Малая ядрышковая РНК TBR12 - Small nucleolar RNA TBR12

snoTBR12
RF02789.svg
Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности малой ядрышковой РНК TBR12
Идентификаторы
РфамRF02789
Прочие данные
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO:,Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

Малая ядрышковая РНК TBR12 это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, идентифицированная в Trypanosoma brucei который функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко из эукариотическая клетка который является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA TBR12 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D направляют сайт-специфичные 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

TBR12 был одной из семнадцати snoRNAs, идентифицированных в Trypanosoma brucei к иммунопреципитация с антителами против фибрилларина.[2] Вместе с TBR4, TBR6 и TBR2 это часть генного кластера мяРНК, которая повторяется тандемно. Эти 4 гена snoRNA транскрибируются как транскрипт полицистронной РНК.[3]

Другие мяРНК

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ а б Данбар Д.А., Вормсли С., Лоу TM, Басерга С.Дж. (май 2000 г.). «Фибрилларин-ассоциированные малые ядрышковые C / D-бокс-РНК в Trypanosoma brucei. Консервация последовательности и значение 2'-O-рибозного метилирования рРНК». Журнал биологической химии. 275 (19): 14767–76. Дои:10.1074 / jbc.m001180200. PMID  10747997.
  3. ^ Данбар Д.А., Чен А.А., Вормсли С., Басерга С.Дж. (август 2000 г.). «Гены малых ядрышковых РНК в Trypanosoma brucei организованы в кластеры и транскрибируются как полицистронная РНК». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (15): 2855–61. Дои:10.1093 / nar / 28.15.2855. ЧВК  102681. PMID  10908346.