Малая ядрышковая РНК SNORD46 - Small nucleolar RNA SNORD46

Малая ядрышковая РНК SNORD46
RF00218.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD46
Альт. СимволыU40
РфамRF00218
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U46 (также известен как SNORD46) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U46 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

U46 кодируется во 2 интроне рибосомальный белок Ген S8 у человека, и предполагается, что он управляет метилированием 2'-O-рибозных остатков на 28S рибосомная РНК (рРНК).[2][3] Гомолог этой мяРНК в Arabidopsis thaliana называется snoZ153.[4] Некоторые человеческие последовательности U40 аннотированы в базе данных последовательностей (Genbank) как U46.

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Николосо М., Ку Л.Х., Мишо Б., Bachellerie JP (июль 1996 г.). «Кодируемые интроном антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников для 2'-O-рибозы метилирования рРНК». Журнал молекулярной биологии. 260 (2): 178–95. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0391. PMID  8764399.
  3. ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.
  4. ^ Чен К.Л., Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю.К., Цюй Л.Х. (май 2003 г.). «Высокое разнообразие snoRNA в растениях: идентификация и сравнительное исследование 120 генов snoRNA Oryza sativa». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (10): 2601–13. Дои:10.1093 / нар / gkg373. ЧВК  156054. PMID  12736310.

внешняя ссылка