Малая ядрышковая РНК SNORD82 - Small nucleolar RNA SNORD82
| Малая ядрышковая РНК SNORD82 | |
|---|---|
 Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности из SNORD82 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | SNORD82 |
| Альт. Символы | U82 |
| Рфам | RF00158 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | Ген; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс |
| Домен (ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB структуры | PDBe |
snoRNA U82 (также известен как SNORD82 или же Z25) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.
snoRNA U82 / Z25 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]
snoRNA U82 была идентифицирована как у людей, так и у мышей:[2] он расположен в пятом интрон из нуклеолин ген у обоих видов. Две дополнительные мяРНК (C / D box snoRNA U20 и H / ACA snoRNA U23) также кодируются в интронах гена нуклеолина.[3]
Предполагается, что U82 руководит метилированием 2'O-рибозы 18S. рибосомная РНК (рРНК) остаток A1678.[3]
Другая, другая snoRNA, названная U82, была предсказана в интронах L3. рибосомальный белок ген (RPL3) у человека и коров.[4] Однако экспрессия этой мяРНК не может быть подтверждена северный блоттинг или же Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР), и ее не следует путать с snoRNA, расположенной в гене нуклеолина.
Рекомендации
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК 134041. PMID 12215523.
- ^ Ребане А, Мецпалу А (Сентябрь 1999 г.). «U82, новая snoRNA, идентифицированная из пятого интрона гена нуклеолина человека и мыши». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1446 (3): 426–30. Дои:10.1016 / S0167-4781 (99) 00093-7. PMID 10524220.
- ^ а б Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК 1347365. PMID 16381836.
- ^ Дуга С., Ассельта Р., Мальковати М., Тенчини М.Л., Рончи С., Симоник Т. (февраль 2000 г.). «Содержащий интрон ген рибосомного белка L3 (RPL3): анализ последовательности и идентификация U43 и двух новых интронных малых ядрышковых РНК». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1490 (3): 225–36. Дои:10.1016 / S0167-4781 (99) 00237-7. PMID 10684968.
внешняя ссылка
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |