевдонимы	STX2, EPIM, EPM, STX2A, STX2B, STX2C, синтаксин 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 132350 MGI: 108059 ГомолоГен: 37559 Генные карты: STX2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.33 Начните 130,789,600 бп[1] Конец 130,839,266 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 G1.3 | 5 67,99 см Начните 128,984,557 бп[2] Конец 129,008,574 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность димеризации белков • Активность рецептора SNAP • кальций-зависимое связывание с белками • GO: 0001948 связывание с белками • Привязка SNARE Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • мембрана • синаптический пузырек • клеточная мембрана • базолатеральная плазматическая мембрана • Комплекс SNARE • ламеллиподиум • внеклеточный • эндомембранная система • пресинаптическая мембрана • мембрана пресинаптической активной зоны Биологический процесс • дифференциация клеток • развитие эктодермы • слияние синаптических пузырьков с мембраной пресинаптической активной зоны • реакция на гидропероксид • акросомная реакция • стыковка пузырьков • сборка ороговевшего конверта • олигомеризация белков • морфогенез органов животных • внутриклеточный транспорт белка • везикулярный транспорт • преобразование сигнала • экзоцитоз • слияние пузырьков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2054	13852
Ансамбль	ENSG00000111450	ENSMUSG00000029428
UniProt	P32856	Q00262
RefSeq (мРНК)	NM_001980 NM_194356 NM_001351049 NM_001351050 NM_001351051 NM_001351052	NM_001286033 NM_001286034 NM_007941 NM_001359022
RefSeq (белок)	NP_001971 NP_919337 NP_001337978 NP_001337979 NP_001337980 NP_001337981	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 12: 130,79 - 130,84 Мб	Chr 5: 128.98 - 129.01 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Синтаксин-2, также известен как эпиморфин, это белок что у людей кодируется STX2 ген.^[5][6][7]

Продукт этого гена принадлежит к семейству белков синтаксин / эпиморфин. Синтаксины представляют собой большое семейство белков, участвующих в нацеливании и слиянии внутриклеточных транспортных везикул. Продукт этого гена регулирует эпителиально-мезенхимальные взаимодействия, а также морфогенез и активацию эпителиальных клеток. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.^[7] Когда N-конец находится на цитозольной поверхности, он действует как t-SNARE участвует в стыковке внутриклеточных пузырьков и называется Синтаксин-2. Когда он вывернут наизнанку, то есть N-конец свешивается на внеклеточной поверхности (каким-то неклассическим путем секреции), он действует как универсальный морфоген и называется эпиморфином. Этот мембранный белок обладает двойным выбором другой формы топологической альтернативы: направлен либо на апикальную, либо на базолатеральную поверхность эпителиальной клетки регулируемым образом в зависимости от различных контекстов. Когда он экспрессируется мезенхимальными клетками, он может управлять эпителиальным морфогенезом на эпителиальных мезенхимальных интерфейсах.

Взаимодействия

STX2 был показан взаимодействовать с участием SNAP-25,^[8][9] SNAP23,^{[9][10][11][12]} STXBP1^[8][13] и Синтаксин-связывающий белок 3.^[13]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111450 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029428 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Zha H, Remmers EF, Szpirer C, Szpirer J, Zhang H, Kozak CA, Wilder RL (ноябрь 1996 г.). «Ген эпиморфина высоко консервативен среди людей, мышей и крыс и соответствует хромосоме 7 человека, хромосоме 5 мыши и хромосоме 12 крысы». Геномика. 37 (3): 386–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0574. PMID  8938452.
6. Band AM, Kuismanen E (июнь 2005 г.). «Локализация синтаксина 2 и 3 плазматической мембраны t-SNAREs во внутриклеточных компартментах». BMC Cell Biology. 6 (1): 26. Дои:10.1186/1471-2121-6-26. ЧВК  1156879. PMID  15943887.
7. «Ген Entrez: синтаксин 2 STX2».
8. Hata Y, Südhof TC (июнь 1995 г.). «Новая повсеместная форма Munc-18 взаимодействует с множеством синтаксинов. Использование дрожжевой двугибридной системы для изучения взаимодействий между белками, участвующими в мембранном движении». Журнал биологической химии. 270 (22): 13022–8. Дои:10.1074 / jbc.270.22.13022. PMID  7768895.
9. Равичандран В., Чавла А., Рош, Пенсильвания (июнь 1996 г.). «Идентификация нового синтаксин- и синаптобревин / ВАМП-связывающего белка, SNAP-23, экспрессируемого в ненейрональных тканях». Журнал биологической химии. 271 (23): 13300–3. Дои:10.1074 / jbc.271.23.13300. PMID  8663154.
10. Имаи А., Нашида Т., Йоши С., Шимомура Х. (август 2003 г.). «Внутриклеточная локализация белков SNARE в ацинарных клетках околоушной железы крысы: комплексы SNARE на апикальной плазматической мембране». Архивы оральной биологии. 48 (8): 597–604. Дои:10.1016 / S0003-9969 (03) 00116-X. PMID  12828989.
11. Ли Джи, Александр Е.А., Шварц Дж. Х. (май 2003 г.). «Специфичность изоформы синтаксина в регуляции экзоцитоза H + -АТФазы почек». Журнал биологической химии. 278 (22): 19791–7. Дои:10.1074 / jbc.M212250200. PMID  12651853.
12. Араки С., Тамори Й., Каваниси М., Шинода Х., Масуги Дж., Мори Х., Ники Т., Окадзава Х., Кубота Т., Касуга М. (май 1997 г.). «Ингибирование связывания SNAP-23 с синтаксином 4 с помощью Munc18c». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 234 (1): 257–62. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6560. PMID  9168999.
13. Шроу Т.Д., Лимоны П.П., Дин В.Л., Уайтхарт С.З. (август 2003 г.). «Роль белков Sec1 / Munc18 в экзоцитозе тромбоцитов». Биохимический журнал. 374 (Pt 1): 207–17. Дои:10.1042 / BJ20030610. ЧВК  1223584. PMID  12773094.

дальнейшее чтение

• Хираи Ю., Такебе К., Такашина М., Кобаяши С., Такеити М. (май 1992 г.). «Эпиморфин: мезенхимальный белок, необходимый для морфогенеза эпителия». Ячейка. 69 (3): 471–81. Дои:10.1016 / 0092-8674 (92) 90448-Л. PMID  1581962. S2CID  32814241.
• Hata Y, Südhof TC (июнь 1995 г.). «Новая повсеместная форма Munc-18 взаимодействует с множеством синтаксинов. Использование дрожжевой двугибридной системы для изучения взаимодействий между белками, участвующими в мембранном движении». Журнал биологической химии. 270 (22): 13022–8. Дои:10.1074 / jbc.270.22.13022. PMID  7768895.
• Ли К., Ульрих Б., Чжан Дж. З., Андерсон Р. Г., Брозе Н., Зюдхоф ТК (июнь 1995 г.). «Ca (2 +) - зависимая и независимая активность нервных и ненейронных синаптотагминов». Природа. 375 (6532): 594–9. Дои:10.1038 / 375594a0. PMID  7791877. S2CID  4265549.
• Хираи Y (март 1993 г.). «Молекулярное клонирование эпиморфина человека: идентификация изоформ и их уникальные свойства». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 191 (3): 1332–7. Дои:10.1006 / bbrc.1993.1363. PMID  8466509.
• Oka Y, Hirai Y (январь 1996 г.). «Индуктивное влияние эпиморфина на эндотелиальные клетки in vitro». Экспериментальные исследования клеток. 222 (1): 189–98. Дои:10.1006 / excr.1996.0024. PMID  8549663.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Бец А., Окамото М., Бенселер Ф., Брозе Н. (январь 1997 г.). «Прямое взаимодействие крысиного гомолога unc-13 Munc13-1 с N-концом синтаксина». Журнал биологической химии. 272 (4): 2520–6. Дои:10.1074 / jbc.272.4.2520. PMID  8999968.
• Теллам Дж. Т., Маколей С. Л., Макинтош С., Хьюиш Д. Р., Уорд К. В., Джеймс Д. Е. (март 1997 г.). «Характеристика Munc-18c и синтаксина-4 в адипоцитах 3T3-L1. Предполагаемая роль в инсулинозависимом движении GLUT-4». Журнал биологической химии. 272 (10): 6179–86. Дои:10.1074 / jbc.272.10.6179. PMID  9045631.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Геномные исследования. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Кошида С., Хираи Ю. (май 1997 г.). «Идентификация клеточной последовательности распознавания эпиморфина и критическая роль взаимодействия клетки / эпиморфина в морфогенезе ветвления легких». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 234 (2): 522–5. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6673. PMID  9177305.
• Хираи Ю., Лохтер А., Галосы С., Кошида С., Нива С., Бисселл М.Дж. (январь 1998 г.). «Эпиморфин функционирует как ключевой морфорегулятор эпителиальных клеток молочной железы». Журнал клеточной биологии. 140 (1): 159–69. Дои:10.1083 / jcb.140.1.159. ЧВК  2132590. PMID  9425164.
• Thomas DM, Ferguson GD, Herschman HR, Elferink LA (июль 1999 г.). «Функциональный и биохимический анализ доменов C2 синаптотагмина IV». Молекулярная биология клетки. 10 (7): 2285–95. Дои:10.1091 / mbc.10.7.2285. ЧВК  25443. PMID  10397765.
• Пабст С., Хаззард Дж. В., Антонин В., Зюдхоф ТК, Ян Р., Ризо Дж., Фасшауэр Д. (июнь 2000 г.). «Селективное взаимодействие комплексина с нейрональным комплексом SNARE. Определение областей связывания». Журнал биологической химии. 275 (26): 19808–18. Дои:10.1074 / jbc.M002571200. PMID  10777504.
• Кауппи М., Вольфарт Дж., Олкконен В.М. (ноябрь 2002 г.). «Анализ интерфейса связывания синтаксинов Munc18b. Использование мутанта Munc18b для анализа функций синтаксинов 2 и 3». Журнал биологической химии. 277 (46): 43973–9. Дои:10.1074 / jbc.M208315200. PMID  12198139.
• Терасаки Ю., Фукуда Ю., Суга М., Икегучи Н., Такея М. (2006). «Экспрессия эпиморфина при интерстициальной пневмонии». Респираторные исследования. 6 (1): 6. Дои:10.1186/1465-9921-6-6. ЧВК  548284. PMID  15651999.
• Low SH, Vasanji A, Nanduri J, He M, Sharma N, Koo M, Drazba J, Weimbs T. (февраль 2006 г.). «Синтаксины 3 и 4 концентрируются в отдельных кластерах на плазматической мембране до установления полярности клеток». Молекулярная биология клетки. 17 (2): 977–89. Дои:10.1091 / mbc.E05-05-0462. ЧВК  1356605. PMID  16339081.