RAG1 - RAG1

RAG1
Идентификаторы
ПсевдонимыRAG1, RAG-1, RNF74, ген активации рекомбинации 1, ген активации рекомбинации 1
Внешние идентификаторыOMIM: 179615 MGI: 97848 ГомолоГен: 387 Генные карты: RAG1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение RAG1
Геномное расположение RAG1
Группа11p12Начинать36,510,709 бп[1]
Конец36,593,156 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_000448

NM_009019

RefSeq (белок)

NP_000439
NP_001364206
NP_001364207
NP_001364208
NP_001364209

NP_033045

Расположение (UCSC)Chr 11: 36.51 - 36.59 МбChr 2: 101,64 - 101,65 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ген 1, активирующий рекомбинацию также известный как РАГ-1 это белок что у людей кодируется RAG1 ген.[5]

RAG1 и RAG2 гены в значительной степени законсервированы у людей. 55,99% и 55,98% кодируемых аминокислот не содержат описанных вариантов соответственно.[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, участвует в антитело и Рецептор Т-клеток V (D) J рекомбинация. RAG-1 участвует в распознавании субстрата ДНК, но для стабильной активности связывания и расщепления также требуется РАГ-2. В Комплекс РАГ-1/2 признает сигнальные последовательности рекомбинации (RSS), фланкирующие области V, D и J в генах, которые кодируют тяжелый и легкие цепи антител и компонентов Т-клеточных рецепторов. Комплекс связывается с RSS и разрезает ДНК. Это приводит к удалению промежуточной ДНК и возможному лигированию последовательностей V, D и J.[7] Дефекты этого гена могут вызывать несколько различных заболеваний.[5]

Клиническое значение

Из-за этих эффектов делеция Rag1 используется в мышиных моделях болезни для ослабления Т-клетка и В клетка развития и функционально удаляет зрелые Т- и В-клетки из иммунной системы.[8]

У людей дефицит RAG был впервые признан формой иммунной дисрегуляции, известной как Синдром Оменна. Дефицит РАГ считается аутосомно-рецессивный болезнь. Заболевание обычно выявляется у младенцев. Полная потеря функции в RAG1 / 2, основных компонентах, ответственных за активность рекомбинации V (D) J, вызывает тяжелый иммунодефицит у людей. Гипоморфные варианты RAG могут сохранять частичную рекомбинационную активность[9] и приводят к отчетливому фенотипу комбинированного иммунодефицита с гранулемой и / или аутоиммунитетом (CID-G / A).[10][11][12] Дефицит RAG можно измерить путем количественной оценки рекомбинационной активности in vitro.[13][14][15] К настоящему времени (2019 г.) функционально исследованы 71 вариант RAG1 и 39 вариантов RAG2 (менее 10% потенциальных точечных мутаций, которые могут вызывать заболевание). Однако основные варианты-кандидаты были ранжированы по их предполагаемой клинической значимости.[6]


Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166349 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061311 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Энтреза: ген 1, активирующий рекомбинацию».
  6. ^ а б Лоулесс Д., Ланго Аллен Х., Тавентиран Дж., Ходель Ф., Анвар Р., Феллай Дж и др. (Август 2019 г.). «Прогнозирование появления вариантов в RAG1 и RAG2». Журнал клинической иммунологии. 39 (7): 688–701. Дои:10.1007 / s10875-019-00670-z. ЧВК  6754361. PMID  31388879.
  7. ^ Оуэн Дж, Пунт Дж, Стрэнфорд С, Джонс П. (2013). Кубы Иммунология. Нью-Йорк: В. Х. Фриман и компания. С. 234–237. ISBN  978-14292-1919-8.
  8. ^ "Подробная информация о штамме мышей B6.129S7-Rag1tm1Mom / J". Джексон Лаборатории.
  9. ^ Вилла А, Сантагата С., Боззи Ф., Джилиани С., Фраттини А., Имберти Л. и др. (Май 1998 г.). «Частичная активность рекомбинации V (D) J приводит к синдрому Оменна». Клетка. 93 (5): 885–96. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81448-8. PMID  9630231. S2CID  1527777.
  10. ^ Schuetz C, Huck K, Gudowius S, Megahed M, Feyen O, Hubner B и др. (Май 2008 г.). «Иммунодефицитное заболевание с мутациями RAG и гранулемами». Медицинский журнал Новой Англии. 358 (19): 2030–8. Дои:10.1056 / nejmoa073966. PMID  18463379.
  11. ^ Walter JE, Rosen LB, Csomos K, Rosenberg JM, Mathew D, Keszei M, et al. (Ноябрь 2015 г.). «Антитела широкого спектра действия против аутоантигенов и цитокинов при дефиците RAG». Журнал клинических исследований. 125 (11): 4135–48. Дои:10.1172 / jci80477. ЧВК  4639965. PMID  26457731.
  12. ^ Кван А., Абрахам Р.С., Карриер Р., Брауэр А., Андрушевски К., Эбботт Дж. К. и др. (Август 2014 г.). «Скрининг новорожденных на тяжелый комбинированный иммунодефицит в 11 программах скрининга в США». JAMA. 312 (7): 729–38. Дои:10.1001 / jama.2014.9132. ЧВК  4492158. PMID  25138334.
  13. ^ Лоулесс Д., Гейер С.Б., Фармер Дж. Р., Ланго Аллен Х., Туэйтс Д., Ачекзей Ф. и др. (Июнь 2018). «Распространенность и клинические проблемы среди взрослых с первичным иммунодефицитом и дефицитом генов, активирующих рекомбинацию». Журнал аллергии и клинической иммунологии. 141 (6): 2303–2306. Дои:10.1016 / j.jaci.2018.02.007. ЧВК  6058308. PMID  29477728.
  14. ^ Ли Ю.Н., Фругони Ф., Доббс К., Уолтер Дж. Э., Джилиани С., Геннери А. Р. и др. (Апрель 2014 г.). «Систематический анализ активности рекомбинации и корреляции генотип-фенотип при дефиците гена 1, активирующего рекомбинацию человека». Журнал аллергии и клинической иммунологии. 133 (4): 1099–108. Дои:10.1016 / j.jaci.2013.10.007. ЧВК  4005599. PMID  24290284.
  15. ^ Тирош И., Ямадзаки Ю., Фругони Ф., Верверс Ф.А., Алленспах Е.Дж., Чжан Ю.и др. (Февраль 2019). «Рекомбинационная активность мутаций гена 2, активирующего рекомбинацию человека (RAG2), и корреляция с клиническим фенотипом». Журнал аллергии и клинической иммунологии. 143 (2): 726–735. Дои:10.1016 / j.jaci.2018.04.027. ЧВК  6295349. PMID  29772310.