RAD17 - RAD17

RAD17
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3A1J, 3G65, 3GGR
Идентификаторы
Псевдонимы	RAD17, CCYC, HR24L, RAD17SP, RAD24, компонент загрузчика зажима контрольной точки RAD17
Внешние идентификаторы	OMIM: 603139 MGI: 1333807 ГомолоГен: 32117 Генные карты: RAD17
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q13.2 Начинать 69,369,293 бп[1] Конец 69,414,801 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 D1 Начинать 100,617,164 бп[2] Конец 100,651,051 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • связывание хроматина • Активность загрузчика зажимов ДНК Сотовый компонент • хромосома, теломерная область • Rad17 RFC-подобный комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма • ядрышко • ядерный хроматин Биологический процесс • контрольная точка митотического клеточного цикла • Контрольная точка репликации ДНК • Репликация ДНК • Контрольная точка повреждения ДНК • клеточный цикл • регуляция фосфорилирования • отрицательная регуляция репликации ДНК • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • контрольная точка репликации митотической ДНК • Ремонт ДНК • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5884	19356
Ансамбль	ENSG00000276618 ENSG00000152942	ENSMUSG00000021635
UniProt	O75943	Q6NXW6
RefSeq (мРНК)	NM_001278622 NM_002873 NM_133338 NM_133339 NM_133340 NM_133341 NM_133342 NM_133343 NM_133344	NM_001044371 NM_001283011 NM_011233
RefSeq (белок)	NP_001265551 NP_002864 NP_579916 NP_579917 NP_579918 NP_579919 NP_579920 NP_579921 NP_579922	NP_001037836 NP_001269940 NP_035363
Расположение (UCSC)	Chr 5: 69.37 - 69.41 Мб	Chr 13: 100,62 - 100,65 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок контрольной точки клеточного цикла RAD17 это белок что у людей кодируется RAD17 ген.^[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, очень похож на продукт гена Schizosaccharomyces pombe rad17, гена контрольной точки клеточного цикла, необходимого для остановки клеточного цикла и восстановления повреждений ДНК в ответ на повреждение ДНК. Этот белок имеет большое сходство с фактором репликации ДНК C (RFC) и может образовывать комплекс с RFC. Этот белок связывается с хроматином до повреждения ДНК и фосфорилируется с помощью ATR после повреждения. Этот белок рекрутирует белковый комплекс контрольной точки RAD1-RAD9-HUS1 на хроматин после повреждения ДНК, которое может потребоваться для его фосфорилирования. Фосфорилирование этого белка необходимо для остановки G2 клеточного цикла, вызванного повреждением ДНК, и считается критическим ранним событием во время передачи сигналов контрольной точки в поврежденных ДНК клетках. Сообщалось о восьми альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта этого гена, которые кодируют четыре различных белка.^[7]

Взаимодействия

RAD17 был показан взаимодействовать с:

• Атаксия, телеангиэктазия и Rad3 связанные,^[8][9]
• Атаксия, телеангиэктазия, мутировавшая,^[8][9]
• HUS1,^[10][11]
• NHP2L1,^[12]
• СТОЛБ,^[13]
• Гомолог RAD1,^[8][10][11] и
• RAD9A.^{[10][11][14][15]}

Рекомендации

1. ENSG00000152942 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000276618, ENSG00000152942 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021635 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бао С., Шен X, Шен К., Лю И, Ван XF (март 1999 г.). «Rad24 млекопитающих, гомологичный дрожжевым Saccharomyces cerevisiae Rad24 и Schizosaccharomyces pombe Rad17, участвует в контрольной точке повреждения ДНК». Рост клеток отличается. 9 (12): 961–7. PMID  9869296.
6. Паркер А.Е., Ван де Вейер I, Лаус М.С., Верхассельт П., Луйтен WH (август 1998 г.). «Идентификация человеческого гомолога гена контрольной точки Schizosaccharomyces pombe rad17 +». J Biol Chem. 273 (29): 18340–6. Дои:10.1074 / jbc.273.29.18340. PMID  9660800.
7. «Ген Entrez: RAD17 гомолог RAD17 (S. pombe)».
8. Бао С., Тиббетс Р.С., Брамбо К.М., Фанг Й., Ричардсон Д.А., Али А., Чен С.М., Абрахам Р.Т., Ван XF (июнь 2001 г.). «ATR / ATM-опосредованное фосфорилирование человеческого Rad17 необходимо для генотоксических стрессовых реакций». Природа. 411 (6840): 969–74. Bibcode:2001Натура.411..969Б. Дои:10.1038/35082110. PMID  11418864. S2CID  4429058.
9. Ким С.Т., Лим Д.С., Канман К.Э., Кастан МБ (декабрь 1999 г.). «Субстратные особенности и идентификация предполагаемых субстратов членов семейства киназ ATM». J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. Дои:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID  10608806.
10. Бермудес В.П., Линдси-Больц Л.А., Чезаре А.Дж., Манива Ю., Гриффит Дж. Д., Гурвиц Дж., Санкар А. (февраль 2003 г.). «Загрузка комплекса контрольных точек человека 9-1-1 на ДНК с помощью загрузчика контрольных точек hRad17-фактор репликации C in vitro». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (4): 1633–8. Bibcode:2003ПНАС..100.1633Б. Дои:10.1073 / pnas.0437927100. ЧВК  149884. PMID  12578958.
11. Рауэн М., Буртелоу М.А., Дюфа В.М., Карниц Л.М. (сентябрь 2000 г.). «Белок контрольной точки человека hRad17 взаимодействует с PCNA-подобными белками hRad1, hHus1 и hRad9». J. Biol. Chem. 275 (38): 29767–71. Дои:10.1074 / jbc.M005782200. PMID  10884395.
12. Чанг М.С., Сасаки Х., Кэмпбелл М.С., Крафт С.К., Сазерленд Р., Ян С.Й., Лю Ю., Оклер Д., Хао Л., Сонода Х., Ферланд Л. Х., Чен Л. Б. (декабрь 1999 г.). «HRad17 колокализуется с NHP2L1 в ядрышке и перераспределяется после УФ-облучения». J. Biol. Chem. 274 (51): 36544–9. Дои:10.1074 / jbc.274.51.36544. PMID  10593953.
13. Post SM, Tomkinson AE, Lee EY (октябрь 2003 г.). «Человеческий контрольный белок Rad17 связан с хроматином на протяжении всего клеточного цикла, локализуется в сайтах репликации ДНК и взаимодействует с ДНК-полимеразой эпсилон». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (19): 5568–75. Дои:10.1093 / нар / gkg765. ЧВК  206465. PMID  14500819.
14. Dufault VM, Oestreich AJ, Vroman BT, Karnitz LM (декабрь 2003 г.). «Идентификация и характеристика RAD9B, паралога гена контрольной точки RAD9». Геномика. 82 (6): 644–51. Дои:10.1016 / s0888-7543 (03) 00200-3. PMID  14611806.
15. Линдси-Больц Л.А., Бермудес В.П., Гурвиц Дж., Санкар А. (сентябрь 2001 г.). «Очистка и характеристика рад-комплексов контрольной точки повреждения ДНК человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (20): 11236–41. Bibcode:2001ПНАС ... 9811236Л. Дои:10.1073 / pnas.201373498. ЧВК  58713. PMID  11572977.

дальнейшее чтение

• Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействиях хозяин-патоген». Cell Res. 15 (11–12): 923–34. Дои:10.1038 / sj.cr.7290370. PMID  16354571.
• аль-Ходайри Ф, Карр А.М. (1992). «Мутанты репарации ДНК, определяющие пути контрольных точек G2 у Schizosaccharomyces pombe». EMBO J. 11 (4): 1343–50. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05179.x. ЧВК  556583. PMID  1563350.
• Мосси Р., Йонссон З.О., Аллен Б.Л., Хардин С.Х., Хюбшер У. (1997). «Фактор репликации C взаимодействует с C-концевой стороной ядерного антигена пролиферирующих клеток» (PDF). J. Biol. Chem. 272 (3): 1769–76. Дои:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID  8999859. S2CID  14454322.
• Дин Ф. Б., Лиан Л., О'Доннелл М. (1999). «Клонирование кДНК и генное картирование человеческих гомологов для Schizosaccharomyces pombe rad17, rad1 и hus1 и клонирование гомологов от мыши, Caenorhabditis elegans и Drosophila melanogaster». Геномика. 54 (3): 424–36. Дои:10.1006 / geno.1998.5587. PMID  9878245.
• Bluyssen HA, Naus NC, van Os RI, Jaspers I., Hoeijmakers JH, de Klein A (1999). «Человеческие и мышиные гомологи гена контроля контрольной точки клеточного цикла Schizosaccharomyces pombe rad17 +». Геномика. 55 (2): 219–28. Дои:10.1006 / geno.1998.5642. PMID  9933569.
• Ли Л., Петерсон К.А., Кантер-Смолер Г., Вей Ю.Ф., Рамагли Л.С., Саннерхаген П., Сицилиано М.Дж., Легерски Р.Дж. (1999). «hRAD17, структурный гомолог гена контрольной точки клеточного цикла Schizosaccharomyces pombe RAD17, стимулирует накопление p53». Онкоген. 18 (9): 1689–99. Дои:10.1038 / sj.onc.1202469. PMID  10208430.
• Бао С., Чанг М.С., Оклер Д., Сунь И., Ван Ю., Вонг В. К., Чжан Дж., Лю Ю., Цянь Икс, Сазерленд Р., Маги-Галлузи С., Вайсберг Е., Ченг Е. Ю., Хао Л., Сасаки Н., Кэмпбелл М. С. Kraeft SK, Loda M, Lo KM, Chen LB (1999). «HRad17, человеческий гомолог гена rad17 контрольной точки Schizosaccharomyces pombe, сверхэкспрессируется при карциноме толстой кишки». Рак Res. 59 (9): 2023–8. PMID  10232579.
• фон Даймлинг Ф., Шарф Дж. М., Лир Т., Роте М., Келтер А. Р., Альберс П., Дитрих В. Ф., Кункель Л. М., Вернерт Н., Вирт Б. (1999). «Гены RAD17 человека и мыши: идентификация, локализация, геномная структура и паттерн гистологической экспрессии в нормальных семенниках и семенниках». Гм. Genet. 105 (1–2): 17–27. Дои:10.1007 / s004390051058. PMID  10480350.
• Чанг М.С., Сасаки Х., Кэмпбелл М.С., Крафт С.К., Сазерленд Р., Ян С.Й., Лю Ю., Оклер Д., Хао Л., Сонода Х, Ферланд Л. Х., Чен Л. Б. (2000). «HRad17 колокализуется с NHP2L1 в ядрышке и перераспределяется после УФ-облучения». J. Biol. Chem. 274 (51): 36544–9. Дои:10.1074 / jbc.274.51.36544. PMID  10593953.
• Ким С.Т., Лим Д.С., Канман CE, Кастан МБ (2000). «Субстратные особенности и идентификация предполагаемых субстратов членов семейства киназ ATM». J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. Дои:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID  10608806.
• Буртелоу М.А., Кауфманн С.Х., Карниц Л.М. (2000). «Сохранение комплекса контрольных точек человека Rad9 в устойчивых к экстракции ядерных комплексах после повреждения ДНК». J. Biol. Chem. 275 (34): 26343–8. Дои:10.1074 / jbc.M001244200. PMID  10852904.
• Рауэн М., Буртелоу М.А., Дюфа В.М., Карниц Л.М. (2000). «Белок контрольной точки человека hRad17 взаимодействует с PCNA-подобными белками hRad1, hHus1 и hRad9». J. Biol. Chem. 275 (38): 29767–71. Дои:10.1074 / jbc.M005782200. PMID  10884395.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Бао С., Тиббетс Р.С., Брамбо К.М., Фанг Й., Ричардсон Д.А., Али А., Чен С.М., Абрахам Р.Т., Ван XF (2001). «ATR / ATM-опосредованное фосфорилирование человеческого Rad17 необходимо для генотоксических стрессовых реакций». Природа. 411 (6840): 969–74. Bibcode:2001Натура.411..969Б. Дои:10.1038/35082110. PMID  11418864. S2CID  4429058.
• Линдси-Больц Л.А., Бермудес В.П., Гурвиц Дж., Санкар А. (2001). «Очистка и характеристика рад-комплексов контрольной точки повреждения ДНК человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (20): 11236–41. Bibcode:2001ПНАС ... 9811236Л. Дои:10.1073 / pnas.201373498. ЧВК  58713. PMID  11572977.
• Чен М.С., Хигашикубо Р., Ласло А., Роти Роти Дж. (2001). «Множественные альтернативные формы сплайсинга человеческого RAD17 и их дифференциальный ответ на ионизирующее излучение». Ген. 277 (1–2): 145–52. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00692-8. PMID  11602352.
• Пост С., Вен YC, Cimprich K, Chen LB, Xu Y, Lee EY (2001). «Фосфорилирование серинов 635 и 645 человеческого Rad17 регулируется клеточным циклом и требуется для активации контрольной точки G1 / S в ответ на повреждение ДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (23): 13102–7. Дои:10.1073 / pnas.231364598. ЧВК  60831. PMID  11687627.