SUB1 - SUB1

SUB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ПКФ, 2C62, 2PHE, 4USG
Идентификаторы
Псевдонимы	SUB1, P15, PC4, p14, гомолог SUB1, регулятор транскрипции, регулятор транскрипции SUB1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600503 MGI: 104811 ГомолоГен: 38218 Генные карты: SUB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5п13.3 Начните 32,531,633 бп[1] Конец 32,604,079 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 A1 Начните 11,981,339 бп[2] Конец 11,996,983 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание одноцепочечной ДНК • Связывание ДНК • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • идентичное связывание с белками • Последовательно-специфичное связывание двухцепочечной ДНК Сотовый компонент • ядрышко • внеклеточная экзосома • комплекс регуляторов транскрипции • ядро клетки Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • Передача сигнала белка SMAD • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция инициации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10923	20024
Ансамбль	ENSG00000113387	ENSMUSG00000022205
UniProt	P53999	P11031
RefSeq (мРНК)	NM_006713	NM_011294
RefSeq (белок)	NP_006704	NP_035424
Расположение (UCSC)	Chr 5: 32,53 - 32,6 Мб	Chr 15: 11.98 - 12 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Коактиватор транскрипции активированной РНК-полимеразы II p15 также известен как положительный кофактор 4 (ПК4) или SUB1 гомолог это белок что у людей кодируется SUB1 ген.^[5][6][7] Человек SUB1 ген^[7] назван в честь ортологичный ген в дрожжах.^[8]

SUB1 индуцируется окислительный стресс, и участвует в координации клеточных реакций на Разрывы цепи ДНК возникающие после окислительного стресса^[9]. Дрожжи SUB1 имеют структурное и функциональное сходство с человеческими. альфа-синуклеин, белок, который играет важную роль в Болезнь Паркинсона.^[10] Как и SUB1, альфа-синуклеин регулирует Ремонт ДНК включая репарацию двухцепочечных разрывов ДНК.

Взаимодействия

SUB1 был показан взаимодействовать с участием CSTF2.^[11]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113387 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022205 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Kretzschmar M, Kaiser K, Lottspeich F, Meisterernst M (август 1994). «Новый медиатор транскрипции генов класса II, гомологичный вирусным регуляторам немедленной ранней транскрипции». Ячейка. 78 (3): 525–34. Дои:10.1016/0092-8674(94)90429-4. PMID  8062392. S2CID  29077941.
6. Ge H, Roeder RG (август 1994 г.). «Очистка, клонирование и характеристика человеческого коактиватора РС4, который опосредует активацию транскрипции генов класса II». Ячейка. 78 (3): 513–23. Дои:10.1016/0092-8674(94)90428-6. PMID  8062391. S2CID  1140379.
7. «Entrez Gene SUB1: гомолог SUB1 (S. cerevisiae)».
8. Кнаус Р., Поллок Р., Гуаренте Л. (апрель 1996 г.). «Дрожжевой SUB1 является супрессором мутаций TFIIB и имеет гомологию с человеческим коактиватором PC4». Журнал EMBO. 15 (8): 1933–40. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00544.x. ЧВК  450112. PMID  8617240.
9. Ю Л, Ма Х, Джи Х, Фолькерт MR. Ядерный белок Sub1 защищает ДНК от окислительного повреждения. Mol Cell Biochem. 2016 Янв; 412 (1-2): 165-71. DOI: 10.1007 / s11010-015-2621-х. Epub 2015 26 декабря. PMID: 26708217
10. Schaser AJ, Osterberg VR, Dent SE, Stackhouse TL, Wakeham CM, Boutros SW, Weston LJ, Owen N, Weissman TA, Luna E, Raber J, Luk KC, McCullough AK, Woltjer RL, Unni VK. Альфа-синуклеин - это ДНК-связывающий белок, который модулирует восстановление ДНК с последствиями для заболеваний с тельцами Леви. Sci Rep.29 июля 2019; 9 (1): 10919. PMID: 31358782 PMCID: PMC6662836 DOI: 10.1038 / s41598-019-47227-z
11. Кальво О., Мэнли Дж. Л. (май 2001 г.). «Эволюционно консервативное взаимодействие между CstF-64 и PC4 связывает транскрипцию, полиаденилирование и терминацию». Молекулярная клетка. 7 (5): 1013–23. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00236-2. PMID  11389848.

