Малая ядрышковая РНК SNORD47 - Small nucleolar RNA SNORD47
| Малая ядрышковая РНК SNORD47 | |
|---|---|
 Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности из SNORD47 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | SNORD47 |
| Альт. Символы | U47 |
| Рфам | RF00281 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | Ген; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс |
| Домен (ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB структуры | PDBe |
SNORD47 (также известен как U47) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.
snoRNA U57 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]
Эта snoRNA была первоначально клонирована из HeLa клетки и экспрессия подтверждены северный блоттинг.[2]Предполагается, что метилирование 2'O-рибозы в рибосомная РНК (рРНК) 28S по остатку C3866. Ортолог мыши также был клонирован[3]
Эта snoRNA кодируется в интронах тех же генов, что и другие snoRNA C / D-бокса U44, U74, U75, U76, U77, U78, U79, U80 и U81.[4]
Рекомендации
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
- ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (июнь 1996 г.). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК». Клетка. 85 (7): 1077–88. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID 8674114.
- ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК 125495. PMID 11387227.
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК 1347365. PMID 16381836.
внешняя ссылка
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |