STRN3 - STRN3

STRN3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4N6J
Идентификаторы
Псевдонимы	STRN3, SG2NA, PPP2R6B, стриатин 3, S / G2NA
Внешние идентификаторы	OMIM: 614766 MGI: 2151064 ГомолоГен: 82078 Генные карты: STRN3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q12 Начинать 30,893,799 бп[1] Конец 31,026,401 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 B3 Начинать 51,609,632 бп[2] Конец 51,691,897 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание протеинфосфатазы 2А • GO: 0001948 связывание с белками • связывание кальмодулина • Связывание с повторным доменом броненосца • Связывание Rho GTPase • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • цитоплазма • тело нейрональной клетки • клеточная мембрана • аппарат Гольджи • дендрит • комплекс протеинфосфатазы типа 2А • мембрана • ядро клетки • нуклеоплазма • макромолекулярный комплекс • Комплекс ФАР / СИН / СТРИПАК Биологический процесс • ответ на эстрадиол • отрицательная регуляция внутриклеточного сигнального пути рецептора эстрогена • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	29966	94186
Ансамбль	ENSG00000196792	ENSMUSG00000020954
UniProt	Q13033	Q9ERG2
RefSeq (мРНК)	NM_001083893 NM_014574	NM_001172098 NM_052973 NM_001364437
RefSeq (белок)	NP_001077362 NP_055389	NP_001165569 NP_443205 NP_001351366
Расположение (UCSC)	Chr 14: 30.89 - 31.03 Мб	Chr 12: 51.61 - 51.69 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Стриатин-3 это белок что у людей кодируется STRN3 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

STRN3 был показан взаимодействовать с:

• CTTNBP2NL,^[8]
• CTTNBP2,^[8]
• FAM40A,^[8]
• MOBKL3,^[8]
• PDCD10,^[8]
• PPP2CA,^[8]
• PPP2R1A,^[8]
• РП6-213Н19.1,^[8]
• STK24,^[8][9] и
• STRN.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196792 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020954 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Муро Ю., Чан Е.К., Ландберг Г., Тан Е.М. (март 1995 г.). «Ядерный аутоантиген клеточного цикла, содержащий мотивы WD-40, экспрессируемые в основном в клетках в фазе S и G2». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 207 (3): 1029–37. Дои:10.1006 / bbrc.1995.1288. PMID  7864889.
6. Морено К.С., Парк С., Нельсон К., Эшби Д., Хубалек Ф., Лейн WS, Паллас, округ Колумбия (март 2000 г.). «Повторяющиеся белки WD40, стриатин и ядерный аутоантиген S / G (2) являются членами нового семейства кальмодулин-связывающих белков, которые связаны с протеинфосфатазой 2A». J. Biol. Chem. 275 (8): 5257–63. Дои:10.1074 / jbc.275.8.5257. ЧВК  3505218. PMID  10681496.
7. «Ген Entrez: стриатин STRN3, кальмодулин-связывающий белок 3».
8. Гудро М., Д'Амброзио Л.М., Кин М.Дж., Маллин М.Дж., Ларсен Б.Г., Санчес А., Чаудри С., Чен Г.И., Сичери Ф., Несвижский А.И., Эберсолд Р., Рот Б., Гинграс А.С. (январь 2009 г.). «Сеть взаимодействия с высокой плотностью фосфатазы PP2A идентифицирует новый комплекс фосфатазы и киназы, взаимодействующий со стриатином, связанный с белком кавернозной мальформации 3 головного мозга (CCM3)». Мол. Клетка. Протеомика. 8 (1): 157–71. Дои:10.1074 / mcp.M800266-MCP200. ЧВК  2621004. PMID  18782753.
9. Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3: 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

дальнейшее чтение

• Ландберг Г, Тан Э.М. (1994). «Характеристика ДНК-связывающего ядерного аутоантигена, в основном связанного с S-фазой и клетками G2». Exp. Cell Res. 212 (2): 255–61. Дои:10.1006 / excr.1994.1141. PMID  7910562.
• Кастетс Ф, Ракитина Т., Гайяр С., Мокрич А., Маттей М.Г., Моннерон А. (2000). «Зинедин, SG2NA и стриатин являются кальмодулин-связывающими белками с повторами WD, в основном экспрессируемыми в головном мозге». J. Biol. Chem. 275 (26): 19970–7. Дои:10.1074 / jbc.M909782199. PMID  10748158.
• Морено К.С., Лейн WS, Паллас, округ Колумбия (2001). «Гомолог дрожжевого MOB1 млекопитающего является как членом, так и предполагаемым субстратом комплексов стриатин-протеиновая фосфатаза 2A». J. Biol. Chem. 276 (26): 24253–60. Дои:10.1074 / jbc.M102398200. ЧВК  3503316. PMID  11319234.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кусида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Фостер Л.Дж., Рудич А., Талиор И., Патель Н., Хуанг Х, Фуртадо Л.М., Билан П.Дж., Манн М., Клип А. (2006). «Инсулинозависимые взаимодействия белков с GLUT4, выявленные посредством мечения стабильных изотопов аминокислотами в культуре клеток (SILAC)». J. Proteome Res. 5 (1): 64–75. Дои:10.1021 / pr0502626. PMID  16396496.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.