SH2D3C - SH2D3C

SH2D3C
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3T6G
Идентификаторы
Псевдонимы	SH2D3C, Sh2d3c, Chat, Nsp3, Shep1, PRO34088, домен SH2, содержащий 3C
Внешние идентификаторы	OMIM: 604722 MGI: 1351631 ГомолоГен: 69145 Генные карты: SH2D3C
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q34.11 Начинать 127,738,317 бп[1] Конец 127,778,710 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 млрд Начинать 32,721,055 бп[2] Конец 32,755,512 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана Биологический процесс • передача сигнала, опосредованная малой GTPase • Каскад JNK • положительное регулирование передачи сигнала • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-серина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10044	27387
Ансамбль	ENSG00000095370	ENSMUSG00000059013
UniProt	Q8N5H7	Q9QZS8
RefSeq (мРНК)	NM_001142531 NM_001142532 NM_001142533 NM_001142534 NM_001252334 NM_005489 NM_170600	NM_001252547 NM_013781
RefSeq (белок)	NP_001136003 NP_001136004 NP_001136005 NP_001136006 NP_001239263 NP_005480 NP_733745	NP_001239476 NP_038809
Расположение (UCSC)	Chr 9: 127,74 - 127,78 Мб	Chr 2: 32,72 - 32,76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SH2 домен, содержащий 3C, также известный как SH2D3C, это белок что у людей кодируется SH2D3C ген.^[5]

Функция

Sh2d3c ген на хромосоме 9 человека, который кодирует SH2 домен содержащий белок, известный как NSP3. Гомолог мыши находится на хромосоме 2. Семейство белков NSP (новый SH2-содержащий белок) состоит из трех членов: NSP1, NSP2, и NSP3 (этот белок), все из которых имеют аналогичную архитектуру, с N-концевой SH2-домен, богатая пролином и серином область, которая содержит консенсусные последовательности для MAP киназа субстратов и консервированных C-конец, который связывается с Cas семейство адаптерных белков, а также демонстрирует гомологию с ГЭФ домены.

Первоначально NSP3 был идентифицирован тремя независимыми группами исследователей.^[6][7][8] Было показано, что мышиный гомолог NSP3 имеет две различные изоформы, генерируемые альтернативным сплайсингом, которые экспрессируются в разных тканях. Более короткая изоформа, известная как Chat (Cas /Hef1 ассоциированный датчик сигнала) экспрессируется в головном мозге, легких, сердце, почках, мышцах, печени и кишечнике, тогда как более крупная изоформа, известная как Chat-H («H» означает гемопоэтический), экспрессируется в селезенке, тимусе и лимфатический узел.^[8] Две изоформы различаются только своим N-концом, который, как было показано одной группой, важен для локализации на мембране.^[9]

Благодаря взаимодействию с Hef1 Chat-H, как было показано, является важным регулятором адгезии лимфоцитов, действуя выше Rap1 в пути активации интегрина.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000095370 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059013 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: SH2D3C SH2-домен, содержащий 3C».
6. Лу И, Браш Дж, Стюарт Т.А. (апрель 1999 г.). «NSP1 определяет новое семейство адаптерных белков, связывающих рецепторы интегрина и тирозинкиназы с сигнальным путем N-концевой киназы / стресс-активируемой протеинкиназы c-Jun». Журнал биологической химии. 274 (15): 10047–52. Дои:10.1074 / jbc.274.15.10047. PMID  10187783.
7. Dodelet VC, Pazzagli C, Zisch AH, Hauser CA, Pasquale EB (ноябрь 1999 г.). «Новый промежуточный сигнальный продукт, SHEP1, напрямую связывает рецепторы Eph с R-Ras и Rap1A». Журнал биологической химии. 274 (45): 31941–6. Дои:10.1074 / jbc.274.45.31941. PMID  10542222.
8. Сакакибара А., Хаттори С. (март 2000 г.). «Chat, адаптерный белок, связанный с Cas / HEF1, который объединяет несколько сигнальных путей». Журнал биологической химии. 275 (9): 6404–10. Дои:10.1074 / jbc.275.9.6404. PMID  10692442.
9. Regelmann AG, Danzl NM, Wanjalla C, Alexandropoulos K (декабрь 2006 г.). «Гемопоэтическая изоформа преобразователя сигнала, связанного с Cas-Hef1, регулирует индуцированную хемокинами передачу сигналов изнутри наружу и транспорт Т-клеток». Иммунитет. 25 (6): 907–18. Дои:10.1016 / j.immuni.2006.09.014. PMID  17174122.

