S100A8 - S100A8

S100A8
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1MR8, 1XK4, 4GGF, 4XJK, 5HLO, 5HLV
Идентификаторы
Псевдонимы	S100A8, 60B8AG, CAGA, CFAG, CGLA, CP-10, L1Ag, MA387, MIF, MRP8, NIF, P8, кальций-связывающий белок A8 S100
Внешние идентификаторы	OMIM: 123885 MGI: 88244 ГомолоГен: 2225 Генные карты: S100A8
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.3 Начните 153,390,032 бп[1] Конец 153,391,073 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 F1 | 3 39,9 см Начните 90,668,978 бп[2] Конец 90,670,035 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание с Toll-подобным рецептором 4 • Связывание рецептора RAGE • связывание микротрубочек • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов кальция • связывание арахидоновой кислоты • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов Сотовый компонент • ядро клетки • цитоскелет • цитозоль • внеклеточная экзосома • мембрана • клеточная мембрана • цитоплазма • внеклеточный • просвет секреторной гранулы • цитоскелет промежуточных филаментов • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • регуляция воспалительного ответа • активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • иммунная система • положительная регуляция воспалительного ответа • хемотаксис нейтрофилов • положительная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути • защитная реакция на грибок • реакция на этанол • производство хемокинов • реакция на ион цинка • острый воспалительный ответ • защитный ответ на бактерию • миграция лейкоцитов, участвующих в воспалительной реакции • S-нитрозилирование пептидил-цистеина • секвестирование иона цинка • агрегация нейтрофилов • ответ на липополисахарид • хемотаксис • положительное регулирование секреции пептидов • хроническое воспаление • развитие астроцитов • лечение раны • апоптотический процесс • положительное регулирование роста клеток • аутофагия • воспалительная реакция • регуляция организации цитоскелета • производство цитокинов • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • врожденная иммунная система • сигнальный путь толл-подобных рецепторов • антимикробный гуморальный ответ • дегрануляция нейтрофилов • аутокринная сигнализация Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6279	20201
Ансамбль	ENSG00000143546	ENSMUSG00000056054
UniProt	P05109	P27005
RefSeq (мРНК)	NM_002964 NM_001319196 NM_001319197 NM_001319198 NM_001319201	NM_013650
RefSeq (белок)	NP_001306125 NP_001306126 NP_001306127 NP_001306130 NP_002955	NP_038678
Расположение (UCSC)	Chr 1: 153.39 - 153.39 Мб	Chr 3: 90.67 - 90.67 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

S100 кальций-связывающий белок A8 (S100A8) это белок что у людей кодируется S100A8 ген.^[5] Он также известен как кальгранулин А.

Белки S100A8 и S100A9 сформировать гетеродимер называется кальпротектин.

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков S100, содержащего 2 кальций-связывающих мотива EF-hand. Белки S100 локализованы в цитоплазме и / или ядре широкого круга клеток и участвуют в регуляции ряда клеточных процессов, таких как прогрессия и дифференцировка клеточного цикла. Гены S100 включают по крайней мере 13 членов, которые расположены в виде кластера на хромосоме 1q21. Этот белок может действовать при ингибировании казеинкиназы и как цитокин. Измененная экспрессия этого белка связана с заболеванием кистозный фиброз.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143546 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056054 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: S100A8 S100 кальций-связывающий белок A8».