дальнейшее чтение

• Kaiser K, Stelzer G, Meisterernst M (июль 1995 г.). «Коактиватор p15 (PC4) инициирует активацию транскрипции во время образования комплекса TFIIA-TFIID-промотор». Журнал EMBO. 14 (14): 3520–7. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07358.x. ЧВК  394420. PMID  7628453.
• Ge H, Zhao Y, Chait BT, Roeder RG (декабрь 1994 г.). «Фосфорилирование отрицательно регулирует функцию коактиватора PC4». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (26): 12691–5. Дои:10.1073 / pnas.91.26.12691. ЧВК  45505. PMID  7809103.
• Brandsen J, Werten S, van der Vliet PC, Meisterernst M, Kroon J, Gros P (ноябрь 1997 г.). «С-концевой домен кофактора транскрипции PC4 обнаруживает сайт связывания димерной оцДНК». Структурная биология природы. 4 (11): 900–3. Дои:10.1038 / nsb1197-900. PMID  9360603. S2CID  30710386.
• Малик С., Гермах М., Рёдер Р.Г. (март 1998 г.). «Динамическая модель коактиваторной функции PC4 в транскрипции РНК-полимеразы II». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (5): 2192–7. Дои:10.1073 / пнас.95.5.2192. ЧВК  19292. PMID  9482861.
• Ло Й, Гэ Х, Стивенс С., Сяо Х, Родер Р. (июль 1998 г.). «Коактивация OCA-B: определение критических регионов и синергизм с общими кофакторами». Молекулярная и клеточная биология. 18 (7): 3803–10. Дои:10.1128 / mcb.18.7.3803. ЧВК  108964. PMID  9632764.
• Карри Р.А. (июль 1998 г.). «Биохимическая характеристика комплекса факторов транскрипции NF-Y во время развития В-лимфоцитов». Журнал биологической химии. 273 (29): 18220–9. Дои:10.1074 / jbc.273.29.18220. PMID  9660784.
• Ван З., Редер Р.Г. (апрель 1998 г.). «ДНК-топоизомераза I и РС4 могут взаимодействовать с TFIIIC человека, способствуя как точной терминации, так и повторной инициации транскрипции РНК-полимеразой III». Молекулярная клетка. 1 (5): 749–57. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80074-X. PMID  9660958.
• Холлоуэй А.Ф., Оккиодоро Ф., Миттлер Г., Мейстерернст М., Шеннон М.Ф. (июль 2000 г.). «Функциональное взаимодействие между трансактиватором ВИЧ Tat и коактиватором транскрипции PC4 в Т-клетках». Журнал биологической химии. 275 (28): 21668–77. Дои:10.1074 / jbc.M909058199. PMID  10887206.
• Юань С.Х., Герли ВБ (июль 2000 г.). «Потенциальные цели для HSF1 в преинициативном комплексе». Клеточный стресс и шапероны. 5 (3): 229–42. Дои:10.1379 / 1466-1268 (2000) 005 <0229: PTFHWT> 2.0.CO; 2. ЧВК  312889. PMID  11005381.
• Кумар Б.Р., Сваминатан В., Банерджи С., Кунду Т.К. (май 2001 г.). «p300-опосредованное ацетилирование коактиватора транскрипции человека PC4 ингибируется фосфорилированием». Журнал биологической химии. 276 (20): 16804–9. Дои:10.1074 / jbc.M100934200. PMID  11279157.
• Ю П, Хуан Б., Шен М., Лау Ц., Чан Э, Мишель Дж., Сюн Й., Паян Д. Г., Ло И (январь 2001 г.). «p15 (PAF), новый фактор, связанный с PCNA, с повышенной экспрессией в опухолевых тканях». Онкоген. 20 (4): 484–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1204113. PMID  11313979.
• Кальво О., Мэнли Дж. Л. (май 2001 г.). «Эволюционно консервативное взаимодействие между CstF-64 и PC4 связывает транскрипцию, полиаденилирование и терминацию». Молекулярная клетка. 7 (5): 1013–23. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00236-2. PMID  11389848.
• Го Х, Цай CQ, Kuo PC (февраль 2002 г.). «Ядерный фактор гепатоцитов-4альфа опосредует окислительно-восстановительную чувствительность индуцибельной транскрипции гена синтазы оксида азота». Журнал биологической химии. 277 (7): 5054–60. Дои:10.1074 / jbc.M109017200. PMID  11741883.
• Дюбуа Т., Земликова Е., Хауэлл С., Эйткен А. (февраль 2003 г.). «Центаурин-альфа 1 связывает in vitro и in vivo с нуклеолином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 301 (2): 502–8. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 03010-3. PMID  12565890.
• Фукуда А., Токонабэ С., Хамада М., Мацумото М., Цукуи Т., Ноги Ю., Хисатаке К. (апрель 2003 г.). «Облегчение PC4-опосредованной репрессии транскрипции за счет активности геликазы ERCC3 общего фактора транскрипции TFIIH». Журнал биологической химии. 278 (17): 14827–31. Дои:10.1074 / jbc.M213172200. PMID  12590132.
• Свитлицки Э., Иорданов Х., Фрич Ц., Йи Л, Левин М.С., Рубин Д.К. (2003). «Регуляция фактора роста PC4 / TIS7, немедленного раннего гена, экспрессируемого во время адаптации кишечника после резекции». JPEN. Журнал парентерального и энтерального питания. 27 (2): 123–31. Дои:10.1177/0148607103027002123. PMID  12665168.
• Банерджи С., Кумар Б.Р., Кунду Т.К. (март 2004 г.). «Общий коактиватор транскрипции PC4 активирует функцию p53». Молекулярная и клеточная биология. 24 (5): 2052–62. Дои:10.1128 / MCB.24.5.2052-2062.2004. ЧВК  350566. PMID  14966284.
• Caldwell RB, Braselmann H, Schoetz U, Heuer S, Scherthan H, Zitzelsberger H (июль 2016 г.). «Положительный кофактор 4 (PC4) имеет решающее значение для изменения маршрута пути репарации ДНК в клетках DT40». Sci. Представитель. 6: 28890. Дои:10.1038 / srep28890. ЧВК  4931448. PMID  27374870.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P53999 (Коактиватор транскрипции активированной РНК-полимеразы II p15) на PDBe-KB.