дальнейшее чтение

• Рядом с РИ, Чжан Ю., Маккинье А., Ванден Борре П., Лернер А. (сентябрь 2007 г.). «AND-34 / BCAR3 отличается от других гомологов NSP индукцией устойчивости к эстрогенам, активацией промотора циклина D1 и измененной морфологией клеток рака груди». Журнал клеточной физиологии. 212 (3): 655–65. Дои:10.1002 / jcp.21059. ЧВК  2640322. PMID  17427198.
• Вервурт В.С., Розелли С., Осима Р.Г., Паскуале Э.Б. (апрель 2007 г.). «Варианты сплайсинга и паттерны экспрессии SHEP1, BCAR3 и NSP1, семейства генов, участвующих в передаче сигналов интегрина и рецепторной тирозинкиназы». Ген. 391 (1–2): 161–70. Дои:10.1016 / j.gene.2006.12.016. ЧВК  1876674. PMID  17270363.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Дайл М., Кало М.С., Седдон Дж. А., Коте Дж. Ф., Вуори К., Паскуале Э. Б. (октябрь 2004 г.). «Функция SHEP1 при миграции клеток нарушена единственной аминокислотной мутацией, которая нарушает ассоциацию с каркасным белком cas, но не с Ras GTPases». Журнал биологической химии. 279 (40): 41892–902. Дои:10.1074 / jbc.M402929200. PMID  15272013.
• Сакакибара А., Хаттори С., Накамура С., Катагири Т. (февраль 2003 г.). «Новый гемопоэтический адаптерный белок Chat-H положительно регулирует опосредованное Т-клеточным рецептором производство интерлейкина-2 клетками Jurkat». Журнал биологической химии. 278 (8): 6012–7. Дои:10.1074 / jbc.M207942200. PMID  12486027.
• Сакакибара А., Хаттори С. (март 2000 г.). «Chat, адаптерный белок, связанный с Cas / HEF1, который объединяет несколько сигнальных путей». Журнал биологической химии. 275 (9): 6404–10. Дои:10.1074 / jbc.275.9.6404. PMID  10692442.
• Dodelet VC, Pazzagli C, Zisch AH, Hauser CA, Pasquale EB (ноябрь 1999 г.). «Новый промежуточный сигнальный продукт, SHEP1, напрямую связывает рецепторы Eph с R-Ras и Rap1A». Журнал биологической химии. 274 (45): 31941–6. Дои:10.1074 / jbc.274.45.31941. PMID  10542222.
• Лу И, Браш Дж, Стюарт Т.А. (апрель 1999 г.). «NSP1 определяет новое семейство адаптерных белков, связывающих рецепторы интегрина и тирозинкиназы с сигнальным путем N-концевой киназы / стресс-активируемой протеинкиназы c-Jun». Журнал биологической химии. 274 (15): 10047–52. Дои:10.1074 / jbc.274.15.10047. PMID  10187783.
• Regelmann AG, Danzl NM, Wanjalla C, Alexandropoulos K (декабрь 2006 г.). «Гемопоэтическая изоформа преобразователя сигнала, связанного с Cas-Hef1, регулирует индуцированную хемокинами передачу сигналов изнутри наружу и транспорт Т-клеток». Иммунитет. 25 (6): 907–18. Дои:10.1016 / j.immuni.2006.09.014. PMID  17174122.

внешняя ссылка

• SH2D3C расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• SH2D3C детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.