Малая ядрышковая РНК TBR2 - Small nucleolar RNA TBR2

snoTBR2
RF02786.svg
Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности малой ядрышковой РНК TBR2
Идентификаторы
РфамRF02786
Прочие данные
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO:,Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

Малая ядрышковая РНК TBR2 это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, идентифицированная в Trypanosoma brucei который функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA TBR2 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D направляют сайт-специфичные 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

TBR2 был одной из семнадцати snoRNAs, идентифицированных в Trypanosoma brucei к иммунопреципитация с антителами против фибрилларина.[2] Вместе с TBR12, TBR6 и TBR4 это часть генного кластера мяРНК, которая повторяется тандемно. Эти 4 гена snoRNA транскрибируются как транскрипт полицистронной РНК.[3]

Другие мяРНК

Рекомендации

  1. ^ Галарди, Сильвия; Фатика, Алессандро; Бачи, Анджела; Скалони, Андреа; Пресутти, Карло; Боццони, Ирен (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ISSN  0270-7306. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ а б Данбар, Д. А .; Wormsley, S .; Lowe, T. M .; Базерга, С. Дж. (12 мая 2000 г.). «Фибрилларин-ассоциированные малые ядрышковые C / D-бокс-РНК в Trypanosoma brucei. Консервация последовательности и значение 2'-O-рибозного метилирования рРНК». Журнал биологической химии. 275 (19): 14767–14776. Дои:10.1074 / jbc.m001180200. ISSN  0021-9258. PMID  10747997.
  3. ^ Данбар Д.А., Чен А.А., Вормсли С., Басерга С.Дж. (август 2000 г.). «Гены малых ядрышковых РНК в Trypanosoma brucei организованы в кластеры и транскрибируются как полицистронная РНК». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (15): 2855–61. Дои:10.1093 / nar / 28.15.2855. ЧВК  102681. PMID  10908346.