Малая ядрышковая РНК SNORD17 - Small nucleolar RNA SNORD17

Малая ядрышковая РНК SNORD17
RF00567.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD17
Альт. СимволыsnoHBI-43
РфамRF00567
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИИДТИ: 0006396 ИДТИ: 0005730
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

SNORD17 (также известен как ГБЖ-43) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая участвует в биогенезе (модификации) других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

ГБЖ-43 относится к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

Эта snoRNA является человеческим ортологом HBI-43 мыши.[2] Предполагается, что HBII-43 руководит метилированием 2'O-рибозы 28s. рибосомная РНК (рРНК) в позиции U3797.[3] Этот остаток (U3797) также считается псевдоуридилированным ( уридин остаток превращается в псевдоуридин ) посредством Коробка H / ACA snoRNA ACA48.[3]

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые, маленькие, не передающие РНК у мышей». Журнал EMBO. 20 (11): 2943–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943. ЧВК  125495. PMID  11387227.
  3. ^ а б Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.

внешняя ссылка