Малая ядрышковая РНК SNORD45 - Small nucleolar RNA SNORD45

Малая ядрышковая РНК SNORD45
RF00279.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD45
Альт. СимволыU45
РфамRF00279
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U45 (также известен как SNORD45) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U45 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

U45 был изначально клонирован из HeLa клетки и экспрессия подтверждены северный блоттинг.[2] Это связано с snoRNA (MBII-401), идентифицированной у мышей.[3]

В геноме человека есть три очень близких копии snoRNA U45 (называемые U45A, U45B, U45C), расположенные внутри интроны того же гена хозяина.[4]

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (июнь 1996 г.). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК». Клетка. 85 (7): 1077–88. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  3. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК  125495. PMID  11387227.
  4. ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.

внешняя ссылка