Малая ядрышковая РНК SNORD102 - Small nucleolar RNA SNORD102
| Малая ядрышковая РНК SNORD102 | |
|---|---|
 Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности из SNORD102 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | SNORD102 |
| Альт. Символы | U102 |
| Рфам | RF00187 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | Ген; мяРНК; snoRNA; CD-бокс |
| Домен (ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB структуры | PDBe |
snoRNA U102 (также известен как SNORD102) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.
snoRNA U102 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]
U102 был идентифицирован путем компьютерного скрининга интронов рибосомальный белок гены для консервативных мотивов последовательности C / D-бокса и экспрессия, экспериментально подтвержденная северный блоттинг.[2] Он обнаружен в интроне 2 гена рибосомного белка L21. В Коробка H / ACA snoRNA ACA27 находится в одном и том же гене-хозяине в другом интроне.[3]
Предполагается, что U102 управляет метилированием 2'O-рибозы остатка 28S рибосомной РНК (рРНК) G4020.[3]
Рекомендации
- ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–6668. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
- ^ Виталий П., Ройо Х., Зейтц Х., Bachellerie JP, Hüttenhofer A, Cavaillé J (2003). «Идентификация 13 новых управляющих РНК человека». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (22): 6543–51. Дои:10.1093 / нар / gkg849. ЧВК 275545. PMID 14602913.
- ^ а б Лестрейд, Лоран; Вебер, Мишель Дж. (2006). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Приложение 1: Проблема с базой данных): D158 – D162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК 1347365. PMID 16381836.
внешняя ссылка
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |