Гомолог RAD1 - RAD1 homolog

RAD1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3A1J, 3G65, 3GGR
Идентификаторы
Псевдонимы	RAD1, HREC1, гомолог RAD1, экзонуклеаза ДНК контрольной точки RAD1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603153 MGI: 1316678 ГомолоГен: 37695 Генные карты: RAD1
Номер ЕС	3.1.11.2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5п13.2 Начните 34,905,260 бп[1] Конец 34,918,989 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 A1 Начните 10,486,018 бп[2] Конец 10,499,063 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • повреждение связывания ДНК • активность экзодезоксирибонуклеазы III • GO: 0001948 связывание с белками • 3'-5 'экзонуклеазная активность • нуклеазная активность • экзонуклеазная активность • гидролазная активность Сотовый компонент • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • хромосома • нуклеоплазма • КПП зажимной комплекс • ядро клетки Биологический процесс • развитие черной субстанции • Контрольная точка повреждения ДНК • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • Репликация ДНК • контрольная точка мейотической рекомбинации • клеточный ответ на ионизирующее излучение • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 • Ремонт ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5810	19355
Ансамбль	ENSG00000113456	ENSMUSG00000022248
UniProt	O60671	Q9QWZ1
RefSeq (мРНК)	NM_001033673 NM_002853 NM_133282 NM_133377	NM_001289447 NM_001289448 NM_011232
RefSeq (белок)	NP_002844	NP_001276376 NP_001276377 NP_035362
Расположение (UCSC)	Chr 5: 34.91 - 34.92 Мб	Chr 15: 10.49 - 10.5 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок контрольной точки клеточного цикла RAD1 это белок что у людей кодируется RAD1 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует компонент комплекса контрольной точки гетеротримерного клеточного цикла, известный как комплекс 9-1-1, который активируется для остановки прогрессирования клеточного цикла в ответ на повреждение ДНК или неполную репликацию ДНК. Комплекс 9-1-1 рекрутируется RAD17 в пораженные участки, где он может привлекать специализированные ДНК-полимеразы и другие эффекторы репарации ДНК. Описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы этого гена.^[7]

Взаимодействия

Было показано, что гомолог RAD1 взаимодействовать с участием:

• HUS1,^[8][9]
• RAD17,^[10][11][12] и
• RAD9A,^{[8][13][14][15][16]}

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113456 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022248 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фрейре Р., Мургуиа Дж. Р., Тарсунас М., Лаундес Н. Ф., Моэн П. Б., Джексон С. П. (сентябрь 1998 г.). «Человеческие и мышиные гомологи Schizosaccharomyces pombe rad1 (+) и Saccharomyces cerevisiae RAD17: связь с контролем контрольных точек и мейозом млекопитающих». Genes Dev. 12 (16): 2560–73. Дои:10.1101 / gad.12.16.2560. ЧВК  317084. PMID  9716408.
6. Блюссен Х.А., ван Ос Р.И., Наус Н.С., Ясперс И., Хоймейкерс Дж. Х., де Кляйн А. (январь 1999 г.) «Человеческий и мышиный гомолог гена контроля контрольной точки клеточного цикла Schizosaccharomyces pombe rad1 +». Геномика. 54 (2): 331–7. Дои:10.1006 / geno.1998.5582. PMID  9828137.
7. «Ген Entrez: RAD1 гомолог RAD1 (S. pombe)».
8. Фолькмер Э., Карниц Л.М. (январь 1999 г.). «Человеческие гомологи Schizosaccharomyces pombe rad1, hus1 и rad9 образуют белковый комплекс, чувствительный к повреждению ДНК». J. Biol. Chem. 274 (2): 567–70. Дои:10.1074 / jbc.274.2.567. PMID  9872989. S2CID  28787137.
9. Ханг Х, Чжан И, Данбрак Р.Л., Ван С., Либерман Х.Б. (апрель 2002 г.). «Идентификация и характеристика паралога гена контрольной точки клеточного цикла человека HUS1». Геномика. 79 (4): 487–92. Дои:10.1006 / geno.2002.6737. PMID  11944979.
10. Бермудес В.П., Линдси-Больц Л.А., Чезаре А.Дж., Манива Ю., Гриффит Дж. Д., Гурвиц Дж., Санкар А. (февраль 2003 г.). «Загрузка комплекса контрольных точек человека 9-1-1 на ДНК с помощью загрузчика контрольных точек hRad17-фактор репликации C in vitro». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (4): 1633–8. Дои:10.1073 / pnas.0437927100. ЧВК  149884. PMID  12578958.
11. Рауэн М., Буртелоу М.А., Дюфа В.М., Карниц Л.М. (сентябрь 2000 г.). «Белок контрольной точки человека hRad17 взаимодействует с PCNA-подобными белками hRad1, hHus1 и hRad9». J. Biol. Chem. 275 (38): 29767–71. Дои:10.1074 / jbc.M005782200. PMID  10884395. S2CID  34505615.
12. Бао С., Тиббетс Р.С., Брамбо К.М., Фанг Й., Ричардсон Д.А., Али А., Чен С.М., Абрахам Р.Т., Ван XF (июнь 2001 г.). «ATR / ATM-опосредованное фосфорилирование человеческого Rad17 необходимо для генотоксических стрессовых реакций». Природа. 411 (6840): 969–74. Дои:10.1038/35082110. PMID  11418864. S2CID  4429058.
13. Dufault VM, Oestreich AJ, Vroman BT, Karnitz LM (декабрь 2003 г.). «Идентификация и характеристика RAD9B, паралога гена контрольной точки RAD9». Геномика. 82 (6): 644–51. Дои:10.1016 / s0888-7543 (03) 00200-3. PMID  14611806.
14. Гриффит Дж. Д., Линдси-Больц Л. А., Санкар А. (май 2002 г.). «Структуры человеческого Rad17-фактор репликации С и контрольных точек Rad 9-1-1, визуализированные с помощью глицеринового спрея / низковольтной микроскопии». J. Biol. Chem. 277 (18): 15233–6. Дои:10.1074 / jbc.C200129200. PMID  11907025. S2CID  24820773.
15. Хираи И., Ван Х. Г. (июль 2002 г.). «Роль C-концевой области человеческого Rad9 (hRad9) в ядерном транспорте комплекса контрольных точек hRad9». J. Biol. Chem. 277 (28): 25722–7. Дои:10.1074 / jbc.M203079200. PMID  11994305. S2CID  35202138.
16. Линдси-Больц Л.А., Бермудес В.П., Гурвиц Дж., Санкар А. (сентябрь 2001 г.). «Очистка и характеристика радиокомплексов контрольной точки повреждения ДНК человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (20): 11236–41. Дои:10.1073 / pnas.201373498. ЧВК  58713. PMID  11572977.

дальнейшее чтение

• Бардвелл А.Дж., Бардвелл Л., Джонсон Д.К., Фридберг ЕС (1993). «Белки рекомбинации и репарации дрожжевой ДНК Rad1 и Rad10 составляют комплекс in vivo, опосредованный локализованными гидрофобными доменами». Мол. Микробиол. 8 (6): 1177–88. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1993.tb01662.x. PMID  8361362. S2CID  45135386.
• Паркер А.Е., Ван де Вейер I, Лаус М.С., Ооствин I, Йон Дж., Верхассельт П., Луйтен WH (1998). «Человеческий гомолог гена контрольной точки Rad1 + Schizosaccharomyces pombe кодирует экзонуклеазу». J. Biol. Chem. 273 (29): 18332–9. Дои:10.1074 / jbc.273.29.18332. PMID  9660799. S2CID  24604811.
• Уделл С.М., Ли С.К., Дэйви С. (1998). «HRAD1 и MRAD1 кодируют гомологи гена контроля контрольной точки клеточного цикла делящихся дрожжей rad1 (+)». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (17): 3971–6. Дои:10.1093 / nar / 26.17.3971. ЧВК  147814. PMID  9705507.
• Marathi UK, Dahlen M, Sunnerhagen P, Romero AV, Ramagli LS, Siciliano MJ, Li L, Legerski RJ (1999). «RAD1, человеческий структурный гомолог гена контрольной точки клеточного цикла RAD1 Schizosaccharomyces pombe». Геномика. 54 (2): 344–7. Дои:10.1006 / geno.1998.5589. PMID  9828139.
• Фолькмер Э., Карниц Л.М. (1999). «Человеческие гомологи Schizosaccharomyces pombe rad1, hus1 и rad9 образуют белковый комплекс, чувствительный к повреждению ДНК». J. Biol. Chem. 274 (2): 567–70. Дои:10.1074 / jbc.274.2.567. PMID  9872989. S2CID  28787137.
• Дин Ф. Б., Лиан Л., О'Доннелл М. (1999). «Клонирование кДНК и генное картирование человеческих гомологов для Schizosaccharomyces pombe rad17, rad1 и hus1 и клонирование гомологов от мышей, Caenorhabditis elegans и Drosophila melanogaster». Геномика. 54 (3): 424–36. Дои:10.1006 / geno.1998.5587. PMID  9878245.
• Сент-Онге Р.П., Уделл С.М., Кассельман Р., Дэйви С. (1999). «Контрольный белок контрольной точки G2 человека hRAD9 представляет собой ядерный фосфопротеин, который образует комплексы с hRAD1 и hHUS1». Мол. Биол. Ячейка. 10 (6): 1985–95. Дои:10.1091 / mbc.10.6.1985. ЧВК  25401. PMID  10359610.
• Повесьте H, Либерман HB (2000). «Физические взаимодействия между человеческими контрольными белками контрольных точек HUS1p, RAD1p и RAD9p, и их значение для регуляции развития клеточного цикла». Геномика. 65 (1): 24–33. Дои:10.1006 / geno.2000.6142. PMID  10777662.
• Цай Р.Л., Ян-Нил Ю., Куэто М.А., Сюй Х., Коэн Д. (2000). «HDAC1, гистоновая деацетилаза, образует комплекс с Hus1 и Rad9, двумя белками Rad контрольной точки G2 / M». J. Biol. Chem. 275 (36): 27909–16. Дои:10.1074 / jbc.M000168200. PMID  10846170.
• Буртелоу М.А., Кауфманн С.Х., Карниц Л.М. (2000). «Сохранение комплекса контрольных точек человека Rad9 в устойчивых к экстракции ядерных комплексах после повреждения ДНК». J. Biol. Chem. 275 (34): 26343–8. Дои:10.1074 / jbc.M001244200. PMID  10852904. S2CID  24638557.
• Рауэн М., Буртелоу М.А., Дюфа В.М., Карниц Л.М. (2000). «Белок контрольной точки человека hRad17 взаимодействует с PCNA-подобными белками hRad1, hHus1 и hRad9». J. Biol. Chem. 275 (38): 29767–71. Дои:10.1074 / jbc.M005782200. PMID  10884395. S2CID  34505615.
• Буртелоу М.А., Роос-Маттьюс П.М., Рауэн М., Бабендур-младший, Карниц Л.М. (2001). «Реконструкция и молекулярный анализ комплекса контрольных точек hRad9-hHus1-hRad1 (9-1-1), чувствительного к повреждению ДНК». J. Biol. Chem. 276 (28): 25903–9. Дои:10.1074 / jbc.M102946200. PMID  11340080. S2CID  25624886.
• Бао С., Тиббетс Р.С., Брамбо К.М., Фанг Й., Ричардсон Д.А., Али А., Чен С.М., Абрахам Р.Т., Ван XF (2001). «ATR / ATM-опосредованное фосфорилирование человеческого Rad17 необходимо для генотоксических стрессовых реакций». Природа. 411 (6840): 969–74. Дои:10.1038/35082110. PMID  11418864. S2CID  4429058.
• Сян С.Л., Кумано Т., Ивасаки С.И., Сун X, Йошиока К., Ямамото К.С. (2001). «J-домен Tpr2 регулирует его взаимодействие с проапоптотическим белком и белком контрольной точки клеточного цикла, Rad9». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 287 (4): 932–40. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5685. PMID  11573955.
• Zou L, Cortez D, Elledge SJ (2002). «Регулирование выбора субстрата ATR с помощью Rad17-зависимой загрузки комплексов Rad9 на хроматин». Genes Dev. 16 (2): 198–208. Дои:10.1101 / gad.950302. ЧВК  155323. PMID  11799063.
• Гриффит Дж. Д., Линдси-Больц Л. А., Санкар А (2002). «Структуры человеческого Rad17-фактор репликации С и контрольных точек Rad 9-1-1, визуализированные с помощью глицеринового спрея / низковольтной микроскопии». J. Biol. Chem. 277 (18): 15233–6. Дои:10.1074 / jbc.C200129200. PMID  11907025. S2CID  24820773.
• Ханг Х, Чжан И, Данбрак Р.Л., Ван С., Либерман Х.Б. (2002). «Идентификация и характеристика паралога гена контрольной точки клеточного цикла человека HUS1». Геномика. 79 (4): 487–92. Дои:10.1006 / geno.2002.6737. PMID  11944979.
• Хирай И., Ван Х. Г. (2002). «Роль C-концевой области человеческого Rad9 (hRad9) в ядерном транспорте комплекса контрольных точек hRad9». J. Biol. Chem. 277 (28): 25722–7. Дои:10.1074 / jbc.M203079200. PMID  11994305. S2CID  35202138.