Малая ядрышковая РНК TBR7 - Small nucleolar RNA TBR7

Малая ядрышковая РНК TBR7
RF00295.jpg
Идентификаторы
СимволsnoTBR7
РфамRF00295
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; CD-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

Малая ядрышковая РНК TBR7 это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, идентифицированная в Trypanosoma brucei который функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA TBR7 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

TBR7 был одной из семнадцати snoRNAs, идентифицированных в Trypanosoma brucei к иммунопреципитация с антителами против фибрилларина.[2] Предполагается, что он управляет метилированием 2'O рибозозы 18s рибосомная РНК (рРНК).

Вместе с TBR5 и TBR17 он является частью тандемно повторяющегося кластера генов snoRNA, расположенного внутри сплайсированной лидерной РНК (SLA).[3] Гены кластера продуцируются в виде полицистронной РНК.[4]

Смотрите также

Малая ядрышковая РНК TBR2

Рекомендации

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Данбар Д.А., Вормсли С., Лоу TM, Базерга С.Дж. (2000). «Фибрилларин-ассоциированные малые ядрышковые C / D-бокс-РНК в Trypanosoma brucei. Консервация последовательности и значение метилирования 2'-O-рибозы рРНК». J. Biol. Chem. 275 (19): 14767–76. Дои:10.1074 / jbc.M001180200. PMID  10747997.
  3. ^ Робертс, Т. Г .; Sturm, N.R .; Yee, B.K .; Yu, M. C .; Hartshorne, T .; Agabian, N .; Кэмпбелл, Д. А. (август 1998 г.). «Три малых ядрышковых РНК, идентифицированные из локуса сплайсированной лидерной РНК в кинетопластидных простейших». Молекулярная и клеточная биология. 18 (8): 4409–4417. Дои:10.1128 / mcb.18.8.4409. ISSN  0270-7306. ЧВК  109026. PMID  9671450.
  4. ^ Данбар, Д. А .; Chen, A. A .; Wormsley, S .; Базерга, С. Дж. (1 августа 2000 г.). «Гены малых ядрышковых РНК в Trypanosoma brucei организованы в кластеры и транскрибируются как полицистронная РНК». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (15): 2855–2861. Дои:10.1093 / nar / 28.15.2855. ISSN  1362-4962. ЧВК  102681. PMID  10908346.

внешняя ссылка