SERINC5 - SERINC5

Инкорпоратор серина 5 это белок что у людей кодируется SERINC5 ген.[1]

SERINC5
Идентификаторы
ПсевдонимыSERINC5, C5orf12, TPO1, инкорпоратор серина 5, открытая рамка считывания 12 хромосомы 5, AIGP3, C86123, A130038L21Rik
Внешние идентификаторыOMIM: 614551 MGI: 2444223 ГомолоГен: 65246 Генные карты: SERINC5
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[2]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение SERINC5
Геномное расположение SERINC5
Группа5q14.1Начните80,111,651 бп[2]
Конец80,256,048 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон
SERINC5 RNA Expression.png человека (Homo sapiens)

Экспрессия РНК SERINC5 у мышей.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001174071
NM_001174072
NM_178276

NM_172588

RefSeq (белок)

NP_001167542
NP_001167543
NP_840060

NP_766176

Расположение (UCSC)Chr 5: 80,11 - 80,26 МбChr 13: 92.61 - 92.71 Мб
PubMed поиск[4][5]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Свойства

SERINC5 - это белок, принадлежащий к семейству инкорпораторов серина (SERINC) в предсказанном классе мембранных белков.[6] Считается, что белки SERINC5 помогают включать серин в определенные липидные двухслойные мембраны; однако ученые не уверены в их основной функции и физиологии.[7][8] Топология пяти белков в семействе SERINC человека поразительно схожа. Примерно 17% аминокислоты являются общими для этих белков.[8]

С-концевой трансмембранный домен

Белки SERINC имеют от 10 до 11 трансмембранные домены. Для того, чтобы SERINC5 локализовался на плазматической мембране для подавления инфекционности вирусов, требуется дополнительная c-концевой трансмембранный домен требуется.[7] Этот дополнительный трансмембранный домен позволяет белку стабильно экспрессироваться.

Антагонистические отношения

Эндоцитарный путь AP-2 в присутствии Nef.
Эндоцитарный путь AP-2 в отсутствие Nef.

Неф, вирусные белки glycoGag и S2 расположены по всему вириону ВИЧ-1, что способствует облегчению высвобождения ретровируса. Если присутствует SERINC5, при отсутствии определенных факторы вирулентности, запрещает частицам ретровируса ВИЧ сливаться с клеточной мембраной и включать их генетическую информацию в клетки-мишени.[9] Поскольку SERINC5 в основном локализуется через плазматическую мембрану и прикрепляется к везикулам, несущим вирусные частицы, фактор ограничения обладает способностью значительно снижать вирусную инфекционность на ранних стадиях инфекции.[10] В прошлых экспериментах наблюдалось, что самая высокая концентрация SERINC5, независимо от экспрессии Nef, снижала инфекционность примерно в 250 раз.[8] Хотя это плохо изучено, считается, что Nef является основной причиной разрушения SERINC5 и других факторов ограничения. В присутствии факторов вирулентности, в частности Nef, как клетки SERINC5, так и CD4 подавляются через лизосомную деградацию через Эндоцитарный путь AP-2.[10] Это вызывает быструю инфекционность и увеличение вирусная нагрузка.

использованная литература

  1. ^ "SERINC5 (Ген)". Генные Карты. Получено 24 апреля, 2019.
  2. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164300 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021703 - Ансамбль, Май 2017
  4. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  6. ^ "SERINC5". Атлас белков человека.
  7. ^ а б Чжан, Сяньфэн; Чжоу, Дао; Ян, Цзе; Линь, Юмей; Ши, Цзин; Чжан, Сихэ; Frabutt, Dylan A .; Цзэн, Сянвэй; Ли, Сунан (февраль 2017 г.). Росс, Сьюзен (ред.). «Идентификация SERINC5-001 как преобладающей сплайсированной изоформы для ограничения ВИЧ-1» (PDF). Журнал вирусологии. 91 (10): 1–13. Дои:10.1128 / JVI.00137-17. ЧВК  5411613. PMID  28275190 - через Американское общество микробиологии.
  8. ^ а б c Роза, Аннакиара; Чанде, Аджит; Зиглио, Серена; Де Санктис, Вероника; Берторелли, Роберто; Го, Ши Линь; Макколи, Шон М .; Новосельска, Анетта; Антонаракис, Стилианос Э. (октябрь 2015 г.). «HIV-1 Nef способствует инфицированию, исключая SERINC5 из включения вириона» (PDF). Природа. 526 (7572): 212–217. Дои:10.1038 / природа15399. ЧВК  4861059. PMID  26416734 - через PubMed.
  9. ^ Клюге, Сильвия Ф. (октябрь 2015 г.). «SnapShot: антивирусные факторы ограничения» (PDF). Ячейка. 163 (3): 774–774.e1. Дои:10.1016 / j.cell.2015.10.019. PMID  26496613. S2CID  32924308.
  10. ^ а б Чжэн, Юн-Хуэй; Ши, Цзин; Сюн, Ран; Чжоу, Дао; Су, Пэйи; Чжан, Сихэ; Цю, Сюйшэн; Ли, Хунмэй; Ли, Сунан (март 2018 г.). «Nef ВИЧ-1 противодействует рестрикции SERINC5 путем подавления регуляции SERINC5 через систему эндосома / лизосома» (PDF). Журнал вирусологии. 92 (11): 16. Дои:10.1128 / JVI.00196-18. ЧВК  5952139. PMID  29514909 - через Американское общество микробиологии.