дальнейшее чтение

• Шефер Б.В., Хейцманн С.В. (1996). «Семейство S100 кальций-связывающих белков руки EF: функции и патология». Trends Biochem. Наука. 21 (4): 134–40. Дои:10.1016 / S0968-0004 (96) 80167-8. PMID  8701470.
• Керкхофф К., Клемпт М., Сорг С. (1999). «Новое понимание структуры и функций MRP8 (S100A8) и MRP14 (S100A9)». Биохим. Биофиз. Acta. 1448 (2): 200–11. Дои:10.1016 / S0167-4889 (98) 00144-X. PMID  9920411.
• Накен В., Рот Дж, Сорг С., Керкхофф С. (2003). «S100A9 / S100A8: миелоидные представители семейства белков S100 как важные участники врожденного иммунитета». Microsc. Res. Технология. 60 (6): 569–80. Дои:10.1002 / jemt.10299. PMID  12645005.
• Рот Дж, Фогл Т, Сорг С, Сандеркёттер С (2004). «Фагоцит-специфические белки S100: новая группа провоспалительных молекул». Тенденции Иммунол. 24 (4): 155–8. Дои:10.1016 / S1471-4906 (03) 00062-0. PMID  12697438.
• Расмуссен Х. Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М. и др. (1993). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез. 13 (12): 960–9. Дои:10.1002 / elps.11501301199. PMID  1286667.
• Lemarchand P, Vaglio M, Mauël J, Markert M (1992). «Транслокация небольшого цитозольного кальцийсвязывающего белка (MRP-8) на плазматическую мембрану коррелирует с активацией нейтрофилов человека». J. Biol. Chem. 267 (27): 19379–82. PMID  1326551.
• Шефер Т., Заксе Г.Е., Гассен Х.Г. (1991). «Кальций-связывающий белок MRP-8 продуцируется опухолевыми клетками легких человека». Биол. Chem. Hoppe-Seyler. 372 (1): 1–4. Дои:10.1515 / bchm3.1991.372.1.1. PMID  2039599.
• Дорин Дж. Р., Эмсли Э, ван Хейнинген В. (1991). «Родственные кальций-связывающие белки отображаются в одной и той же субрегионе хромосомы 1q и в расширенной области синтении на хромосоме 3 мыши». Геномика. 8 (3): 420–6. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90027-П. PMID  2149559.
• Уилкинсон М.М., Бусуттил А., Хейворд С. и др. (1989). «Паттерн экспрессии двух связанных кальций-связывающих белков, связанных с кистозным фиброзом, в нормальных и аномальных тканях». J. Cell Sci. 91 (2): 221–30. PMID  3267695.
• Odink K, Cerletti N, Brüggen J и др. (1987). «Два кальций-связывающих белка в макрофагах инфильтрата ревматоидного артрита». Природа. 330 (6143): 80–2. Дои:10.1038 / 330080a0. PMID  3313057.
• Лагассе Э., Клерк Р.Г. (1988). «Клонирование и экспрессия двух человеческих генов, кодирующих кальций-связывающие белки, которые регулируются во время миелоидной дифференцировки». Мол. Cell. Биол. 8 (6): 2402–10. ЧВК  363438. PMID  3405210.
• Дорин Дж. Р., Новак М., Хилл Р. Э. и др. (1987). «Ключ к основному дефекту кистозного фиброза от клонирования гена антигена CF». Природа. 326 (6113): 614–7. Дои:10.1038 / 326614a0. PMID  3561500.
• Шефер Б.В., Вики Р., Энгелькамп Д. и др. (1995). «Выделение клона YAC, покрывающего кластер из девяти генов S100 на хромосоме 1q21 человека: обоснование новой номенклатуры семейства кальций-связывающих белков S100». Геномика. 25 (3): 638–43. Дои:10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID  7759097.
• Умекава Т., Курита Т. (1995). «Кальпротектин-подобный белок связан с растворимой органической матрицей в мочевом камне из оксалата кальция». Biochem. Мол. Биол. Int. 34 (2): 309–13. PMID  7849642.
• Энгелькамп Д., Шефер Б.В., Маттей М.Г. и др. (1993). «Шесть генов S100 сгруппированы на хромосоме 1q21 человека: идентификация двух генов, кодирующих два ранее неизвестных кальций-связывающих белка S100D и S100E». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (14): 6547–51. Дои:10.1073 / пнас.90.14.6547. ЧВК  46969. PMID  8341667.
• Рот Дж., Бурвинкель Ф., ван ден Бос С. и др. (1993). «MRP8 и MRP14, S-100-подобные белки, связанные с миелоидной дифференцировкой, перемещаются к плазматической мембране и промежуточным филаментам кальций-зависимым образом». Кровь. 82 (6): 1875–83. PMID  8400238.
• Миясаки К.Т., Бодо А.Л., Мурти А.Р., Лерер Р.И. (1993). «Антимикробная активность in vitro цитозольного белкового комплекса S-100 нейтрофилов человека, кальпротектина, против Capnocytophaga sputigena». J. Dent. Res. 72 (2): 517–23. Дои:10.1177/00220345930720020801. PMID  8423249.
• Марти Т., Эрттманн К.Д., Галлин М.Ю. (1996). «Взаимодействие хозяин-паразит при онхоцеркозе человека: идентификация и анализ последовательности нового кальгранулина человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 221 (2): 454–8. Дои:10.1006 / bbrc.1996.0616. PMID  8619876.