STIM1 - STIM1

STIM1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSTIM1, D11S4896E, GOK, IMD10, STRMK, TAM, TAM1, молекула взаимодействия стромы 1
Внешние идентификаторыOMIM: 605921 MGI: 107476 ГомолоГен: 20681 Генные карты: STIM1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение STIM1
Геномное расположение STIM1
Группа11п15.4Начинать3,854,527 бп[1]
Конец4,093,210 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE STIM1 202764 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003156
NM_001277961
NM_001277962

NM_009287
NM_001374058
NM_001374060

RefSeq (белок)

NP_033313
NP_001360987
NP_001360989

Расположение (UCSC)Chr 11: 3.85 - 4.09 МбChr 7: 102,27 - 102,44 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Молекула стромального взаимодействия 1 это белок что у людей кодируется STIM1 ген.[5][6][7] STIM1 имеет одиночный трансмембранный домен и локализован на эндоплазматический ретикулум, и в меньшей степени плазматическая мембрана.[8]

Несмотря на то, что белок был идентифицирован ранее, его функция до недавнего времени была неизвестна. В 2005 году было обнаружено, что STIM1 функционирует как датчик кальция в эндоплазматический ретикулум.[9][10] После активации Рецептор IP3, концентрация кальция в эндоплазматическом ретикулуме уменьшается, что воспринимается STIM1 через его EF рука домен. STIM1 активирует "магазинный" ORAI1 кальций ионные каналы в плазматической мембране посредством внутриклеточного движения STIM1, кластеризации под плазматической мембраной и взаимодействия белков с изоформами ORAI.[11][12][13] STIM1-опосредованный вход кальция необходим для тромбин -индуцированная разборка VE-кадгерин прилипает к стыкам.[14] 2-аминоэтоксидифенилборат (2-APB) и 4-хлор-3-этилфенол (4-CEP) вызывают кластеризацию STIM1 в клетке и предотвращают перемещение STIM1 к плазматической мембране.[15]

Взаимодействия

STIM1 был показан взаимодействовать с ORAI1, TMEM110 (STIMATE[16]), SERCA, TMEM66 (SARAF ), и STIM2.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167323 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000030987 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Паркер Н.Дж., Бегли К.Г., Смит П.Дж., Фокс Р.М. (октябрь 1996 г.). «Молекулярное клонирование нового гена человека (D11S4896E) в хромосомной области 11p15.5». Геномика. 37 (2): 253–6. Дои:10.1006 / geno.1996.0553. PMID  8921403.
  6. ^ а б Уильямс РТ, Манджи СС, Паркер Нью-Джерси, Хэнкок М.С., Ван Стекеленбург Л., Эйд Дж. П., старший PV, Казенвадель Дж. С., Шандала Т., Сент Р., Смит П. Дж., Дзиадек М. А. (август 2001 г.). «Идентификация и характеристика семейства генов STIM (молекулы стромального взаимодействия): кодирование нового класса трансмембранных белков». Биохимический журнал. 357 (Pt 3): 673–85. Дои:10.1042/0264-6021:3570673. ЧВК  1221997. PMID  11463338.
  7. ^ Уильямс Р. Т., старший PV, Ван Стекеленбург Л., Лейтон Дж. Э., Смит П. Дж., Дзиадек М. А. (апрель 2002 г.). «Стромальная взаимодействующая молекула 1 (STIM1), трансмембранный белок с активностью супрессора роста, содержит внеклеточный домен SAM, модифицированный N-связанным гликозилированием». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология. 1596 (1): 131–7. Дои:10.1016 / S0167-4838 (02) 00211-X. PMID  11983428.
  8. ^ Соболофф Дж., Ротберг Б.С., Мадеш М., Гилл Д.Л. (сентябрь 2012 г.). «Белки STIM: динамические преобразователи сигналов кальция». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 13 (9): 549–65. Дои:10.1038 / nrm3414. ЧВК  3458427. PMID  22914293.
  9. ^ Роос Дж., ДиГрегорио П.Дж., Еромин А.В., Ольсен К., Лиудино М., Чжан С., Сафрина О., Козак Дж. А., Вагнер С.Л., Кахалан М.Д., Величелеби Г., Стаудерман К.А. (май 2005 г.). «STIM1, важный и консервативный компонент функции канала Ca2 + с хранением». Журнал клеточной биологии. 169 (3): 435–45. Дои:10.1083 / jcb.200502019. ЧВК  2171946. PMID  15866891.
  10. ^ Лиу Дж., Ким М.Л., Хео В.Д., Джонс Дж. Т., Майерс Дж. В., Феррелл Дж. Э., Мейер Т. (июль 2005 г.). «STIM - это датчик Ca2 +, необходимый для притока Ca2 +, вызванного истощением запасов Ca2 +». Текущая биология. 15 (13): 1235–41. Дои:10.1016 / j.cub.2005.05.055. ЧВК  3186072. PMID  16005298.
  11. ^ Putney JW (сентябрь 2009 г.). «Емкостное поступление кальция: от идеи до молекул». Иммунологические обзоры. 231 (1): 10–22. Дои:10.1111 / j.1600-065X.2009.00810.x. PMID  19754887. S2CID  32303982.
  12. ^ Чжоу Ю., Сринивасан П., Разави С., Сеймур С., Меранер П., Гудлур А., Статопулос П. Б., Икура М., Рао А., Хоган П. Г. (август 2013 г.). «Первоначальная активация STIM1, регулятора поступления кальция в магазин». Структурная и молекулярная биология природы. 20 (8): 973–81. Дои:10.1038 / nsmb.2625. ЧВК  3784406. PMID  23851458.
  13. ^ Ма Г, Вэй М, Хэ Л, Лю Ц., Ву Б, Чжан С.Л., Цзин Дж, Лян Х, Сенес А, Тан П, Ли С, Сунь А, Би И, Чжун Л, Си Х, Шен Й, Ли М , Ли М.С., Чжоу В., Ван Дж, Ван И, Чжоу И (17.07.2015). «Передача сигналов Ca (2+) наизнанку вызвана конформационным переключателем STIM1». Nature Communications. 6: 7826. Дои:10.1038 / ncomms8826. ЧВК  4509486. PMID  26184105.
  14. ^ Soni D, Regmi SC, Wang DM, DebRoy A, Zhao YY, Vogel SM, Malik AB, Tiruppathi C (апрель 2017 г.). «Pyk2-фосфорилирование VE-PTP ниже STIM1-индуцированного входа Ca2 + регулирует разборку слипчивых соединений». Американский журнал физиологии. Клеточная и молекулярная физиология легких. 312 (6): L1003 – L1017. Дои:10.1152 / ajplung.00008.2017. ЧВК  5495943. PMID  28385807.
  15. ^ Цзэн Б., Чен Г.Л., Сюй С.З. (октябрь 2012 г.). "Независимые от магазина пути для цитозольной кластеризации STIM1 в регуляции притока Ca (2+), управляемого магазином". Биохимическая фармакология. 84 (8): 1024–35. Дои:10.1016 / j.bcp.2012.07.013. PMID  22842488.
  16. ^ Jing J, He L, Sun A, Quintana A, Ding Y, Ma G, Tan P, Liang X, Zheng X, Chen L, Shi X, Zhang SL, Zhong L, Huang Y, Dong MQ, Walker CL, Hogan PG , Ван И, Чжоу И (август 2015 г.). «Протеомное картирование соединений ER-PM идентифицирует STIMATE как регулятор притока Ca (2+)». Природа клеточной биологии. 17 (10): 1339–47. Дои:10.1038 / ncb3234. ЧВК  4589512. PMID  26322679.