RBM3 - RBM3

RBM3
Идентификаторы
Псевдонимы	RBM3, IS1-RNPL, RNPL, РНК-связывающий мотив (RNP1, RRM), белок 3, РНК-связывающий мотив, белок 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 300027 MGI: 3642874 ГомолоГен: 31404 Генные карты: RBM3
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xp11.23 Начните 48,574,449 бп[1] Конец 48,581,162 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК • Связывание мРНК 3'-UTR • связывание поли (U) РНК • деятельность репрессора перевода • связывание большой субъединицы рибосомы • связывание малых рибосомных субъединиц рРНК Сотовый компонент • цитоплазма • большая рибосомная субъединица • дендрит • проекция клетки • ядрышко • ядро клетки • нуклеоплазма • сплайсосомальный комплекс • рибонуклеопротеин Биологический процесс • Обработка РНК • регулирование перевода • положительное регулирование перевода • реакция на холод • отрицательное регулирование перевода • положительная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5935	100043257
Ансамбль	ENSG00000102317	н / д
UniProt	P98179	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001017430 NM_001017431 NM_006743	н / д
RefSeq (белок)	NP_006734	н / д
Расположение (UCSC)	Chr X: 48,57 - 48,58 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Предполагаемый РНК-связывающий белок 3 это белок что у людей кодируется RBM3 ген.^[4][5]

Функция

Этот ген является членом глицин -богатое семейство связывающих РНК белков и кодирует белок с одним доменом мотива распознавания РНК (RRM). Экспрессия этого гена вызвана холодовым шоком и низким давлением кислорода. А псевдоген существует на хромосоме 1. Альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, кодирующие разные изоформы, были охарактеризованы.^[5]

RBM3 представляет собой индуцируемый холодом РНК-связывающий белок и участвует в биогенезе мРНК, оказывает анти-апоптотический эффекты.^[6] Согласно с антитело профилирование и транскриптомика анализ, белок RBM3 присутствует во всех проанализированных тканях человека^[7] и на основе конфокальная микроскопия в основном локализован на нуклеоплазма.^[8]

Клиническое значение

RBM3 - это протоонкоген что связано с прогрессированием опухоли и метастазированием и является потенциальным раком биомаркер.^[6] Основываясь на данных о выживаемости пациентов, высокий уровень белка RBM3 в опухолевых клетках является благоприятным прогностический биомаркер в колоректальный рак.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102317 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Дерри Дж. М., Кернс Дж. А., Франк У. (декабрь 1995 г.). «RBM3, новый ген человека в Xp11.23 с предполагаемым РНК-связывающим доменом». Молекулярная генетика человека. 4 (12): 2307–11. Дои:10.1093 / hmg / 4.12.2307. PMID  8634703.
5. «Ген Entrez: RBM3 РНК-связывающий мотив (RNP1, RRM), белок 3».
6. Чжоу РБ, Лу XL, Чжан CY, Инь, округ Колумбия (март 2017 г.). «Белок-связывающий РНК-мотив 3: потенциальный биомаркер рака и терапевтическая мишень нейрозащиты». Oncotarget. 8 (13): 22235–22250. Дои:10.18632 / oncotarget.14755. ЧВК  5400660. PMID  28118608.
7. «Тканевая экспрессия RBM3 - Резюме». Атлас белков человека.
8. «Сотовый атлас - РБМ3». Атлас белков человека.
9. «Экспрессия RBM3 при раке - Резюме». Атлас белков человека.

дальнейшее чтение

• Данно С., Нишияма Х, Хигасицудзи Х, Йокои Х, Сюэ Дж. Х., Ито К., Мацуда Т., Фудзита Дж. (Июль 1997 г.). «Повышенный уровень транскрипта RBM3, члена семейства богатых глицином РНК-связывающих белков, в клетках человека в ответ на холодовой стресс». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 236 (3): 804–7. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7059. PMID  9245737.
• Чаппелл С.А., Мауро В.П. (сентябрь 2003 г.). «Внутренний сайт входа в рибосому (IRES), содержащийся в мРНК белка 3 (Rbm3), связывающего РНК, состоит из функционально различных элементов». Журнал биологической химии. 278 (36): 33793–800. Дои:10.1074 / jbc.M303495200. PMID  12824175.
• Wellmann S, Bührer C, Moderegger E, Zelmer A, Kirschner R, Koehne P, Fujita J, Seeger K (апрель 2004 г.). «Регулируемая кислородом экспрессия РНК-связывающих белков RBM3 и CIRP с помощью HIF-1-независимого механизма». Журнал клеточной науки. 117 (Pt 9): 1785–94. Дои:10.1242 / jcs.01026. PMID  15075239.
• Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (май 2004 г.). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Аналитическая химия. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Деллис С., Стрикленд К.С., МакКрари В.Дж., Патель А., Стокум Е., Райт К.Ф. (ноябрь 2004 г.). «Белковые взаимодействия между факторами поздней транскрипции вируса осповакцины». Вирусология. 329 (2): 328–36. Дои:10.1016 / j.virol.2004.08.017. HDL:10161/15063. PMID  15518812.
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Леунг А.К., Онг С.Е., Лион CE, Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413.
• Онг С.Е., Миттлер Г., Манн М. (ноябрь 2004 г.). «Идентификация и количественная оценка сайтов метилирования in vivo с помощью тяжелого метилового SILAC». Природные методы. 1 (2): 119–26. Дои:10.1038 / nmeth715. PMID  15782174.
• Мартинес-Аррибас Ф., Агудо Д., Поллан М., Гомес-Эскер Ф., Диас-Хиль Дж., Лукас Р., Шнайдер Дж. (Апрель 2006 г.). «Положительная корреляция между экспрессией генов RBM X-хромосомы (RBMX, RBM3, RBM10) и проапоптотического гена Bax при раке груди человека». Журнал клеточной биохимии. 97 (6): 1275–82. Дои:10.1002 / jcb.20725. PMID  16552754.